一种鉴定香菇品种的MNP标记法的开发及应用

    公开(公告)号:CN117106941A

    公开(公告)日:2023-11-24

    申请号:CN202210530743.4

    申请日:2022-05-16

    Abstract: 本发明公开了一种鉴定香菇品种的MNP标记法的开发及应用。本发明基于香菇187个菌株基因组重测序数据,筛选得到501个广泛MNP标记位点;通过相关引物设计和对78份香菇商业品种的多重扩增、MNP‑Seq测序,构建了香菇的MNP标记位点数据库。在此基础上进一步筛选187个具有100%检测率的MNP标记位点作为核心MNP标记位点,利用240个菌株的核心位点序列构建系统发育图谱,计算不同谱系间和品种间遗传相似度,据此判断两个品种为不同品种还是相同品种,为不同谱系还是相同谱系。本发明具有重要的应用价值。

    一种水痘-带状疱疹病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790494B

    公开(公告)日:2024-03-22

    申请号:CN202111301065.6

    申请日:2021-11-04

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种水痘‑带状疱疹病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在水痘‑带状疱疹病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定水痘‑带状疱疹病毒并监测变异;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的水痘‑带状疱疹病毒的鉴定和遗传变异检测,对水痘‑带状疱疹病毒的科研和防疫监测均具有重要意义。

    一种金黄色葡萄球菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790488B

    公开(公告)日:2023-12-22

    申请号:CN202111301125.4

    申请日:2021-11-04

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种金黄色葡萄球菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在金黄色葡萄球菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定金黄色葡萄球菌并精细的区分不同的小种;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的金黄色葡萄球菌的鉴定和遗传变异检测,对金黄色葡萄球菌的科研和卫生监测均具有重要意义。

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