公开(公告)号：CN117925600A

公开(公告)日：2024-04-26

申请号：CN202410067026.1

申请日：2024-01-17

Applicant: 中国科学院杭州医学研究所

Inventor： 谭蔚泓 ,  邴涛 ,  武晓秋 ,  张登伟 ,  刘雨晴 ,  谢斯滔

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6869 ,  G01N33/574 ,  G01N33/569 ,  C12N15/11 ,  G16B30/00 ,  G16B35/20

Abstract: 本发明公开了一种RNA核酸适体单轮/寡轮筛选方法。本发明以传统的Cell‑SELEX技术为基础，结合UMI和高通量测序技术，设计了通过单轮/寡轮筛选快速获取RNA核酸适体的方法；并且以人结直肠癌细胞株HCT‑8和小鼠成肌细胞株C2C12作为靶细胞进行了验证，获得了能够识别并结合C2C12细胞的RNA核酸适体和能够识别并结合HCT‑8细胞的RNA核酸适体。本发明对于快速获取靶标的RNA核酸适体并用于各类相关应用如识别、靶向和机制研究具有重要价值，对于肌肉和肠癌相关的生理病理研究和治疗诊断具有重要意义。

公开(公告)号：CN119932028A

公开(公告)日：2025-05-06

申请号：CN202510108133.9

申请日：2025-01-23

Applicant: 中国科学院杭州医学研究所

Inventor： 邴涛 ,  蒋迪 ,  隆振豪 ,  王玲 ,  於晶晶 ,  林恒伊 ,  张明鑫 ,  武晓秋 ,  谭蔚泓

IPC: C12N15/115 ,  G01N33/68 ,  A61K31/7088 ,  A61P35/00

Abstract: 本申请公开了一种CD38分子核酸适体及其应用，属于核酸适体技术领域。本申请要解决的技术问题是：如何实现CD38蛋白的检测。为此本申请提供核酸适体，所述核酸适体可为核酸适体A1、核酸适体A2、核酸适体A3、核酸适体A4和/或核酸适体A5，所述核酸适体A1为包含核苷酸序列是SEQ ID NO:1的核酸分子。本申请筛选获得了与CD38蛋白的结合表位不同于现有CD38单克隆抗体Daratumumab和/或Isatuximab的核酸适体。并且体外结合试验、细胞试验均表明本申请提供的核酸适体与CD38蛋白具有较高的亲和力。本申请提供的核酸适体可有效实现CD38蛋白的检测。

公开(公告)号：CN117925627A

公开(公告)日：2024-04-26

申请号：CN202410067619.8

申请日：2024-01-17

Applicant: 中国科学院杭州医学研究所

Inventor： 谭蔚泓 ,  邴涛 ,  武晓秋 ,  张登伟 ,  刘雨晴 ,  谢斯滔

IPC: C12N15/115 ,  A61K47/54 ,  A61P35/00 ,  G01N33/569 ,  G01N33/574

Abstract: 本发明公开了用于识别并结合人结直肠癌细胞的RNA核酸适体及其应用。本发明提供了用于识别并结合人结直肠癌细胞的成套RNA核酸适体，由SEQ ID No.1至SEQ ID No.5所示5条适体中的全部或部分组成。这些核酸适体是通过以传统的Cell‑SELEX技术为基础，结合UMI和高通量测序技术，设计的单轮/寡轮筛选方法获得的。该方法能够同时得到多种不同靶标的核酸适体，这些核酸适体在正常细胞、不同来源的肿瘤细胞上有不同的结合模式，根据结合模式的不同，可以实现对正常细胞、不同来源肿瘤细胞的分子分型。另外，本发明对于肠癌相关的生理病理研究和治疗诊断具有重要意义。

公开(公告)号：CN119724344A

公开(公告)日：2025-03-28

申请号：CN202411769306.3

申请日：2024-12-04

Applicant: 浙江工业大学 ,  中国科学院杭州医学研究所

Inventor： 於晶晶 ,  梅建萍 ,  邴涛 ,  冯树维 ,  王玲 ,  蒋迪 ,  林恒伊

IPC: G16B25/10 ,  C12Q1/6886 ,  G16H50/20

Abstract: 本发明涉及一种基于核酸适体差异分析的膀胱癌精细分型方法及系统，该方法包括：通过探针包对包含膀胱癌细胞的样本进行孵育，并对孵育后的样本进行高通量基因测序，获得测序数据；对所述测序数据进行异常样本去除，获得核酸适体数据；将所述核酸适体数据进行标准化处理，获得包括健康样本组和病例样本组的标准数据；由所述标准数据选择差异表达适体；通过所述差异表达适体对待测样本进行分型。本发明能够识别出膀胱癌细胞中特定核酸适体的表达差异，进而实现精细的分型。

公开(公告)号：CN119552873A

公开(公告)日：2025-03-04

申请号：CN202411713788.0

申请日：2024-11-27

Applicant: 浙江工业大学 ,  中国科学院杭州医学研究所

Inventor： 王玲 ,  邴涛 ,  王芳 ,  於晶晶 ,  蒋迪 ,  岑佳盈 ,  尹文娟 ,  苏丹

IPC: C12N15/115 ,  G01N33/569 ,  A61K47/54 ,  A61K48/00 ,  A61P35/00 ,  A61P35/02

Abstract: 本申请公开了食管鳞癌细胞核酸适体的筛选及其应用，属于核酸技术领域。本申请要解决的技术问题是：如何获得特异性靶向食管鳞癌细胞的核酸适体，并用于制备识别、诊断食管鳞癌或食管鳞癌细胞的试剂。为解决该技术问题，本申请提供核酸适体ESCwl‑7a、ESCwl‑68a或ESCwl‑75a及其组成的组合物。本申请筛选得到的核酸适体具备免疫原性低、易于修饰标记、性质稳定且重现性好的特点；相较于抗体，稳定性良好，合成成本低。后续可通过对核酸适体的性质进行进一步的表征和靶标的鉴定，有助于探索和发现肿瘤标志物。同时核酸适体可作为高效且穿透力强的分子探针工具用于肿瘤的早期诊断，也可结合药物进行肿瘤靶向治疗。

公开(公告)号：CN119552874A

公开(公告)日：2025-03-04

申请号：CN202411738404.0

申请日：2024-11-29

Applicant: 中国科学院杭州医学研究所

Inventor： 邴涛 ,  冯树维 ,  於晶晶 ,  徐一鹏 ,  张明鑫 ,  林恒伊 ,  武晓秋 ,  王华 ,  隆振豪 ,  谭蔚泓

IPC: C12N15/115 ,  G01N33/574 ,  A61K31/7088 ,  A61P13/10 ,  A61P35/00 ,  A61K47/54

Abstract: 本申请公开了用于多参数膀胱癌细胞精准分子分型的核酸适体及其应用，属于生物技术领域。本申请要解决的技术问题是：如何实现临床中膀胱癌的早期精准诊断以及膀胱癌的分子分型。为解决该技术问题，本申请包括核酸适体Seq12a、BCfsw1‑3a、BCfsw1‑4a、BCfsw1‑10a、BCfsw2‑19a、BCfsw2‑19a在内的核酸适体及其组成的组合物。本申请针对膀胱癌不同级别细胞筛选以及膀胱癌临床尿液样本进行核酸适体的筛选，得到了涵盖不同类型膀胱癌信息的核酸适体组，在膀胱癌细胞及正常细胞系上实现了细胞分子分型，并将其初步应用于临床尿液样本分子分型上以及进行膀胱癌复发病程监控。

公开(公告)号：CN117925626A

公开(公告)日：2024-04-26

申请号：CN202410067029.5

申请日：2024-01-17

Applicant: 中国科学院杭州医学研究所

Inventor： 谭蔚泓 ,  邴涛 ,  武晓秋 ,  张登伟 ,  刘雨晴 ,  谢斯滔

IPC: C12N15/115 ,  A61K47/54 ,  A61P35/00 ,  G01N33/569 ,  G01N33/574

Abstract: 本发明公开了用于识别并结合小鼠成肌细胞的RNA核酸适体及其应用。本发明提供了用于识别并结合小鼠成肌细胞的成套RNA核酸适体，由SEQ ID No.1至SEQ ID No.6所示6条适体中的全部或部分组成。这些核酸适体是通过以传统的Cell‑SELEX技术为基础结合UMI和高通量测序技术设计的单轮/寡轮筛选方法获得的。该方法能够同时得到多种不同靶标的核酸适体，这些核酸适体在正常细胞、不同来源的肿瘤细胞上有不同的结合模式，根据结合模式的不同，可以实现对正常细胞、不同来源肿瘤细胞的分子分型。另外，本发明对于肌肉相关的生理病理研究和治疗诊断具有重要意义。