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公开(公告)号：CN113096741A
公开(公告)日：2021-07-09
申请号：CN202110414199.2
申请日：2021-04-16
Applicant: 南京林业大学
IPC: G16B40/30 , G16B20/20 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种分析松材线虫种群遗传多样性的方法，先收集来自于不同地理位置的松材线虫虫株，提取其DNA并进行高通量测序；利用自主参与编写的生物信息学软件分析全基因组信息，得到各种SNPs数据及基因型类型，获知松材线虫体内SNPs位点分布情况，进行聚类分析，筛选获得特异性SNP位点。本申请通过聚类分析可将这各虫株分为三类：其中四川省虫株单独聚为A类，广东省有两株虫株分为B类，其余6株虫株分为C类。并且焦磷酸测序结果显示GD位点可将C类虫株与其他两类分开。广东省和四川省松材线虫遗传多样性较高；为推测松材线虫病的传播途径提供了理论基础。
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