公开(公告)号：CN115798594A

公开(公告)日：2023-03-14

申请号：CN202211567334.8

申请日：2022-12-07

Applicant: 厦门大学

Inventor： 方韩 ,  俞容山

IPC: G16B40/00 ,  G16B30/00 ,  G06F18/2415 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了一种基于RNA测序的癌症溯源方法，包括以下步骤：S1、获取癌症数据中的TCGAFRESH数据、TCGAFFPE数据和TCGAMETASTATIC数据，并对癌症数据进行预处理；S2、基于transformer模型搭建癌症溯源网络模型；S3、采用预处理后的TCGAFRESH数据，对癌症溯源网络模型进行训练，得到训练后的癌症溯源网络模型；S4、将预处理后的TCGAFFPE数据和TCGA METASTATIC数据作为测试数据，将两个测试数据集分别送入训练后的癌症溯源网络模型中，对癌症进行分类溯源；本发明将transformer模型应用到了两万维RNA测序数据上，且可以使用所有的基因作为输入，不会存在基因筛选导致的丢失原始基因信息的问题，可有效提高癌症溯源分类的精确度。