一种基于生成对抗网络的单细胞RNA序列缺失值填补方法

    公开(公告)号:CN114187966A

    公开(公告)日:2022-03-15

    申请号:CN202111509958.X

    申请日:2021-12-10

    Abstract: 一种基于生成对抗网络的单细胞RNA序列缺失值填补方法,它属于生物信息领域。本发明解决了采用现有方法对缺失数据填补的准确率低的问题。本发明通过生成对抗网络对RNA序列缺失值进行填补,在生成器部分,引入由DrImpute填补完成的数据作为方向约束,在使用自编码器生成缺失值的同时,在损失函数中加入方向约束项,并对解码层给予了一个Relu激活函数来解决填补后的数据出现负值的情况。实验证明,采用本发明的方法可以显著提高数据填补的准确率。本发明可以应用于对RNA序列缺失值进行填补。

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