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公开(公告)号：CN115125324A
公开(公告)日：2022-09-30
申请号：CN202210711093.3
申请日：2022-06-22
Applicant: 海南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于评估被白粉菌侵染的叶片中病原菌RNA比例的引物及方法。本发明使用两对新的引物(EqP21001、EqP21002)对橡胶树白粉菌不同侵染阶段的cDNA样本进行PCR扩增，并通过ImageJ软件对PCR所得凝胶电泳图进行灰度分析。结果显示，EqP21002引物最适用于评估橡胶树白粉菌侵染橡胶树叶片不同阶段RNA相对含量，EqP21001次之。相较于转录组测序等方法，本发明通过半定量PCR分析建立了一种简便快捷的评估方法用来检测橡胶树白粉菌侵染橡胶树叶片过程中RNA的比例，为进一步探索橡胶树白粉菌与寄主的互作过程提供便利。
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公开(公告)号：CN119287073A
公开(公告)日：2025-01-10
申请号：CN202411845598.4
申请日：2024-12-16
Applicant: 海南大学三亚南繁研究院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于检测暹罗炭疽菌和果生炭疽菌的特异性引物组以及与之对应的快速检测这两种炭疽菌的双重PCR方法，该引物组的序列如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.4所示。本发明的方法可广泛用于检测多种寄主来源的暹罗炭疽菌（Colletotrichum siamense）和果生炭疽菌（Colletotrichum fructicola），而且该方法在操作过程中无需借助多基因系统发育分析以及致病性测定等方法来进行分析鉴定，这极大地节省了时间、人力以及成本。此外，本发明的特异性引物组还具备特异性强、稳定性好和灵敏度高的特点，进一步提升了本发明在检测这两种炭疽菌方面的应用价值。
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公开(公告)号：CN113362901B
公开(公告)日：2023-09-01
申请号：CN202110524893.X
申请日：2021-05-14
Applicant: 海南大学
Abstract: 本发明提供一种快速进行全基因组注释区间比较的方法及系统，该方法包括：S1、分别获取基因注释区间A片段坐标集合以及基因注释区间B片段坐标集合；S2、将A片段集合坐标和B片段集合坐标进行合并，获得合并片段集合；S3、对合并片段集合进行去冗余操作和排序操作；S4、调用预设区间交集函数在单次循环中计算合并片段集合中所有注释区间之间的交集；S5、输出预设区间交集函数的计算结果。本发明能够快速计算不同类型基因注释区间的交集，与传统比较方法相比，实现逻辑简单，计算量小且判断准确，有助于提高比较效率。
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公开(公告)号：CN115125324B
公开(公告)日：2023-05-05
申请号：CN202210711093.3
申请日：2022-06-22
Applicant: 海南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于评估被白粉菌侵染的叶片中病原菌RNA比例的引物及方法。本发明使用两对新的引物(EqP21001、EqP21002)对橡胶树白粉菌不同侵染阶段的cDNA样本进行PCR扩增，并通过ImageJ软件对PCR所得凝胶电泳图进行灰度分析。结果显示，EqP21002引物最适用于评估橡胶树白粉菌侵染橡胶树叶片不同阶段RNA相对含量，EqP21001次之。相较于转录组测序等方法，本发明通过半定量PCR分析建立了一种简便快捷的评估方法用来检测橡胶树白粉菌侵染橡胶树叶片过程中RNA的比例，为进一步探索橡胶树白粉菌与寄主的互作过程提供便利。
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公开(公告)号：CN113362901A
公开(公告)日：2021-09-07
申请号：CN202110524893.X
申请日：2021-05-14
Applicant: 海南大学
Abstract: 本发明提供一种快速进行全基因组注释区间比较的方法及系统，该方法包括：S1、分别获取基因注释区间A片段坐标集合以及基因注释区间B片段坐标集合；S2、将A片段集合坐标和B片段集合坐标进行合并，获得合并片段集合；S3、对合并片段集合进行去冗余操作和排序操作；S4、调用预设区间交集函数在单次循环中计算合并片段集合中所有注释区间之间的交集；S5、输出预设区间交集函数的计算结果。本发明能够快速计算不同类型基因注释区间的交集，与传统比较方法相比，实现逻辑简单，计算量小且判断准确，有助于提高比较效率。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119287073B
公开(公告)日：2025-04-11
申请号：CN202411845598.4
申请日：2024-12-16
Applicant: 海南大学三亚南繁研究院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于检测暹罗炭疽菌和果生炭疽菌的特异性引物组以及与之对应的快速检测这两种炭疽菌的双重PCR方法，该引物组的序列如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.4所示。本发明的方法可广泛用于检测多种寄主来源的暹罗炭疽菌（Colletotrichum siamense）和果生炭疽菌（Colletotrichum fructicola），而且该方法在操作过程中无需借助多基因系统发育分析以及致病性测定等方法来进行分析鉴定，这极大地节省了时间、人力以及成本。此外，本发明的特异性引物组还具备特异性强、稳定性好和灵敏度高的特点，进一步提升了本发明在检测这两种炭疽菌方面的应用价值。
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公开(公告)号：CN116004670B
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202211164033.0
申请日：2022-09-23
Applicant: 海南大学
Abstract: 本发明提供一种炭疽菌CsCyp51G1基因及应用，基因含有3个内含子，含有一个P450结构域，1个跨膜区域。实验证实了该基因高表达可提高真菌对咯菌腈等吡咯类药剂抗性，该基因缺失可降低真菌对咯菌腈等吡咯类药剂抗性，说明CsCyp51G1基因可应用于调控真菌对吡咯类药剂的抗性，CsCyp51G1基因可以作为吡咯类药物靶标。
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公开(公告)号：CN116004670A
公开(公告)日：2023-04-25
申请号：CN202211164033.0
申请日：2022-09-23
Applicant: 海南大学
Abstract: 本发明提供一种炭疽菌CsCyp51G1基因及应用，基因含有3个内含子，含有一个P450结构域，1个跨膜区域。实验证实了该基因高表达可提高真菌对咯菌腈等吡咯类药剂抗性，该基因缺失可降低真菌对咯菌腈等吡咯类药剂抗性，说明CsCyp51G1基因可应用于调控真菌对吡咯类药剂的抗性，CsCyp51G1基因可以作为吡咯类药物靶标。
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公开(公告)号：CN114540402A
公开(公告)日：2022-05-27
申请号：CN202210024889.1
申请日：2022-01-11
Applicant: 海南大学
IPC: C12N15/80 , C12N15/65 , C12Q1/6897 , C12N1/15 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种检测橡胶树白粉菌遗传转化效率的方法，所述方法包括如下步骤：将重组丝状真菌接种至橡胶树古铜期叶片上进行培养后喷施潮霉素B进行筛选，取发病叶片连同菌丝用GUS染色液进行染色，被染成蓝色的菌丝所对应的重组丝状真菌即为转化成功的转化子。本发明提供了一种可用于转化橡胶树白粉菌等丝状真菌且可用于评估橡胶树白粉菌转化体系转化效率的重组质粒，此重组质粒携带由橡胶树白粉菌核糖体蛋白编码基因RP60启动子序列融合GUS基因序列的重组报告基因。使用此重组质粒转化橡胶树白粉菌时，可对转化后获得的转化子菌丝进行简单的GUS染色来判断报告基因是否转化成功，相比以往传统检测转化子的方法检测效率更高。
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公开(公告)号：CN114540401A
公开(公告)日：2022-05-27
申请号：CN202210013027.9
申请日：2022-01-06
Applicant: 海南大学
IPC: C12N15/80
Abstract: 本发明公开了一种用于橡胶树白粉菌遗传转化的多菌灵抗性筛选标记，属于生物技术领域。本发明提供了一种可用于橡胶树白粉菌等丝状真菌遗传转化的多菌灵抗性筛选载体，具体使用重组质粒转化至橡胶树白粉菌，转化成功的橡胶树白粉菌产生多菌灵抗性基因，应用此多菌灵抗性基因作为橡胶树白粉菌遗传转化筛选标记。重组质粒包含第一酶切位点、第二酶切位点、橡胶树白粉菌RP60基因启动子、β‑Tub(E198A)突变基因、终止子和抗性基因。使用此重组质粒转化橡胶树白粉菌时，可用多菌灵对转化后的转化子进行筛选，转化成功的重组白粉菌可产生多菌灵抗性。该筛选标记的开发应用解决了橡胶树白粉菌转化的筛选标记问题。
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