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公开(公告)号:CN112662795B
公开(公告)日:2023-12-15
申请号:CN202110102724.7
申请日:2021-01-26
Applicant: 苏州系统医学研究所
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/70 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于感染性病原体检测的阳性对照品及其制备方法与应用,包括第一、第二阳性对照品,第一阳性对照品中病原体包括革兰氏阳性菌发酵乳杆菌、芽孢梭菌、枯草芽孢杆菌、表皮葡萄球菌、威尔斯李斯特菌、革兰氏阴性荧光假单胞菌、产气克雷伯菌、大肠埃希氏杆菌;真菌黑曲霉、酿酒酵母及噬菌体T1,第二阳性对照品中病原体核酸包括细菌表皮葡萄球菌、真菌黑曲霉、病毒单纯疱疹病毒、噬菌体T1、病毒腺相关病毒、病毒轮状病毒、病毒呼吸道合胞病毒、病毒水疱性口炎病毒、噬菌体MS2。本发明提供了方便、安全、直接可用的双重对照标准品,同时从不同角度进行阳性标准对照,确保了感染性疾病宏基因组检测流程的准确性和稳定性。
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公开(公告)号:CN119479801A
公开(公告)日:2025-02-18
申请号:CN202411600997.4
申请日:2024-11-11
Applicant: 苏州系统医学研究所 , 中国医学科学院医学生物学研究所
Abstract: 本说明书公开了一种针对囊膜病毒表面抗原稳定突变位点的数据预测方法。所述方法包括:获取目标病毒的抗原蛋白对应的蛋白质序列数据;根据蛋白质序列数据,在蛋白质序列上的每个位点中预测出在目标病毒发生突变的过程中保持非稳定状态的各位点,作为第一候选位点,在蛋白质序列上的每个位点中预测出位于口袋区域中的各位点,作为第二候选位点,以及,在蛋白质序列上的每个位点中确定出能够与作用目标病毒的抗原蛋白的抗体发生结合的各位点,作为第三候选位点;根据第一候选位点、第二候选位点以及第三候选位点,确定蛋白质序列上的目标位点并执行任务。本方案可以准确的预测出既不影响抗原蛋白质免疫原性,又能保证抗原稳定的关键突变位点数据。
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公开(公告)号:CN119479802A
公开(公告)日:2025-02-18
申请号:CN202510032739.9
申请日:2025-01-09
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本说明书公开了一种针对RNA病毒关键变异位点的数据预测方法及装置,具体包括:根据获取到的目标病毒对应的历史病毒进化数据,构建出目标病毒对应的病毒进化分支树。针对目标病毒基因序列中的每一个核苷酸位点来说,基于病毒进化分支树,确定出该核苷酸位点对应的第一突变概率和第二突变概率。根据目标病毒的各核苷酸位点对应的第一突变概率和第二突变概率,确定出目标病毒基因序列中的关键变异位点。通过此方法可以有效,有效提高针对病毒基因序列中关键变异位点的发现效率,节省所花费的时间成本和资源消耗,进而间接使得后续针对基因序列中关键变异位点进行疫苗或药物的研发效率也获得了显著提升,保障了人民群众的身体健康和生命安全。
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公开(公告)号:CN119446257A
公开(公告)日:2025-02-14
申请号:CN202510032740.1
申请日:2025-01-09
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本说明书公开了一种基于高通量测序数据的病毒数据处理方法,服务器可以通过神经网络模型,对原始测序数据进行分析,以利用原始测序数据中包含的信息,确定出目标样本中所含各病毒归属的各病毒谱系,进而可以基于神经网络模型输出的目标样本中所含各病毒归属的各病毒谱系,对目标样本进行基于高通量测序数据的病毒数据处理,以提升基于高通量测序数据的病毒数据处理的效率以及准确性。
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公开(公告)号:CN119092141A
公开(公告)日:2024-12-06
申请号:CN202411573695.2
申请日:2024-11-06
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本说明书公开了一种针对流感病毒抗原关系的数据预测方法及装置,所述方法包括:读取各样本毒株对的毒株数据,针对每个样本毒株对,该样本毒株对中对应有两个不同的毒株。针对每个样本毒株对,根据该样本毒株对对应的毒株数据,确定该样本毒株对的病毒特征数据。然后,确定该样本毒株对的中和率,根据中和率以及确定出的目标评估阈值,确定该样本毒株对的实际抗原关系。同时,将各样本毒株对的病毒特征数据输入到待训练的预测模型中,得到针对各样本毒株对的预测抗原关系。然后,根据各样本毒株对的预测抗原关系与各样本毒株对的实际抗原关系之间的偏差,确定损失值,对预测模型进行训练,以通过训练后的预测模型进行抗原关系预测。
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公开(公告)号:CN112662795A
公开(公告)日:2021-04-16
申请号:CN202110102724.7
申请日:2021-01-26
Applicant: 苏州系统医学研究所
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6895 , C12Q1/70 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于感染性病原体检测的阳性对照品及其制备方法与应用,包括第一、第二阳性对照品,第一阳性对照品中病原体包括革兰氏阳性菌发酵乳杆菌、芽孢梭菌、枯草芽孢杆菌、表皮葡萄球菌、威尔斯李斯特菌、革兰氏阴性荧光假单胞菌、产气克雷伯菌、大肠埃希氏杆菌;真菌黑曲霉、酿酒酵母及噬菌体T1,第二阳性对照品中病原体核酸包括细菌表皮葡萄球菌、真菌黑曲霉、病毒单纯疱疹病毒、噬菌体T1、病毒腺相关病毒、病毒轮状病毒、病毒呼吸道合胞病毒、病毒水疱性口炎病毒、噬菌体MS2。本发明提供了方便、安全、直接可用的双重对照标准品,同时从不同角度进行阳性标准对照,确保了感染性疾病宏基因组检测流程的准确性和稳定性。
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