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公开(公告)号：KR102222002B1
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：KR1020190112926
申请日：2019-09-11
Applicant: 충남대학교산학협력단
IPC: G01N33/574 , G01N33/68 , G16B40/10
Abstract: 표적당단백질의부위특이적당쇄화정보는질병진단에고민감도바이오마커를제공할수 있다. 일반적으로부위특이적당쇄화분석은두 가지다른방법, 즉트립신소화를이용한프로테옴접근과탠덤 MS를이용한프로테옴접근또는프로네이즈소화를이용한글리코믹스접근방식으로수행되었다. 그러나기존의두 가지접근방식의데이터처리와해석은어렵고지루하며시간이많이소요되었다. 따라서다량의임상시료세트에대해높은고민감도와고특이성을나타내는용이하고직접적인방법이요구되어왔다. 본발명에서는표적혈청합토글로빈(Hp)을위한중간-상하향글라이코프로테옴방법을발명하여비교적간단한시료준비와데이터처리및 해석방법으로임상시료를분석하여위암바이오마커를발견하였다. 트립신이생성하는 Hp의글라이코폼은펩타이드순서에따라 3개의당펩타이드군으로분류할수 있으며, 각각 3개군에서 10, 15, 14개의잠재적바이오마커(p
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公开(公告)号：KR101825647B1
公开(公告)日：2018-02-09
申请号：KR1020170008409
申请日：2017-01-18
Applicant: 충남대학교산학협력단 , (주)글라이칸
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/6893 , G01N33/6848 , G01N2560/00 , G01N2800/50
Abstract: 과제: 단백질의당쇄화는체내외환경변화에매우민감하여암을포함한다양한질병에직접적으로관련되어진단시스템에활용하려는연구가진행되고있다. 당사슬을이용한질병진단방법은매우효율적이나, 당사슬을분리하여진단에사용할경우시료전처리, 질량분석및 데이터처리에많은시간과노력이요구되고원하지않는인공조성물이생성될수 있다. 해결수단: 이를최소화하고자당쇄화된단백질을있는그대로분석하여암진단에적용하는새로운암진단분석방법을발명하였다. 본발명에서는다량체구조의햅토글로빈의이황화결합을절단하여알파사슬과베타사슬로분리한후 전분자량을측정함으로써베타사슬의당쇄화패턴을분석하였다. 당사슬을분리하지않고이황화결합절단이라는최소한의전처리만수행한후 10분이내의짧은질량분석시간소요및 신속한데이터처리를통해단백질의당쇄화패턴을인식함으로써질병진단시빠르고정확한진단방법으로활용할수 있다.
Abstract translation: 挑战：蛋白质糖基化对人体环境的变化非常敏感，正在进行的研究将其直接用于诊断系统中的各种疾病，包括癌症。 使用寡糖来诊断疾病是非常有效的，但是当分离寡糖并用于诊断时，样品制备，质量分析和数据处理需要很多时间和精力，并且可以生产不需要的人造组合物。 解决方案：为了尽量减少这种情况，我们发明了一种新的癌症诊断分析方法，可以将糖基化蛋白原样分析并应用于癌症诊断。 在本发明中，糖基化的β链的分析模式被切断，由α链和由前测定分子量的一对触觉循环赛切换块状体组合物中的β链二硫键分离。 不通过执行切割的仅有最小预处理之后识别通过二硫键的蛋白质的糖基化模式中删除该低聚糖需要10分钟或更少的短质谱时间和快速的数据处理可以作为一个快速和准确的诊断时的疾病的诊断。
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公开(公告)号：KR101754752B1
公开(公告)日：2017-07-06
申请号：KR1020150038222
申请日：2015-03-19
Applicant: 충남대학교산학협력단
Abstract: 본발명은당단백질에서당사슬다양성을포함한당자리위치를확인하고분석하는방법에관한것으로서, 좀더 자세히는바이오의약품등으로이용되는당단백질을단백질분해효소를이용하여 N-당펩타이드와 O-당펩타이드로분리할수 있는분석법에관한것이다. 본발명의방법은다중화분해효소를처리하고및 특정분자량추출법(Molecular Weight Cut Off filtration)을이용하여당펩타이드를생성하고, 이를분리하여 N-당펩타이드와 O-당펩타이드의동시분석이가능하며, 인접한당자리도완벽히분리하여확인할수 있다. 본발명의분석방법에따라얻어진결과를이용하여당단백질의약품에서당자리에따른당사슬의조성및 정량정보를나타내는당단백질의약품의 2D 도식도를제작할수 있다.
Abstract translation: 使用每N-蛋白酶蛋白生物制药肽和每个糖肽O-用作这种本发明中，更详细地涉及一种方法，以确定和分析的数位位置的糖包括糖蛋白糖链的多样性 以及分离它们的方法。 本发明的复用处理和降解酶的方法，和通过使用特定的提取方法（分子量截留过滤）产生每分子量的肽，以及以分离它允许肽和同时分析的肽的每O- N-和糖， 相邻的派对座位也可以完全隔离。 可以产生每表示的糖链组合物，并根据通过使用根据本发明的分析方法得到的结果在糖蛋白药物每个数字的信息量的蛋白质药物图二维示意图。
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公开(公告)号：KR101743969B1
公开(公告)日：2017-06-08
申请号：KR1020160033435
申请日：2016-03-21
Applicant: 충남대학교산학협력단
Abstract: 해결하려는과제: 바이오의약품생산공정등에서실시간으로빠르게당사슬을스크리닝할수 있는방법이필요하다. 과제해결방법: 본발명은당단백질의전분자량또는당사슬제거후 단백질의분자량측정을통해당사슬의조성과당사슬변이체를포함한다양성및 각당자리점유율, 당쇄화유무, 당사슬질량값함유율까지실시간으로확인할수 있는당쇄화모니터링방법을제공한다.
Abstract translation: 需要解决的挑战：需要有一种方法可以在生物制药生产过程中实时快速筛选低聚糖。 技术方案方法：本发明是实时变化和gakdang座椅占用来检查，糖基化或没有，寡糖类价值的内容，其中包括去除糖蛋白的蛋白质后，通过分子量测定整个分子量或寡糖的寡糖突变体的糖链组合物 从而提供一种糖链监控方法。
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公开(公告)号：KR101734863B1
公开(公告)日：2017-05-16
申请号：KR1020150107823
申请日：2015-07-30
Applicant: 충남대학교산학협력단
Abstract: 본발명은당단백질의부위-특이적 O-당펩타이드생성및 분석방법에관한것으로서, 좀더 구체적으로는비특이적단백질분해효소처리를이용하여 O-당펩타이드를생성하여당사슬이결합된위치를확인할수 있을뿐 아니라당자리에결합된당사슬의종류, 당사슬변이체및 당사슬의구조를포함한 O-당사슬의다양성을정량적으로프로파일링할 수있는분석방법에관한것이다. 본발명은종래β-제거를통한 O-당사슬다양성분석방법에비하여시료처리시간이짧고, 생성된 O-당펩타이드는펩타이드길이가짧아질량분석기적용이용이하다.
Abstract translation: 本发明是一种糖蛋白的部分 - 只能得到证实，并且更特别的euroneun以产生每使用处理的糖链结合位点相关的每一个特定的O-肽生成和分析方法O-肽的非特异性蛋白酶 糖链的类型结合到每个点为好，以定量分析糖链变体和分析方法中的各种O-糖链，包括糖链的结构的。 本发明是相对于除去经由常规β-的O-寡糖多样性分析的样品处理时间短，所得到的肽 - 每-O-是施加用于肽质谱仪的长度越短。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR101456096B1
公开(公告)日：2014-11-03
申请号：KR1020130036748
申请日：2013-04-04
Applicant: 충남대학교산학협력단
CPC classification number: G01N33/66 , G01N2030/8822
Abstract: 본 발명은 인간 혈청 N-당쇄 지도, 인간 혈청 N-당쇄 라이브러리 및 이를 이용하여 혈청 시료를 검증하는 방법에 관한 것이다. 정상인과 환자의 혈청시료 200여 개로부터 당쇄를 분리하여 분석한 결과, 정상인과 환자 모두에게서 100% 발견되는 18개의 기본 당쇄를 찾아내었다. 이 기본 당쇄 18종의 존재는 인간 혈청시료가 채취 및 처리과정에서 문제가 없음을 검증하는데 이용될 수 있다.
또한, 본 발명자들은 인간 혈청 단백질의 N-당쇄는 이론적으로는 가능한 당쇄 종류가 매우 많지만, 실제로 N-당쇄는 도 3에 나타낸 것과 같은 구조만이 존재함을 밝혔으며, 존재하는 구조의 N-당쇄들의 출현 백분율을 밝힘으로써 출현 확률이 낮은 N-당쇄들을 특정 질환의 마커로 사용할 수 있음을 밝혔다.-
公开(公告)号：KR1020130114407A
公开(公告)日：2013-10-18
申请号：KR1020120036738
申请日：2012-04-09
Applicant: 충남대학교산학협력단
CPC classification number: C07H1/06 , C12Y305/01052 , G01N27/62 , G01N2400/10 , H01J49/26
Abstract: PURPOSE: A method for selectively isolating a cell membrane for detecting sugar chains contained in the cell membrane by mass spectroscopy is provided to effectively isolate the cell membrane and to enhance sensitivity and accuracy in sugar chain analysis. CONSTITUTION: A method for selectively isolating a cell membrane for detecting sugar chains contained in the cell membrane by mass spectroscopy comprises the steps of: adding a stabilizing buffer solution to cells, which contains sodium hydrate and/or potassium hydroxide, a protease inhibitor, and sugar and does not contain a surfactant and a chelating agent; treating the container containing the buffer solution and the cells on the ice by ultrasonic waves and destructing the cells; centrifuging the cell lysate and removing a nuclear fraction and residues; adding the buffer solution to the supernatant; ultracentrifuging the supernatant mixture and removing a cytoplasmic fraction; resuspending the precipitate in a Na2CO3 solution (pH 11) and destroying microsome; ultracentrifuging the secondary mixture twice and removing the supernatant containing the cytoplasmic fraction; and isolating a cell membrane fraction.
Abstract translation: 目的：提供用于通过质谱法选择性分离用于检测细胞膜中所含糖链的细胞膜的方法，以有效地分离细胞膜并提高糖链分析的灵敏度和准确性。 构成：用于通过质谱法选择性分离用于检测细胞膜中所含糖链的细胞膜的方法包括以下步骤：将稳定缓冲溶液加入含有水合钠和/或氢氧化钾的蛋白酶抑制剂和 糖，不含表面活性剂和螯合剂; 通过超声波处理含有缓冲溶液的容器和冰上的细胞并破坏细胞; 离心细胞裂解物并除去核心部分和残留物; 将缓冲溶液加入上清液; 超离心上清混合物并除去细胞质级分; 将沉淀物重悬于Na 2 CO 3溶液（pH11）中并破坏微粒体; 将二次混合物超速离心两次并除去含有细胞质级分的上清液; 并分离细胞膜级分。
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公开(公告)号：KR101712368B1
公开(公告)日：2017-03-06
申请号：KR1020160099406
申请日：2016-08-04
Applicant: 충남대학교산학협력단 , (주)글라이칸
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/68 , G01N33/6893 , G01N33/6848 , G01N2560/00 , G01N2800/50
Abstract: 과제: 단백질의당쇄화는체내외환경변화에매우민감하여암을포함한다양한질병에직접적으로관련되어진단시스템에활용하려는연구가진행되고있다. 당사슬을이용한질병진단방법은매우효율적이나, 당사슬을분리하여진단에사용할경우시료전처리, 질량분석및 데이터처리에많은시간과노력이요구되고원하지않는인공조성물이생성될수 있다. 해결수단: 이를최소화하고자당쇄화된단백질을있는그대로분석하여암진단에적용하는새로운암진단분석방법을발명하였다. 본발명에서는다량체구조의햅토글로빈의이황화결합을절단하여알파사슬과베타사슬로분리한후 전분자량을측정함으로써베타사슬의당쇄화패턴을분석하였다. 당사슬을분리하지않고이황화결합절단이라는최소한의전처리만수행한후 10분이내의짧은질량분석시간소요및 신속한데이터처리를통해단백질의당쇄화패턴을인식함으로써질병진단시빠르고정확한진단방법으로활용할수 있다.
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公开(公告)号：KR101479622B1
公开(公告)日：2015-01-06
申请号：KR1020140076237
申请日：2014-06-23
Applicant: 충남대학교산학협력단
IPC: C07H1/06
CPC classification number: C08H1/00 , C08B37/0003 , C08B37/006 , C12P19/12 , C12Y114/18001 , C12Y305/01052
Abstract: 본 발명은 비드 고정화 (Bead Immobiliization) 방법을 이용하여 N-당쇄와 O-당쇄가 동시에 존재하는 당단백질에서 O-당쇄만을 선택적으로 추출 및 분리할 수 있는 방법에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로는 N-당쇄와 O-당쇄가 모두 존재하는 당단백질을 비드에 고정시키고 N-당쇄만 선택적으로 분리할 수 있는 특이적 효소인 PNGase F를 이용하여 N-당쇄를 제거한 후 β-제거 (β-elimination)를 통해 O-당쇄만을 선택적으로 분리하는 것이다. 본 발명의 비파괴적인 O-당쇄 분리방법은 다양한 당단백질에서 O-당쇄 분석에 효과적으로 이용될 수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及一种使用珠固定技术从N-糖苷和O-聚糖同时存在的糖蛋白中仅选择性提取和分离O-聚糖的方法。 更具体地说，通过使用能够将N-聚糖和O-聚糖同时存在的糖蛋白固定在珠粒上并能够选择性分离N-聚糖的特异性酶的PNGase F，除去N-聚糖，仅将O-聚糖 通过β-消除选择性分离。 用于分离本发明的O-聚糖的非破坏性方法可以有效地用于分析各种糖蛋白中的O-聚糖。
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公开(公告)号：KR101479207B1
公开(公告)日：2015-01-05
申请号：KR1020130036752
申请日：2013-04-04
Applicant: 충남대학교산학협력단
IPC: G01N33/574 , G01N33/66 , G01N33/48 , G01N33/53
Abstract: 본 발명은 인간 혈청 글라이콤 지도 및 이를 이용하여 난소암 환자의 혈청 시료를 검증하여 얻어진 인간 난소암 마커에 관한 것이다. 본 발명자들은 인간 혈청 단백질의 N-당쇄는 이론적으로는 가능한 당쇄 종류가 매우 많지만, 실제로 N-당쇄는 도 3에 나타낸 것과 같은 구조만이 존재함을 밝혔으며, 존재하는 구조의 N-당쇄들의 출현 백분율을 밝힘으로써 출현 확률이 낮은 N-당쇄들을 특정 질환의 마커로 사용할 수 있음을 밝혔다.
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