二分型碱基编辑器(BBE)结构和II-型-CAS9锌指编辑

    公开(公告)号:CN110997728A

    公开(公告)日:2020-04-10

    申请号:CN201880048952.7

    申请日:2018-05-25

    Abstract: 本文提供用于二分型胞嘧啶碱基编辑器系统的融合蛋白,其包括:(i)第一融合蛋白,其含有与脱氨酶或其活化部分融合的非R-环形成性可编程DNA结合结构域、优选转录激活子样效应子(TALE)或锌指阵列(ZF),任选地在其间具有接头,或者(ii)第二融合蛋白,其含有与尿嘧啶糖基化酶抑制剂(UGI)融合的R-环形成性Cas9蛋白,任选地在其间具有接头,所述R-环形成性Cas9蛋白缺少核酸酶活性或为切口酶,但可与指导RNA和靶DNA相互作用。另外,提供使核酸中一个或多个所选胞嘧啶靶向性脱氨的方法。

    使用分割型脱氨酶限制不需要的脱靶碱基编辑器脱氨

    公开(公告)号:CN111093714A

    公开(公告)日:2020-05-01

    申请号:CN201880045766.8

    申请日:2018-05-25

    Abstract: 本文描述了用于改进靶向性碱基编辑技术的全基因组特异性的方法和组合物。在此,我们描述了使用分割型脱氨酶(sDA)的二聚体碱基编辑(BE)技术,所述分割型脱氨酶在彼此紧密靠近时起作用,一个与ZF融合且一个与含有一个或多个UGI的nCas9-UGI蛋白融合,由此限制脱氨酶结构域在与nCas9 R-环形成无关的脱靶ssDNA靶位点处的脱氨能力。因此,本文提供含有以下的融合蛋白:(i)与可编程DNA-结合结构域融合的第一分割型脱氨酶部分("sDAI")酶;或(ii)与nCas9蛋白融合的第二分割型脱氨酶部分("sDA2")。本发明还包括载体和含有所述载体的细胞,以及含有本文所述蛋白质和核酸的试剂盒。

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