公开(公告)号：KR1020060097316A

公开(公告)日：2006-09-14

申请号：KR1020050018439

申请日：2005-03-05

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 남윤순 ,  최승학 ,  김재흡 ,  황정주 ,  안태진 ,  이연수

IPC: C12Q1/68 ,  G01N33/574

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q1/6827 ,  C12Q1/6834 ,  C12Q1/6837 ,  G01N2033/57403

Abstract: 본 발명은 40 세 이하 또는 55 이상의 여성인 피검자로부터 핵산을 분리하고 상기 핵산 중의 다형성 부위의 염기서열을 결정하는 단계로서, 하기 표 2 또는 표 4에 나타낸 하나 이상의 다형성 서열에서의 다형성 부위 (101 번째 뉴클레오티드)의 유전자형을 결정하는 단계를 포함하는 유방암의 진단 방법, 유방암에 특이적인 폴리뉴클레오티드 및 상기 폴리뉴클레오티드가 고정된 마이크로어레이를 제공한다.
유방암, SNP, 다중좌 마커 (multilocus marker)

公开(公告)号：KR1020060091508A

公开(公告)日：2006-08-21

申请号：KR1020050012417

申请日：2005-02-15

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 최승학 ,  남윤순

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: G06F19/18

Abstract: 본 발명은 a) 표적 네트워크 및 상기 표적 네트워크와 비교되어질 공지된 임의의 문의 경로를 각각 점과 상기 점과 점을 연결하는 선의 집합으로 표시된 경로 그래프를 얻는 단계로서, 상기 점은 각 단백질을 나타내고, 상기 선은 상기 단백질과 단백질의 상호작용을 나타내는 것인 단계; b) 상기 문의 경로와 상기 표적 네트워크의 각 점에 해당하는 단백질 사이의 상동성을 각각 비교하여, 상기 문의 경로의 임의의 단백질 A와 상기 표적 네트워크의 임의의 단백질 u가 서로 설정된 값 이상의 상동성을 가지는 경우 상기 두 개의 단백질 A와 u를 하나의 연관 점 A/u으로 나타내어, 글로벌 정렬 (global alignment) 그래프를 얻는 단계: c) 상기 글로벌 정렬 그래프에서 상기 문의 경로로부터 유래된 임의의 점 Ai를 포함하는 모든 연관점 A/u를 각각 하나의 가상점으로 대응시켜 가상 글로벌 정렬 그래프를 얻는 단계; d) 상기 얻어진 가상 글로벌 정렬 그래프로부터 모든 가능한 해밀턴 경로를 찾고, 각 해밀턴 경로에 있는 점들의 순서에 따라 글로벌 정렬 그래프의 선에 방향성을 주어 방향성 비순환 글로벌 정렬 그래프를 얻는 단계로서, 상기 해밀턴 경로는 상기 가상 글로벌 정렬 그래프의 모든 점을 한번 씩 지나는 경로인 단계; 및 e) 상기 방향성 비순환 글로벌 정렬 그래프 중에서 상동성이 가장 높은 점수를 갖는 방향성 비순환 경로를 선발하는 단계를 포함하는, 표적 네트워크로부터 문의 경로와 가장 유사한 경로를 탐색하는 방법.을 제공한다.
상동성, 경로, 네트워크, 단백질, 상호작용

公开(公告)号：KR100590541B1

公开(公告)日：2006-06-19

申请号：KR1020040011653

申请日：2004-02-21

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 오지영 ,  김경아 ,  남윤순 ,  이정건

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: G06F19/18

Abstract: 누락된 유전자형 데이터 대체 방법 및 그 시스템이 개시된다. 적어도 하나 이상의 유전자 샘플들의 SNP 사이트들에 대한 유전자형 데이터로 이루어진 샘플군을 구성하고, SNP 사이트의 유전자형 데이터가 누락된 샘플과 나머지 샘플들 사이의 유사도를 비교하고 유사도가 높은 순으로 소정 개수의 샘플들을 선택한 후, 선택된 샘플들에서 유전자형 데이터가 누락된 SNP 사이트와 동일한 위치의 SNP 사이트에서 나타나는 최대 빈도의 유전자형 데이터를 파악하고, 누락된 유전자형 데이터를 파악된 최대 빈도의 유전자형 데이터로 대체한다. 이로써, 데이터의 손실에 의해 발생되는 데이터의 불균형으로 인해 잘못된 분석결과를 초래하는 일을 방지할 수 있다.
유전자형 데이터, SNP 사이트, 유사도

公开(公告)号：KR100707196B1

公开(公告)日：2007-04-13

申请号：KR1020050052042

申请日：2005-06-16

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 남윤순 ,  최승학 ,  김재흡

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6883 ,  C12Q2600/156 ,  G06F19/18 ,  G06F19/22

Abstract: 본 발명은 a) 케이스군 및 대조군의 각 핵산 서열에서 하나 이상의 단일 SNP를 선별하는 단계; b) 상기 하나 이상의 단일 SNP로부터 선택되는 2개 이상의 단일 SNP로 구성되는 다중 SNP의 조합 가능한 모든 유전자형 패턴을 생성하는 단계; c) 상기 각 유전자형 패턴에 대해 케이스군 및 대조군의 빈도수를 추출하는 단계; 및 d) 상기 빈도수를 이용하여 상기 케이스군에 통계적으로 유의성을 갖는 유전자형 패턴을 판별 및 선택하는 단계;를 포함하는 케이스군에 유의성을 갖는 다중 단일염기다형의 스크리닝 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 다중 단일염기다형의 스크리닝 방법을 이용하면 개체의 전체 게놈으로부터 특정 질병 또는 약물의 감수성에 관련 다중 단일염기다형을 강건하게 선별할 수 있다.
다중 단일염기다형, 유전자형 패턴(genotype pattern), 오즈비(odds ratio), 피셔의 정확성 검증(Fisher's exact test)

公开(公告)号：KR1020060091683A

公开(公告)日：2006-08-21

申请号：KR1020050032739

申请日：2005-04-20

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 김재흡 ,  최승학 ,  남윤순 ,  이연수 ,  황정주 ,  이규상

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6883 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6837

Abstract: 본 발명은 2형 당뇨병과 연관된 마커를 포함하는 폴리뉴클레오티드 및 피검체에 있어서 하기 표 1에 표시된 1 이상 핵산의 다형성 부위의 염기서열을 결정하는 단계를 포함하는, 2형 당뇨병의 진단 방법을 제공한다.
폴리뉴클레오티드, 2형 당뇨병, 단일염기 다형, SNP

公开(公告)号：KR1020050060285A

公开(公告)日：2005-06-22

申请号：KR1020030091867

申请日：2003-12-16

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 남윤순 ,  안태진

IPC: G06F17/30

CPC classification number: G06F19/22 ,  G06F19/12

Abstract: 해플로타입 데이터의 저장, 이를 위한 정렬 방법 및 이에 따른 검색 방법이 개시된다. 본 발명에 따른 해플로타입 데이터 저장 방법은 해플로타입 데이터들의 각 단일염기다형성 위치에 존재하는 대립 유전자들간에 순서를 부여하는 단계; 부여된 순서에 따라 해플로타입 데이터들을 정렬하는 단계; 및 정렬된 해플로타입 데이터들을 소정 데이터 구조로 저장하는 단계를 포함함을 특징으로한다.

公开(公告)号：KR100474852B1

公开(公告)日：2005-03-10

申请号：KR1020030005199

申请日：2003-01-27

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 최승학 ,  남윤순 ,  권태준 ,  정태수 ,  이권무 ,  이호승

IPC: G06Q50/22 ,  G06F19/10

CPC classification number: G06F19/28 ,  G06F19/20

Abstract: 유전자형 판별 분석을 위한 서버-클라이언트 네트워크 시스템 및 이에 사용되는 기록 매체가 제공된다. 본 발명에 따른 타겟 샘플에 대한 유전자형 판별 분석을 위한 서버-클라이언트 네트워크 시스템은 유전자형 판별 분석에 필요한 데이터 베이스들을 포함하여 이 데이터 베이스들을 클라이언트에 제공하는 서버와, 타겟 샘플에 대한 바이오 칩의 테스트 결과를 입력받고, 서버로부터 데이터 베이스들을 제공받아 타겟 샘플에 대한 유전자형 판별 분석을 하는 클라이언트를 포함한다.
본 발명에 따른 서버-클라이언트 시스템에서는 개인 정보를 보호할 수 있고, 판별분석을 위한 소프트웨어의 독립성이 최대한 보장될 수 있다.

公开(公告)号：KR101194746B1

公开(公告)日：2012-10-25

申请号：KR1020050135839

申请日：2005-12-30

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 안태진 ,  남윤순 ,  송정환

IPC: G06F15/00

CPC classification number: G06F21/562

Abstract: 침입코드 인식을 위한 코드 모니터링 방법 및 장치가 개시된다. 본 발명은 모니터링 대상 코드에 대해 시스템에 상주하는 상주 코드인지 시스템에 침입한 침입코드인지를 판별하는 코드 모니터링 방법에 관한 것으로, 먼저, 모니터링 대상 코드로부터 제1코드 패턴을 추출한다. 다음으로, 저장 수단으로부터 제2코드 패턴을 로드하고, 제1코드 패턴 및 제2코드 패턴과의 거리를 계산한다. 계산된 거리를 임계치와 비교하여 모니터링 대상 코드를 침입코드로 판단한다.

公开(公告)号：KR1020060119737A

公开(公告)日：2006-11-24

申请号：KR1020060018449

申请日：2006-02-24

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 남윤순 ,  최승학 ,  김재흡 ,  박경희 ,  이연수 ,  전효정 ,  송옥렬 ,  안태진 ,  이규상

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/156

Abstract: A multiple SNP for diagnosing cardiovascular disease is provided to be able to diagnose an attack and the possibility of the cardiovascular disease at the initial stage by using specific SNPs. And a method for diagnosing cardiovascular disease is provided to be able to effectively diagnose the existence or danger of the cardiovascular disease by analyzing the SNP related with the cardiovascular disease. The multiple SNP for diagnosing cardiovascular disease comprises at least one polynucleotide or a complementary polynucleotide thereof selected from the group consisting of polynucleotides consisting of at least 10 consecutive nucleotides including each SNP position nucleotide of polynucleotides consisting of SEQ ID : NOs. 1 to 35(76th for the SEQ ID : NO. 4, 85th for the SEQ ID : NO. 8, 51st for SEQ ID : NO. 9, 35th for the SEQ ID : NO. 10, 85th for the SEQ ID : NO. 19, and 101st for number of the remaining SEQ ID). The microarray comprises the polynucleotide, a polynucleotide encoded by the same or a cDNA thereof. The method for diagnosing cardiovascular disease comprises the steps of: (a) separating a nucleic acid sample from an object to be tested; and (b) determining a genotype of the polymorphic portion of the each SNP position nucleotide consisting of SEQ ID : NOs. 1 to 35(76th for the SEQ ID : NO. 4, 85th for the SEQ ID : NO. 8, 51st for the SEQ ID : NO. 9, 35th for the SEQ ID : NO. 10, 85th for the SEQ ID : NO. 19, and 101st for number of the remaining SEQ ID).

Abstract translation: 提供用于诊断心血管疾病的多重SNP以能够通过使用特异性SNP来诊断初始阶段的心血管疾病的发作和可能性。 提供了一种心血管疾病诊断方法，通过分析与心血管疾病相关的SNP，能够有效地诊断心血管疾病的存在或危险。 用于诊断心血管疾病的多重SNP包含至少一种多核苷酸或其互补多核苷酸，其选自由至少10个连续核苷酸组成的组，所述多核苷酸包括SEQ ID NO：所组成的多核苷酸的每个SNP位点核苷酸。 1至35（SEQ ID：NO.4为第76位，SEQ ID NO：8为第85位，SEQ ID：NO.9为第51位，SEQ ID NO：10为第35位，SEQ ID NO：85为第85位 19，101st为剩余的SEQ ID）。 微阵列包含多核苷酸，由其编码的多核苷酸或其cDNA。 用于诊断心血管疾病的方法包括以下步骤：（a）将核酸样品与待测试对象分离; 和（b）确定由SEQ ID NO：组成的每个SNP位置核苷酸的多态性部分的基因型。 1至35（对SEQ ID NO：4为SEQ ID NO：8为第76位，SEQ ID NO：8为第85位，SEQ ID：NO.9为第51位，SEQ ID：NO.10为第35位，SEQ ID NO： 第19号，第101号为剩余的SEQ ID）。

公开(公告)号：KR100590538B1

公开(公告)日：2006-06-15

申请号：KR1020040011001

申请日：2004-02-19

Applicant: 삼성전자주식회사

Inventor： 남윤순 ,  박경희

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: G06F19/24 ,  G06F19/18

Abstract: 측정 데이터에서 결측치 제거 방법이 개시된다. 본 발명은 다수의 결측치들을 포함하는 측정 데이터들로부터 결측치들을 제거하는 방법에 있어서, 측정대상 또는 측정 항목의 중요도에 따라 서로 다른 가중치를 측정대상 또는 측정 항목에 부여하는 단계; 결측치들을 포함하는 측정대상 또는 측정 항목의 집합들중 가중치의 합을 최소로하는 집합을 선택하는 단계; 및 선택된 집합에 속하는 측정대상 및 측정 항목을 측정 데이터로부터 제거하는 단계를 포함함을 특징으로한다.