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公开(公告)号：CN1824807A
公开(公告)日：2006-08-30
申请号：CN200510111808.8
申请日：2005-12-22
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种钙蛋白酶抑制蛋白基因475位SNP标记筛选猪的方法，属于家畜分子生物学技术领域。其步骤包括，提取猪的基因组RNA，钙蛋白酶抑制蛋白基因的反转录PCR扩增，SNP标记的检测及其与猪肉嫩度的相关性分析。本发明的特征是分离鉴定出猪钙蛋白酶抑制蛋白基因新的SNP标记，筛选出一个适用于猪肉嫩度的SNP标记(475位T→G)，设计了扩增该位点的引物，还提供了用于该方法的试剂盒。本发明利用钙蛋白酶抑制蛋白基因编码区域中第475位的SNP与猪肉嫩度显著相关的特性，为猪的标记辅助选种和选配提供了新的分子标记方法。
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公开(公告)号：CN1712532A
公开(公告)日：2005-12-28
申请号：CN200410025394.2
申请日：2004-06-24
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种用于生物基因工程领域的猪单胺氧化酶B的蛋白编码序列。具有SEQ IDNO.1中从第129－1691位的核苷酸序列，其同人、小鼠、大鼠、牛、狗单胺氧化酶B蛋白编码序列同源性为92.73％。具有SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段，或其活性衍生物，其同人、小鼠、大鼠、牛、狗单胺氧化酶B氨基酸序列同源性为93.81％。能够为人类应激相关疾病的研究提供动物模型，本发明参考其它哺乳动物MAO－B基因序列，并利用同源克隆和电子克隆方法，克隆测序获得猪MOA－B的cDNA序列，并对不同物种MAO－B基因的CDS序列进行同源性比较，将大大有益于为今后研究MAO－B基因与猪应激敏感性的关系研究和人类相关疾病的研究和治疗。
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公开(公告)号：CN1563380A
公开(公告)日：2005-01-12
申请号：CN200410017860.2
申请日：2004-04-22
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种用于基因工程技术领域的猪脂肪细胞定向和分化因子1的基因序列，从猪的脾脏细胞总RNA中扩增出的ADD1基因，其cDNA序列和编码蛋白的氨基酸序列，该基因全长3830bp，开放阅读框11bp－3453bp区段，编码有1151个氨基酸的蛋白质，其3’端非编码序列长10bp，5’端非编码序列长366bp，在蛋白质序列的320－380处有螺旋－环－螺旋的核心结构。本发明的一方面可以通过制备该基因的蛋白，用于研究该基因在猪脂肪细胞分化和调节体内胆固醇水平等过程中的作用。另一方面可以通过标记辅助选择(MAS)的方法对瘦肉型猪和低胆固醇型猪的生产和育种中发挥指导性作用。
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公开(公告)号：CN119932201A
公开(公告)日：2025-05-06
申请号：CN202510042693.9
申请日：2025-01-10
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与宿主鸡白痢沙门氏菌抗性性状相关的MYH7基因及其SNP分子标记与应用，MYH7基因及其SNP分子标记在选育或辅助选育对鸡白痢沙门氏菌抗性高的鸡品种中的应用，MYH7基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，MYH7基因SNP分子标记位于鸡的19号染色体MYH7基因的内含子区域，于19号染色体5853bp位点，多态性为T或G；当MYH7基因SNP分子标记处的碱基为T时，对应于鸡对鸡白痢沙门氏菌抗性高；当MYH7基因SNP分子标记处的碱基为G时，对应于鸡对鸡白痢沙门氏菌抗性低。利用本发明提供的MYH7基因及其SNP分子标记，可快速且有效地筛选选育出鸡白痢沙门氏菌高抗性的鸡品种。
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公开(公告)号：CN118140871A
公开(公告)日：2024-06-07
申请号：CN202211511931.9
申请日：2022-11-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: A01K67/027 , C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种选育五趾型黄羽肉鸡配套系的Lmbr1基因分子标记的引物、基因测序分型以及相应育种技术。具体来说，通过针对北京油鸡Lmbr1基因SNPrs80659072位点设计引物，经PCR扩增、Sanger测序筛选TT基因型的个体、结合五趾个体表型选择，选留五趾TT基因型北京油鸡，经纯系闭锁选育三个世代，使得五趾TT基因型公鸡比例大于99％以上，确定该五趾品系为配套杂交组合的父系；与母系四趾正常黄羽肉鸡母鸡进行二元杂交；生产五趾型商品代黄羽肉鸡。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117947172A
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202211348215.3
申请日：2022-10-31
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种骆驼SSR分子标记及其应用，属于基因检测技术领域。该引物用于骆驼遗传多样性检测与亲缘关系分析，包括如下步骤(1)通过骆驼全基因组序列分析，得到249,615个可能的SSR分子标记；通过高通量测序分析得到37,799个可能的SSR分子标记；在其中选择一系列高置信度骆驼SSR引物；(2)对待测骆驼采集其耳样并提取基因组DNA；(3)根据上述筛选得到的SSR引物，针对上述骆驼个体基因组DNA进行PCR扩增。(4)将上述所有PCR产物混合后纯化得到扩增子文库，之后对其进行Novaseq高通量测序，并对下机数据使用AdapterRemoval进行拆分，得到待测区序列；(5)使用MISA分析上述待测区序列，得到骆驼个体SSR模体序列及其重复数(遗传多样性)。
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公开(公告)号：CN116814802A
公开(公告)日：2023-09-29
申请号：CN202310536064.2
申请日：2023-05-12
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域，尤其是涉及双峰驼产奶性状相关基因MYRIP及其作为分子标记的应用。本发明利用二代测序技术对162头双峰驼进行基因组重测序，通过与骆驼产奶量性状进行全基因组关联分析，鉴定出MYRIP基因中与双峰驼驼乳中产奶量高/低相关的分子标记。该标记位于第17号染色体41245716bp位点，发生C>T单碱基突变(g.41245716C>T)，该突变位点可以提高驼奶的产奶量，利用该标记能针对双峰驼的驼产奶量性状开展分子标记辅助选择。
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公开(公告)号：CN116042855A
公开(公告)日：2023-05-02
申请号：CN202211698740.8
申请日：2022-12-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , G16B20/30 , G16B30/00
Abstract: 本发明属于生物技术领域，尤其是涉及双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用。本发明利用二代测序技术对162头双峰驼进行基因组重测序，通过与骆驼非脂固体率性状进行全基因组关联分析，鉴定出EVX2基因中与双峰驼驼乳中非脂固体率高/低相关的分子标记。该标记位于5号染色体48754135bp位点，发生C>A单碱基突变(g.48754135C>A)，该突变位点可以提高驼奶的非脂固体率，利用该标记能针对双峰驼的驼非脂固体率性状开展分子标记辅助选择。
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公开(公告)号：CN110656153B
公开(公告)日：2021-08-20
申请号：CN201910892839.3
申请日：2019-09-20
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及与小体重鸡只厌食行为高度关联的肠道微生物标记物。所述标记物分别为Rhodovulum属Rhodovulum bhavnagarense菌种和Terrisporobacter属Terrisporobacter glycolicus菌种。该标记物在小体重鸡只肠道中富集，鸡只表现为厌食瘦小，该标记物的发现为微生物减肥产品的研发提供了参考，另外，可在家禽生产中，用于产蛋鸡体重的控制。
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公开(公告)号：CN110751985A
公开(公告)日：2020-02-04
申请号：CN201910892250.3
申请日：2019-09-20
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及与大体重鸡只高度关联的肠道微生物标记物。所述标记物分别为Barnesiella属中的Barnesiella viscericola菌种和Bacteroides属中的Bacteroides sp.AF14-46菌种。该标记物在体重高的鸡只肠道中显著富集，参与鸡只能量代谢等功能，为饲料微生态制剂的研发提供了参考，另外也可用于鸡只体重发育潜力的预测。
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