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公开(公告)号：CN112029858A
公开(公告)日：2020-12-04
申请号：CN202010844019.X
申请日：2020-08-20
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B20/30 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开了一种PD-1/PD-L1抑制剂免疫治疗疗效预测的方法和系统。所述方法包括：获取受试者的肿瘤浸润淋巴细胞的T细胞受体的种类和丰度，以及基线外周血的CD8+PD1+ T细胞的T细胞受体的种类；统计受试者的肿瘤浸润淋巴细胞与CD8+PD1+ T细胞共有T细胞受体的种类，计算所述肿瘤浸润淋巴细胞中具有共有T细胞受体的肿瘤浸润淋巴细胞的平均比例，作为IR指数；通过所述IR指数判断PD-1/PD-L1抑制剂免疫治疗疗效。本发明的方法可以提供肿瘤免疫治疗疗效及预后的预测指标，能有效筛选免疫治疗应答患者群。
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公开(公告)号：CN112029858B
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202010844019.X
申请日：2020-08-20
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B20/30 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开了一种PD‑1/PD‑L1抑制剂免疫治疗疗效预测的方法和系统。所述方法包括：获取受试者的肿瘤浸润淋巴细胞的T细胞受体的种类和丰度，以及基线外周血的CD8+PD1+T细胞的T细胞受体的种类；统计受试者的肿瘤浸润淋巴细胞与CD8+PD1+T细胞共有T细胞受体的种类，计算所述肿瘤浸润淋巴细胞中具有共有T细胞受体的肿瘤浸润淋巴细胞的平均比例，作为IR指数；通过所述IR指数判断PD‑1/PD‑L1抑制剂免疫治疗疗效。本发明的方法可以提供肿瘤免疫治疗疗效及预后的预测指标，能有效筛选免疫治疗应答患者群。
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公开(公告)号：CN110820050A
公开(公告)日：2020-02-21
申请号：CN201911159400.6
申请日：2019-11-22
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 苏州吉因加生物医学工程有限公司
IPC: C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及生物信息学技术领域，具体涉及一种全基因组甲基化非重亚硫酸氢盐的测序文库及构建、用途，包括TET酶反应液，所述TET酶反应液包括如下独立包装的组分：TET酶氧化缓冲液；所述TET酶氧化缓冲液包括如下微摩尔份的组分：HEPES或Tris–Cl(20-167)×103份，NaCl(100-333)×103份，α-KG或2-oxoglutarate 3.3×103份，抗坏血酸6.67×103份，和三磷酸腺苷4×103份；采用上述试剂盒结合Fe(NH4)2(SO4)2以及TET酶可以将5mc氧化为5cac，5cac在还原剂作用下被还原为二氢尿嘧啶，经PCR测序识别为T，实现在非重亚硫酸氢盐条件下的DNA甲基化“C”到“T”转化，解决现有的基于亚硫酸氢盐转化构建的甲基化测序文库存在的碱基不平衡，测序数据使用率低的缺陷，该配方还具有组分精简，TET酶使用量极低，显著降低成本的效果。
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公开(公告)号：CN106480205A
公开(公告)日：2017-03-08
申请号：CN201610994059.6
申请日：2016-11-11
Applicant: 北京吉因加科技有限公司 , 苏州吉因加生物医学工程有限公司
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6874 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156 , C12Q2600/16 , C12Q2565/501 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了用于同时检测多种突变类型的序列组合和探针。更具有而言，本发明提供了高灵敏度、高特异性的可以同时检测表1中列出的57个肿瘤驱动基因的点突变、短片段插入缺失、拷贝数变异和融合基因的序列组合、探针、基因芯片、方法和试剂盒。本发明还公开了所述序列组合和探针相关的基因芯片和试剂盒以及用于同时检测多种突变类型的方法。本发明通过检测血液、胸水、腹水等体液以及肿瘤冰冻组织或石蜡切片获得全面的肿瘤驱动基因突变信息，提高了肿瘤基因检测的灵敏度和准确率，从而实现辅助临床医生制定个体化用药方案，使精准治疗达到最好效果。
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公开(公告)号：CN114093417B
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN202111397096.6
申请日：2021-11-23
Applicant: 深圳吉因加信息科技有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC: G16B20/20
Abstract: 本申请公开了一种鉴定染色体臂杂合性缺失的方法和装置。本申请方法从肿瘤配对血细胞样本中获取胚系SNV突变位点，过滤筛选获得杂合位点集；再利用染色体长臂和短臂上的各杂合位点的突变支持数，计算Ratio值，进而计算z_score值及其阈值，以此判断各杂合位点的LOH状态，再以此判断染色体臂是否发生杂合性缺失。本申请鉴定染色体臂杂合性缺失的方法和装置，能够覆盖更多杂合位点，检测LOH的分辨率更高，能够高效、灵敏、准确的实现待测肿瘤样本两个染色体臂的LOH状态鉴定。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117831619A
公开(公告)日：2024-04-05
申请号：CN202311863245.2
申请日：2023-12-29
Applicant: 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
Abstract: 本公开涉及一种肾脏细胞特异性甲基化标志物的筛选方法及其应用。本公开的方法利用DNA甲基化测序技术(Next Generation of Methylome Analysis,GM‑seq，或BS/EM‑seq)，检测肾上皮细胞特异性甲基化信号。通过分析血浆中肾上皮细胞来源的cfDNA比例，能够实现高敏感性和高特异性的肾脏损伤评估，从而实现了肾脏疾病的早期筛查、肾脏损伤进程监测、风险分层、预后疗效评估等功能。
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公开(公告)号：CN119932172A
公开(公告)日：2025-05-06
申请号：CN202411999515.7
申请日：2024-12-31
Applicant: 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC: C12Q1/6883 , G16B25/00 , G16H50/20 , G16H50/30
Abstract: 本公开提供了一种基于细胞甲基化标志物的器官损伤的检测方法及应用，通过构建对待测样本中来源于靶细胞的cfDNA进行定量的方法对血浆cfDNA中的各类成份进行精准解析，实现对各类器官的健康评估、疾病早筛早诊、病程监测及预后评估等功能。
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公开(公告)号：CN112951325B
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202110190057.2
申请日：2021-02-18
Applicant: 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 长沙吉因加生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及一种用于癌症检测的探针组合的设计方法及其应用，所述设计方法包括：提取数据库中的癌症的突变集合分为训练集和验证集，将所述训练集中参考基因组距离
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公开(公告)号：CN114067909B
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202111396426.X
申请日：2021-11-23
Applicant: 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 深圳吉因加信息科技有限公司
IPC: G16B20/50
Abstract: 本申请公开了一种矫正同源重组缺陷评分的方法、装置和存储介质。本申请方法包括获取待测样本的体系CNV和体系SNV；利用体系CNV和SNV，计算待测样本最优模型下的WGD值，及原始的LOH score值、TAI score值、LSTscore值；对发生WGD的待测样本，矫正LST score值＝(1‑k1×WGD值)×原始LST score值，矫正TAI score值＝(1‑k2×WGD值)×原始LST score值。本申请矫正同源重组缺陷评分的方法和装置，利用WGD值对TAI和LST进行矫正，解决了全基因组倍增样本TAI和LST评分偏高的问题，提高了同源重组缺陷状态评估灵敏度和准确性。
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公开(公告)号：CN114300051B
公开(公告)日：2022-07-15
申请号：CN202111580002.9
申请日：2021-12-22
Applicant: 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 苏州吉因加医学检验有限公司
Abstract: 一种计算融合基因频率的方法及装置，该方法包括：片段数目检测步骤，包括从待测样本的测序数据中检测得到融合基因片段的数目及正常基因片段的数目；校正步骤，包括估计假定芯片区间截止到断点位置时，融合基因两侧的正常基因片段捕获数目，并求和，得到校正后的正常片段捕获数目；计算步骤，包括根据片段数目检测步骤获得的融合基因片段的数目与校正步骤获得的校正后的正常片段捕获数目，计算得到融合基因频率。通过计算融合基因片段的数目与校正步骤获得的校正后的正常片段捕获数目，进而计算出相对准确的融合基因频率。
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