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公开(公告)号:CN119060052B
公开(公告)日:2025-05-02
申请号:CN202411175684.9
申请日:2024-08-26
Applicant: 东南大学
IPC: C07D471/20 , G01N33/573 , A61K31/499 , A61P13/12 , G16B20/20 , G16B15/30
Abstract: 本发明公开了一种靶向ATP6V0A4p.V512L突变体抑制剂的药物先导化合物及应用,属于生物医药技术领域。用于治疗或者预防肾脏泌氢障碍的药物,包括能够靶向抑制ATP6V0A4p.V512L突变体抑制剂。本发明还涉及用于抑制ATP6V0A4p.V512L突变体的潜在药物筛选方法,包括以下步骤:ATP6V0A4p.V512L突变体的蛋白质结构进行预测,将所述蛋白质与待筛选化合物进行虚拟对接,根据结合亲和力进行虚拟筛选;使用RDKit指纹生成器为虚拟筛选后的化合物生成分子指纹,计算指纹的Tanimoto相似性,使用层次凝聚聚类进行聚类分析;通过分子动力学模拟,计算化合物与突变体的结合自由能,进一步筛选化合物;筛选所得的化合物进行湿实验验证。该化合物可以用于进一步设计和合成高活性高选择性的靶向ATP6V0A4p.V512L突变体的抑制剂,同时为ATP6V0A4p.V512L突变导致的肾脏泌氢障碍患者的靶标药物研发奠定基础。
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公开(公告)号:CN119060052A
公开(公告)日:2024-12-03
申请号:CN202411175684.9
申请日:2024-08-26
Applicant: 东南大学
IPC: C07D471/20 , G01N33/573 , A61K31/499 , A61P13/12 , G16B20/20 , G16B15/30
Abstract: 本发明公开了一种靶向ATP6V0A4p.V512L突变体抑制剂的药物先导化合物及应用,属于生物医药技术领域。用于治疗或者预防肾脏泌氢障碍的药物,包括能够靶向抑制ATP6V0A4p.V512L突变体抑制剂。本发明还涉及用于抑制ATP6V0A4p.V512L突变体的潜在药物筛选方法,包括以下步骤:ATP6V0A4p.V512L突变体的蛋白质结构进行预测,将所述蛋白质与待筛选化合物进行虚拟对接,根据结合亲和力进行虚拟筛选;使用RDKit指纹生成器为虚拟筛选后的化合物生成分子指纹,计算指纹的Tanimoto相似性,使用层次凝聚聚类进行聚类分析;通过分子动力学模拟,计算化合物与突变体的结合自由能,进一步筛选化合物;筛选所得的化合物进行湿实验验证。该化合物可以用于进一步设计和合成高活性高选择性的靶向ATP6V0A4p.V512L突变体的抑制剂,同时为ATP6V0A4p.V512L突变导致的肾脏泌氢障碍患者的靶标药物研发奠定基础。
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