公开(公告)号：CN118155726A

公开(公告)日：2024-06-07

申请号：CN202410331497.9

申请日：2024-03-22

Applicant: 中国烟草总公司广西壮族自治区公司 ,  贵州省烟草科学研究院

Inventor： 潘文杰 ,  卢燕回 ,  姜超英 ,  王笛 ,  高维常 ,  张得平 ,  杨晗 ,  罗肖辑 ,  宋峰全 ,  代璐 ,  涂祖贵

IPC: G16B40/00 ,  G16B30/00 ,  G16B50/40 ,  G06F18/15 ,  G06F18/25 ,  G06F18/2431 ,  G06N3/042 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/045 ,  G06N3/048

Abstract: 本发明涉及生物信息处理技术领域，具体公开了一种基于多元化特征的基因序列分类方法及系统，借助K‑mer和图生成的方式将基因序列转换为基因序列图，并对基因序列图进行多元化的特征提取，其中包括局部特征、全局特征和混合特征以及聚合特征。在局部特征提取和混合特征提取中采用了图自注意力机制，将需要重点关注的局部信息分配了较高的权重，在全局特征提取中采用了图卷积特征提取，在聚合特征提取中采用了图间的消息传递，捕获不同层级的特征。本发明在对序列的多元化特征提取时，保证了提取到基因序列中更加显著的特征同时避免了过平滑，同时使用孪生神经网络衡量输入样本的差异性，从而提高基因序列分类的准确度。