荧光重组病毒竞争实验体系的建立

    公开(公告)号:CN103695450A

    公开(公告)日:2014-04-02

    申请号:CN201310707633.1

    申请日:2013-12-20

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 荧光重组病毒竞争实验体系的建立,本发明属基因工程技术领域。在该体系中,分别以表达绿色荧光蛋白(EGFP)和红色荧光蛋白(DsRed2)的B亚型标准株NL4.3(△Env)为骨架,将源自两种不同HIV-1病毒的env基因通过同源重组的方法,构建荧光重组嵌合病毒。两种携有不同荧光蛋白的竞争病毒分别单独感染及共感染靶细胞U87。不同的荧光蛋白作为区分两种竞争病毒的标签,通过流式细胞技术分别计算带有不同荧光的细胞个数,可以快速准确地获得不同病毒感染的细胞数量。经过相应计算可以得到两种竞争病毒的相对适应性。HIV-1复制适应性可以通过一系列统计计算得到,其成为反应HIV-1对特定宿主细胞环境适应能力的量化指标。

    一种鼠源IL-27重组蛋白真核表达载体及构建方法

    公开(公告)号:CN102816794A

    公开(公告)日:2012-12-12

    申请号:CN201210302034.7

    申请日:2012-08-23

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明公开了一种鼠源IL-27重组蛋白真核表达载体及构建方法。其构建流程是设计引物分别将编码小鼠EBI3氨基酸1-228的cDNA序列与编码小鼠p28氨基酸29-234的cDNA序列扩增,然后通过SOEPCR的方法获得整合的DNA片段。将此片段与pcDNA3.1+载体连接后得到鼠源IL-27重组蛋白真核表达载体pSZ12。其中EBI3和p28通过预先设计的氨基酸编码序列连接。本发明所构建的载体,不仅能高效表达由EBI3和p28组成的异源二聚体IL-27,而且包含6×组氨酸编码序列,极大方便了重组蛋白的纯化。并且可将其关键片段克隆至其他载体上以方便不同情况下的蛋白表达应用,为研究IL-27功能及基因治疗方法的研究提供了一个有效工具。

    OCT和OCTA图像融合的视网膜血管图像分割方法

    公开(公告)号:CN118229713B

    公开(公告)日:2024-07-19

    申请号:CN202410642900.X

    申请日:2024-05-23

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及图像处理技术领域,具体公开了OCT和OCTA图像融合的视网膜血管图像分割方法,包括:获取OCT图像、OCTA图像和投影图;对OCT图像和OCTA图像进行多个阶段投影和融合,生成多模态投影图和中间阶段融合投影图;多模态投影图融合生成特征图#imgabs0#;中间阶段融合投影图融合生成特征图#imgabs1#;将投影图、特征图#imgabs2#和特征图#imgabs3#相加生成特征图#imgabs4#,对特征图#imgabs5#、特征图#imgabs6#和特征图#imgabs7#进行投影分割,获得RV和FAZ的图像分割结果。本发明充分利用了OCT和OCTA两种模态数据,缓解了由于不同模态的错位和融合不足而导致的特征贡献不均和模态不平衡的问题。

    一种利用观赏植物大花马齿苋修复石油烃污染土壤的方法

    公开(公告)号:CN102357519A

    公开(公告)日:2012-02-22

    申请号:CN201110206485.6

    申请日:2011-07-22

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及有机污染土壤的环境修复技术,具体地说是一种利用观赏植物大花马齿苋(Portulaca Grandiflora L.)修复石油烃污染土壤的植物修复方法。本方法利用大花马齿苋植株本身的吸收、根系分泌物及其根际微生物的降解作用,来促进污染土壤中目标污染物石油烃(TPH)的降解。待植株生长成熟后整体将其从土壤中移除并可作为商品出售;也可以不移除。通过反复种植该种植物,重复上述操作,就可以连续减少污染土壤中石油烃污染物,直至其污染物含量达到国家环境标准或生态安全水平。本方法具有对环境美化,不需要处置现场,不破坏土壤的理化性质,无二次污染,费用低且适于大规模操作,在治理污染的同时改善环境等优点。

    一株减毒铜绿假单胞菌的构建方法及其在蛋白质转染中的应用

    公开(公告)号:CN108359630A

    公开(公告)日:2018-08-03

    申请号:CN201810324073.4

    申请日:2018-04-12

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 一株减毒铜绿假单胞菌的构建方法及其在蛋白质转染中的应用。构建方法是,将铜绿假单胞菌Δ8菌株中参与细胞壁肽聚糖合成的谷氨酸消旋酶基因murI删除,从而获得D-谷氨酸营养缺陷型菌株Δ9。其应用是,Δ9菌株无细胞毒性并保留有完好的III型分泌系统(T3SS),可将外源蛋白质通过其T3SS高效地注入到哺乳动物细胞中,能够应用于哺乳动物细胞蛋白质转染。Δ9在缺少D-谷氨酸的培养环境中无法生长,因此,转染后该菌可通过D-谷氨酸营养限制自行清除。我们分别利用HeLa细胞和小鼠感染模型阐释了该菌体外和体内应用的安全性。本发明对于开发安全、高效的哺乳动物细胞蛋白质转染技术有着积极的意义。

    抑制HIV-1的双长发卡结构RNA表达原件的构建及功能检测

    公开(公告)号:CN102352360A

    公开(公告)日:2012-02-15

    申请号:CN201110357481.8

    申请日:2011-11-11

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 抑制HIV-1的双长发卡结构RNA表达原件构建及功能检测,本发明属基因工程技术领域。本发明根据siRNA的设计原理以及HIV-1序列保守性分析,选择HIV-1的衣壳蛋白gag基因(532-552),包膜蛋白env基因(1428-1448),非结构蛋白tat基因(131-151)和vpu基因(143-161),设计相应siRNA序列,通过两次Two-stepPCR的方法,最终构建双长发卡结构RNA表达原件(序列表SEQIDNo.1所示),通过显微荧光观测以及流式细胞分析定量检测双长发卡结构RNA表达原件对HIV基因EGFP融合蛋白真核表达的抑制效果。实验证实dlhRNA表达原件可以有效抑制HIV多个基因的表达。

    基于因果推断的臭氧污染成因路径构建方法及应用

    公开(公告)号:CN119513553A

    公开(公告)日:2025-02-25

    申请号:CN202411575925.9

    申请日:2024-11-06

    Abstract: 本发明公开了一种基于因果推断的臭氧污染成因路径构建方法,包括以下步骤:步骤1)以臭氧污染成因分析中的常规影响因素作为臭氧污染成因路径的解释变量;步骤2)对各解释变量进行显著性检验,定义混杂解释变量;步骤3)利用格兰杰因果关系检验确定关键解释变量和中介变量,初步搭建中介路径;步骤4)对中介路径进行检验和修正;步骤5)组间差异性检验确定调节变量,初步搭建有调节的中介路径;步骤6)对有调节的中介路径进行统计检验和修正,评估调节变量对中介路径的调节作用。本发明的臭氧污染成因路径构建方法,为厘清复合污染体系下臭氧污染形成机制以及提出有效可行的臭氧污染防治措施提供理论指导。

    OCT和OCTA图像融合的视网膜血管图像分割方法

    公开(公告)号:CN118229713A

    公开(公告)日:2024-06-21

    申请号:CN202410642900.X

    申请日:2024-05-23

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及图像处理技术领域,具体公开了OCT和OCTA图像融合的视网膜血管图像分割方法,包括:获取OCT图像、OCTA图像和投影图;对OCT图像和OCTA图像进行多个阶段投影和融合,生成多模态投影图和中间阶段融合投影图;多模态投影图融合生成特征图#imgabs0#;中间阶段融合投影图融合生成特征图#imgabs1#;将投影图、特征图#imgabs2#和特征图#imgabs3#相加生成特征图#imgabs4#,对特征图#imgabs5#、特征图#imgabs6#和特征图#imgabs7#进行投影分割,获得RV和FAZ的图像分割结果。本发明充分利用了OCT和OCTA两种模态数据,缓解了由于不同模态的错位和融合不足而导致的特征贡献不均和模态不平衡的问题。

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