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公开(公告)号：CN103020489A
公开(公告)日：2013-04-03
申请号：CN201310000114.1
申请日：2013-01-04
Applicant: 吉林大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明提供一种RNA干扰时预测siRNA干扰效率的方法，涉及生物信息学研究领域，其目的在于解决现有预测siRNA干扰效率方法中准确率不高的问题。本发明包括如下的步骤：将siRNA序列输入CPLD；按照特征提取规则表将siRNA序列重新编码，由于靶mRNA的序列和结构特征也对siRNA干扰效率有影响，故对siRNA序列编码的同时，也对靶mRNA进行编码；最后用随机森林模型进行siRNA干扰效率预测，在预测时首先用已知样本建立优化的模型，采用bootstrap抽样方法产生的OOB数据进行OOB估计，通过不断的调解模型的参数，使模型的泛化误差达到最小，然后再用优化的模型进行siRNA干扰效率预测。
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公开(公告)号：CN103020489B
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201310000114.1
申请日：2013-01-04
Applicant: 吉林大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明提供一种RNA干扰时预测siRNA干扰效率的方法，涉及生物信息学研究领域，其目的在于解决现有预测siRNA干扰效率方法中准确率不高的问题。本发明包括如下的步骤：将siRNA序列输入CPLD；按照特征提取规则表将siRNA序列重新编码，由于靶mRNA的序列和结构特征也对siRNA干扰效率有影响，故对siRNA序列编码的同时，也对靶mRNA进行编码；最后用随机森林模型进行siRNA干扰效率预测，在预测时首先用已知样本建立优化的模型，采用bootstrap抽样方法产生的OOB数据进行OOB估计，通过不断的调解模型的参数，使模型的泛化误差达到最小，然后再用优化的模型进行siRNA干扰效率预测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108090327B
公开(公告)日：2022-03-29
申请号：CN201711380586.9
申请日：2017-12-20
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明公开一种包含三维自由能的外源性miRNA调控的靶基因预测方法，改进传统序列匹配特征，新提出了种子区域的三维能量统计特征及结合位点的空配惩罚函数统计特征，种子区域结合位点特征表示了结合位点的具体配对信息，使得构建的特征输入向量更为精确，而且更加贴合实际，因此提高了miRNA靶点预测的准确度。
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公开(公告)号：CN102880811A
公开(公告)日：2013-01-16
申请号：CN201210407490.8
申请日：2012-10-24
Applicant: 吉林大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 基于CPLD碱基片段编码和蚁群算法的RNA序列二级结构预测方法属生物信息学研究领域，本发明使用CPLD按照关联表将RNA序列重新编码。根据编码表和编码关联表中的对应值得到相应的编码序列，由完全匹配表和不完全匹配表，并通过“向右延伸”的策略剔除冗余茎区，得到所有可能的茎区集合，然后给出蚁群算法中二维的启发式信息、初始茎区和下一茎区的选取规则，以及信息素更新策略，构造所有可能的茎区集合的相容子集，最终得到自由能最小的二级结构；本发明能快速、准确、有效地预测不包含假结的RNA序列的二级结构，并将所得结果以括号法模式输出，在评判RNA序列二级结构预测优劣的两个参数方面，即敏感性和特异性，均优于目前主流预测技术。
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公开(公告)号：CN108090327A
公开(公告)日：2018-05-29
申请号：CN201711380586.9
申请日：2017-12-20
Applicant: 吉林大学
Abstract: 本发明公开一种包含三维自由能的外源性miRNA调控的靶基因预测方法，改进传统序列匹配特征，新提出了种子区域的三维能量统计特征及结合位点的空配惩罚函数统计特征，种子区域结合位点特征表示了结合位点的具体配对信息，使得构建的特征输入向量更为精确，而且更加贴合实际，因此提高了miRNA靶点预测的准确度。
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公开(公告)号：CN103593587A
公开(公告)日：2014-02-19
申请号：CN201310582463.9
申请日：2013-11-20
Applicant: 吉林大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明公开一种基于组件式带假结长链RNA二级结构的识别方法及装置，采用平衡能能量方法预测RNA二级结构，不仅完善了多分支环能量计算，而且加入了初步假结能量，使得能量计算更为精确，并且更加贴近实际，提高了包含假结的RNA二级结构预测的准确性。解决了当前二级结构识别软件局限关注于全局结构的准确性以及解决了当前忽略长链RNA中具有生物功能、局部结构保守的功能组件重要性的方面，因此在序列增长的情况下，仍可以有效的对RNA二级结构进行识别。充分利用软硬件结合的方法，不仅提高了预测的时空复杂度，而且本发明的装置可以实现在任何装有本发明客户端软件的机器上实现即插即用。
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公开(公告)号：CN206938659U
公开(公告)日：2018-01-30
申请号：CN201720312058.9
申请日：2017-03-28
Applicant: 吉林大学
IPC: B60R16/02
Abstract: 实用新型公开了一种汽车监控管理装置，包括汽车保养监控系统、汽车乘坐安全监控系统、汽车内部环境监控系统和总控制系统；汽车保养监控系统包括里程获取设备、第一控制设备和提示设备；汽车乘坐安全监控系统包括乘坐位置获取设备、第二控制设备和智能锁系统；汽车内部环境监控系统包括温度传感器、粉尘传感器、第三控制设备和智能空调系统；温度传感器、粉尘传感器分别与第三控制设备相连接。本实用新型通过总控制系统对汽车进行保养、乘车安全、车辆内部环境进行有效监控，避免车辆因保养过期时间较长带来不必要的零部件损耗及消除安全隐患；并且保证了儿童乘车的安全性；还能够对车辆内部环境进行实时监控，保证内部环境的健康、安全。
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