公开(公告)号：CN117854598A

公开(公告)日：2024-04-09

申请号：CN202410127634.7

申请日：2024-01-30

Applicant: 安徽大学

Inventor： 郑春厚 ,  郭子强 ,  魏丕静 ,  高震 ,  曹瑞芬

IPC: G16B40/00 ,  G06N3/042 ,  G06N3/0442 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/0464

Abstract: 本发明公开了一种基于有向图卷积的上皮细胞基因调控关系预测方法，包括：1、获取上皮细胞基因的表达值，并对特征值进行预处理；2、获取上皮细胞基因序列数据并将基因序列数据输入循环神经网络模型双向门控循环单元中得到该类基因的序列特征；3、对上皮细胞基因序列，通过生物学定义公式，计算生物特征；4前面步骤得到的特征拼接后输入有向图卷积神经网络中训练得到上皮细胞基因调控网络及其输出的预测分数矩阵，从而根据预测分数矩阵和阈值之间的关系，判断基因间是否存在调控关系。本发明能准确预测人体上皮细胞基因间的控制关系，有助于研究人员更高效地研究生物体本质。

公开(公告)号：CN117789831A

公开(公告)日：2024-03-29

申请号：CN202311830026.4

申请日：2023-12-28

Applicant: 安徽大学

Inventor： 郑春厚 ,  鲍锦锦 ,  魏丕静 ,  高震 ,  曹瑞芬

IPC: G16B40/20 ,  G16B30/10 ,  G16B15/00 ,  G06V10/80 ,  G06V10/82 ,  G06N3/0464

Abstract: 本发明公开了一种基于矩阵增强和特征融合的基因调控关系预测方法，包括：1、获取N个基因G及其调控关系R，2、根据R计算基因的有向邻接矩阵，3、生成源基因的相似性矩阵并归一化，4、生成靶基因的相似性矩阵并归一化，5、采用EASNN方法分别对归一化后的源基因和靶基因相似性矩阵进行处理，并对邻接矩阵进行矩阵增强处理，6、生成基因的协方差矩阵Co，并根据Co选择任一基因对的邻域基因对集合，7、根据G得到各个基因对的总直方图集合Mg，8、得到各个基因对的总增强直方图集合Ma，9、构建CNN网络得到各个基因对之间存在调控关系的概率。本发明能有效融合基因表达特征和增强的网络结构特征，从而能更加准测的预测基因之间的调控关系。