一种基于单细胞ATAC-seq识别单细胞中elncRNAs调控靶基因的方法

    公开(公告)号:CN119580822A

    公开(公告)日:2025-03-07

    申请号:CN202411622828.0

    申请日:2024-11-13

    Abstract: 本发明涉及生物信息学技术领域,特别是涉及一种基于单细胞ATAC‑seq识别单细胞中elncRNAs调控靶基因的方法。本发明提供的方法基于scATAC‑seq数据利用染色质共可及性识别了单细胞全基因组上的elncRNAs‑靶基因的调控网络。同时,将方法应用到了免疫细胞分化中,精确识别了免疫细胞分化的elncRNAs‑靶基因调控动态。并且,进一步解析了这些elncRNAs在不同细胞类型中的生物学功能。本发明提供的的方法能够帮助生物医学领域相关研究人员更加精细、准确地预测单细胞分辨率下elncRNAs的调控作用及功能。

    一种LncRNA学习系统
    3.
    发明授权

    公开(公告)号:CN112102878B

    公开(公告)日:2024-01-26

    申请号:CN202010973090.8

    申请日:2020-09-16

    Abstract: 本发明涉及一种LncRNA学习系统,包括:数据获取模块,用于获取SNP数据集和LncRNA数据集;数据处理模块,用于识别出所述LncRNA数据集中每个LncRNA及附近的SNP得到SNP组;滑窗模块,用于基于滑窗法得到每个所述LncRNA的突变热点区域,组成突变热点区域组;显著性分析模块,用于基于超几何分布法对所述突变热点区域组进行显著性分析得到显著组数据;排秩模块,用于对所述显著组数据内的SNP进行打分和排秩,得到顺序SNP数据库;基于所述顺序SNP数据库构建LncRNA平台,用户通过所述LncRNA平台进行学习。本发明能准确识别出能使LncRNA发生改变的SNP,并基于此构建学习平台,以供研究者和医务人员进行研究学习。(56)对比文件Fan,J.Identification of SNP-containing regulatory motifs in themyelodysplastic syndromes model using SNParrays ad gene expression arrays.CHINESEJOURNAL OF CANCER.2013,第32卷(第4期),170-185.林梦洁;范D;郁芸;韩新焕.SLC26A4基因编码区功能特征及分子进化分析.南京医科大学学报(自然科学版).2013,(第11期),3-8.岁品品;邢旭东;王宏;崔颖.基于位置权重矩阵的核小体识别及功能分析.生物信息学.2016,(第01期),3-8.

    一种LncRNA学习系统
    4.
    发明公开

    公开(公告)号:CN112102878A

    公开(公告)日:2020-12-18

    申请号:CN202010973090.8

    申请日:2020-09-16

    Abstract: 本发明涉及一种LncRNA学习系统,包括:数据获取模块,用于获取SNP数据集和LncRNA数据集;数据处理模块,用于识别出所述LncRNA数据集中每个LncRNA及附近的SNP得到SNP组;滑窗模块,用于基于滑窗法得到每个所述LncRNA的突变热点区域,组成突变热点区域组;显著性分析模块,用于基于超几何分布法对所述突变热点区域组进行显著性分析得到显著组数据;排秩模块,用于对所述显著组数据内的SNP进行打分和排秩,得到顺序SNP数据库;基于所述顺序SNP数据库构建LncRNA平台,用户通过所述LncRNA平台进行学习。本发明能准确识别出能使LncRNA发生改变的SNP,并基于此构建学习平台,以供研究者和医务人员进行研究学习。

    一种非编码RNA调控疾病风险靶通路的识别方法及系统

    公开(公告)号:CN111899788A

    公开(公告)日:2020-11-06

    申请号:CN202010641994.0

    申请日:2020-07-06

    Abstract: 本发明公开了一种非编码RNA调控疾病风险靶通路的识别方法及系统,所述识别方法,基于lncRNA表达谱、lncRNA-蛋白编码基因的关联互作网络,结合通路中基因在疾病中的表达失调程度,考虑通路中基因与表达失调lncRNA关联、基因的表达失调程度、通路的拓扑结构等多方面因素。能够精细识别了不同疾病类型中lncRNA调控的风险通路区域。实现系统识别复杂疾病中lncRNA调控影响的风险靶通路,能够揭示lncRNA在疾病中的调控作用及功能,从非编码RNA调控的角度为复杂疾病的致病机制研究提供了新的参考。

    一种药物敏感性相关LncRNA-转录因子-靶基因调控三元组识别方法、设备及介质

    公开(公告)号:CN119028428A

    公开(公告)日:2024-11-26

    申请号:CN202411111652.2

    申请日:2024-08-13

    Abstract: 本申请公开了一种药物敏感性相关LncRNA‑转录因子‑靶基因调控三元组识别方法、设备及介质,涉及数据处理领域,该方法基于LncRNA/mRNA表达谱、药物敏感性数据,结合转录因子‑靶(蛋白编码)基因调控关系,充分考虑了LncRNA能够介导转录因子对靶基因的调控,进而影响药物的敏感性这一作用机制。同时,准确地为单个癌症患者筛选出了合适的治疗药物以及为每一个药物预测其敏感性相关的细胞系。并且,进一步揭示与药物敏感性相关非编码调控三元组中LncRNA在不同药物间差异的调控机制。本申请能够快速、方便、准确地识别药物敏感性相关LncRNA‑转录因子‑靶基因调控三元组。

    一种非编码RNA调控疾病风险靶通路的识别方法及系统

    公开(公告)号:CN111899788B

    公开(公告)日:2023-08-18

    申请号:CN202010641994.0

    申请日:2020-07-06

    Abstract: 本发明公开了一种非编码RNA调控疾病风险靶通路的识别方法及系统,所述识别方法,基于lncRNA表达谱、lncRNA‑蛋白编码基因的关联互作网络,结合通路中基因在疾病中的表达失调程度,考虑通路中基因与表达失调lncRNA关联、基因的表达失调程度、通路的拓扑结构等多方面因素。能够精细识别了不同疾病类型中lncRNA调控的风险通路区域。实现系统识别复杂疾病中lncRNA调控影响的风险靶通路,能够揭示lncRNA在疾病中的调控作用及功能,从非编码RNA调控的角度为复杂疾病的致病机制研究提供了新的参考。

    一种安防门锁
    8.
    发明公开

    公开(公告)号:CN111350418A

    公开(公告)日:2020-06-30

    申请号:CN202010154175.3

    申请日:2020-03-07

    Applicant: 张云鹏

    Inventor: 张云鹏 唐杰

    Abstract: 本发明属于门锁技术领域,具体的说是一种安防门锁,包括锁壳、转动柱和密码按钮;所述锁壳的前端面靠近锁壳的右下角位置固连有芯柱;所述芯柱前端面于芯柱的轴线位置转动连接有转动柱;所述转动柱的前端面开设有插孔;所述插孔的内部插接有钥匙;所述转动柱的外弧面于转动柱的正上方位置开设有均匀布置的通孔;所述芯柱的内弧面于通孔位置均开设有滑动孔;所述滑动孔内部均上下滑动连接有第一滑柱;所述通孔的内部均滑动连接有第二滑柱;所述锁壳的前端面于芯柱的右上方位置设有均匀布置的密码按钮;通过本发明有效的防止了门锁破拆的成本,结构简单实用性较高,同时无需电力,应用范围广,适用于不同环境的要求。

    一种高中生用镊式电子测量装置

    公开(公告)号:CN109270310A

    公开(公告)日:2019-01-25

    申请号:CN201811118689.2

    申请日:2018-09-19

    Applicant: 张云鹏

    Inventor: 张云鹏

    Abstract: 本发明公开了一种高中生用镊式电子测量装置,包括笔杆及笔杆内部的微型电压表、微型电流表和AD转换模组,所述笔杆为圆柱形结构,且一侧构造有套接槽,所述笔杆的外缘构造有用于数据显示的曲型显示屏,所述曲型显示屏为LED显示屏,所述套接槽为环形槽状结构,且套接槽的一侧通过两组活动轴插接配合有测电镊,所述测电镊两瓣式结构,且测电镊的两瓣式镊体间靠近套接槽的一端设置有弹簧,所述弹簧与测电镊的两瓣式镊体抵接处垫设有不导电的硅胶垫,且套接槽外套接设置有橡胶套,所述笔杆远离套接槽的一端连接有便于翻转记录数据的书写笔头。该高中生用镊式电子测量装置,结构合理,便于使用,有效测量电路电压电流,具有较高的实用价值。

    一种可自动排渣的旋转式废水过滤装置

    公开(公告)号:CN108635953A

    公开(公告)日:2018-10-12

    申请号:CN201810558666.7

    申请日:2018-06-01

    Applicant: 张云鹏

    Inventor: 张云鹏

    Abstract: 本发明公开了一种可自动排渣的旋转式废水过滤装置,包括过滤箱本体、底座、支架、沉淀箱、变频电机、水泵和控制器,所述过滤箱本体和支架均安装在所述底座上,所述过滤箱本体内设有过滤腔,所述支架上插装有伸入所述过滤腔的中空转轴,所述中空转轴右端伸出所述支架且安装有从动皮带轮和旋转接头,所述旋转接头另一端连有进水管,所述进水管与所述沉淀箱连接,所述变频电机通过主动皮带轮和传动皮带带动从动皮带轮转动,所述过滤腔内设有与中空转轴连接的第一过滤筒和第二过滤筒,所述第一过滤筒和所述第二过滤筒上均设有螺纹线和过滤孔,所述过滤腔上端内壁安装有冲洗管。本发明的有益效果是,结构简单,实用性强。

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