甜瓜液相芯片及应用
    2.
    发明公开

    公开(公告)号:CN118421817A

    公开(公告)日:2024-08-02

    申请号:CN202311235307.5

    申请日:2023-09-22

    Abstract: 本发明公开了一种甜瓜液相芯片及应用,所述液相芯片包括甜瓜5K位点探针混合液和杂交捕获试剂;所述甜瓜5K位点探针混合液包括5008个SNP位点探针,所述5008个SNP位点探针包括4860个甜瓜普通SNP位点探针和148个甜瓜核心功能SNP位点探针。所述SNP位点是将不同基因型甜瓜种质的重测序数据比对至甜瓜参考基因组DHL92V3.6.1后,进行过滤、评估获得。本发明的甜瓜全基因组液相芯片可以实现甜瓜快速基因分型,实验结果表明该检测效率高,下机数据能够应用于甜瓜种质资源的评价分析、NIL遗传群体构建、基因定位和分子辅助育种等领域,为甜瓜分子育种提供重要的技术支撑。

    基于QTL位点互作预测甜瓜果实长度的方法及相关分子标记

    公开(公告)号:CN116004896B

    公开(公告)日:2025-04-22

    申请号:CN202211612073.7

    申请日:2022-12-13

    Abstract: 本发明公开了一种基于QTL位点互作预测甜瓜果实长度的方法及相关分子标记,属于分子遗传育种技术领域,具体涉及了甜瓜果实长度主效QTL位点qFL2.1和qFL8.1,进一步提供两个主效位点间不同基因型协同调控果实长度的互作方式,利用互作方式,可以预测甜瓜果实长度。并涉及与两个主效位点紧密连锁的InDel分子标记及其应用,分子标记A02‑InDel与QTL位点qFL2.1紧密连锁,能够通过如SEQ ID NO.1‑2所示的引物对扩增得到;分子标记A08‑InDel与QTL位点qFL8.1紧密连锁,能够通过如SEQ ID NO.3‑4所示的引物对扩增得到。采用本发明的分子标记组合,可预测位点间不同基因型之间的互作方式,从而能够准确选择不同果实长度的甜瓜材料,具有选择精准率高的突出特点,可以有效提高甜瓜果实长度育种效率。

    甜瓜的遗传转化方法和应用
    4.
    发明公开

    公开(公告)号:CN119320797A

    公开(公告)日:2025-01-17

    申请号:CN202411470191.8

    申请日:2024-10-21

    Abstract: 本发明提供了一种甜瓜的遗传转化方法和应用。其中,所述遗传转化方法,包括:将经侵染的甜瓜外植体与农杆菌工程菌在无糖培养基中进行共培养处理,其中,所述无糖培养基中不含有可溶性糖。使用上述方法可以将共培养时间延长至7~9天,可以显著提高农杆菌的侵染效率,并且可以减缓农杆菌的生长,避免芽诱导过程的农杆菌污染,同时降低共培养过程外植体的免疫反应,进一步提高了遗传转化效率。与采用现有的含糖培养基的共培养时间持续4天的甜瓜遗传转化方法相比,本发明提供的上述遗传转化方法采用无糖培养基并将共培养时间延长到8天,可以使甜瓜转基因效率提高14倍以上。本发明还提供一种上述遗传转化方法在制备甜瓜遗传转化产品中的应用。

    基于QTL位点互作预测甜瓜果实长度的方法及相关分子标记

    公开(公告)号:CN116004896A

    公开(公告)日:2023-04-25

    申请号:CN202211612073.7

    申请日:2022-12-13

    Abstract: 本发明公开了一种基于QTL位点互作预测甜瓜果实长度的方法及相关分子标记,属于分子遗传育种技术领域,具体涉及了甜瓜果实长度主效QTL位点qFL2.1和qFL8.1,进一步提供两个主效位点间不同基因型协同调控果实长度的互作方式,利用互作方式,可以预测甜瓜果实长度。并涉及与两个主效位点紧密连锁的InDel分子标记及其应用,分子标记A02‑InDel与QTL位点qFL2.1紧密连锁,能够通过如SEQ ID NO.1‑2所示的引物对扩增得到;分子标记A08‑InDel与QTL位点qFL8.1紧密连锁,能够通过如SEQ ID NO.3‑4所示的引物对扩增得到。采用本发明的分子标记组合,可预测位点间不同基因型之间的互作方式,从而能够准确选择不同果实长度的甜瓜材料,具有选择精准率高的突出特点,可以有效提高甜瓜果实长度育种效率。

    在甜瓜毛状根中验证CRISPR或Cas9载体活性及基因功能的方法

    公开(公告)号:CN119082175A

    公开(公告)日:2024-12-06

    申请号:CN202411240080.8

    申请日:2024-09-05

    Abstract: 本发明公开了在甜瓜毛状根中验证CRISPR或Cas9载体活性及基因功能的方法,使用萌发两天的甜瓜种子的子叶作为外植体,利用发根农杆菌K599进行侵染,经过共培养,毛状根诱导,以绿色荧光蛋白eGFP作为转基因毛状根的筛选标记,可在1个月左右获得转化CRISPR/Cas9载体的毛状根。利用该转化材料,我们分析了多个基因的基因编辑靶位点的可用性,发现增加sgRNA表达单元拷贝数对于基因编辑效率具有促进作用,并且我们发现CmRHL1被编辑后,甜瓜根毛不能形成。因此,本发明为验证CRISPR/Cas9载体活性以及研究基因在根发育过程中的功能,提供了一种方便、快捷的途径,对于甜瓜的稳定遗传转化方法是一个有利补充。

    与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN115852031B

    公开(公告)日:2023-07-25

    申请号:CN202211449316.X

    申请日:2022-11-18

    Abstract: 本发明提供了一种与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记,甜瓜4号染色体上包含4个SNP标记,分别为:标记Chr4_12085945,等位基因T/C;标记Chr4_12894435,等位基因T/A;标记Chr4_13382545,等位基因C/T;标记Chr4_15435120,等位基因C/A。其中SNP标记Chr4_13382545位点与甜瓜种子长度、宽度、千粒重三个性状相关,可准确区分甜瓜种子大小。本发明还提供一种上述SNP标记在甜瓜种子大小性状分子标记辅助育种中的应用,能提高选择的准确性、加快新品种培育的进程。本发明提供一种利用上述SNP标记筛选甜瓜种子大小的方法。

    一种基于芽真空侵染的甜瓜VIGS沉默体系的构建方法

    公开(公告)号:CN116355951A

    公开(公告)日:2023-06-30

    申请号:CN202211453013.5

    申请日:2022-11-21

    Abstract: 本发明公开了一种基于芽真空侵染的甜瓜VIGS沉默体系的构建方法,选择pTRSV2为重组载体,去除种皮的芽萌发长度1‑2cm的甜瓜种子为受体材料,以体积比1:1的辅助载体pTRSV1与pTRSV2‑目的基因重组载体的混合菌液进行真空侵染,侵染条件为:侵染压强为0.9kPa、菌液浓度OD600=1.0、侵染时间5min。同时,我们以甜瓜八氢番茄红素脱氢酶基因CmPDS为例,对本发明体系进行了应用验证,结果显示该沉默体系可显著降低甜瓜中CmPDS的表达量,植株沉默率为85%。相对于子叶注射法,甜瓜芽真空侵染法时效更快,一般在侵染后1周一叶一心时期就可快速显现沉默表型,有利于在苗期快速挖掘和研究甜瓜重要农艺性状相关基因,该沉默体系也克服了甜瓜遗传转化体系不成熟、效率低、周期长的不足。

    与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记及其应用

    公开(公告)号:CN115852031A

    公开(公告)日:2023-03-28

    申请号:CN202211449316.X

    申请日:2022-11-18

    Abstract: 本发明提供了一种与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记,甜瓜4号染色体上包含4个SNP标记,分别为:标记Chr4_12085945,等位基因T/C;标记Chr4_12894435,等位基因T/A;标记Chr4_13382545,等位基因C/T;标记Chr4_15435120,等位基因C/A。其中SNP标记Chr4_13382545位点与甜瓜种子长度、宽度、千粒重三个性状相关,可准确区分甜瓜种子大小。本发明还提供一种上述SNP标记在甜瓜种子大小性状分子标记辅助育种中的应用,能提高选择的准确性、加快新品种培育的进程。本发明提供一种利用上述SNP标记筛选甜瓜种子大小的方法。

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