一种矫正同源重组修复缺陷评分的方法及装置

    公开(公告)号:CN114283889B

    公开(公告)日:2024-12-10

    申请号:CN202111616188.9

    申请日:2021-12-27

    Abstract: 一种矫正同源重组修复缺陷评分的方法及装置,该方法包括:矫正步骤,包括按如下公式对同源重组修复缺陷评分进行矫正,获得矫正后的同源重组修复缺陷评分:HRD score矫正=LOH score+(1‑α*WGD)*LST score+(1‑β*WGD)*TAI score;HRD score矫正是指矫正后的同源重组修复缺陷评分,LOH score是指杂合性缺失评分,LST score是指大片段迁移评分,TAI score是指端粒等位基因不平衡评分,WGD是指全基因组复制信息值,α和β是指矫正系数。通过对同源重组修复缺陷评分进行矫正,有效提高同源重组修复缺陷评估的准确性,为癌症患者用药提供指导。

    一种矫正同源重组修复缺陷评分的方法及装置

    公开(公告)号:CN114283889A

    公开(公告)日:2022-04-05

    申请号:CN202111616188.9

    申请日:2021-12-27

    Abstract: 一种矫正同源重组修复缺陷评分的方法及装置,该方法包括:矫正步骤,包括按如下公式对同源重组修复缺陷评分进行矫正,获得矫正后的同源重组修复缺陷评分:HRD score矫正=LOH score+(1‑α*WGD)*LST score+(1‑β*WGD)*TAI score;HRD score矫正是指矫正后的同源重组修复缺陷评分,LOH score是指杂合性缺失评分,LST score是指大片段迁移评分,TAI score是指端粒等位基因不平衡评分,WGD是指全基因组复制信息值,α和β是指矫正系数。通过对同源重组修复缺陷评分进行矫正,有效提高同源重组修复缺陷评估的准确性,为癌症患者用药提供指导。

    基于RNAseq数据的融合基因检测方法、装置和存储介质

    公开(公告)号:CN112164423B

    公开(公告)日:2021-03-23

    申请号:CN202011098214.9

    申请日:2020-10-14

    Abstract: 本申请公开了一种基于RNAseq数据的融合基因检测方法、装置和存储介质。本申请方法包括,对原始下机数据进行质控,评估有效比对数据量、外显子比对率、污染率等情况;通过阳性和阴性标准品融合基因检出情况对比筛选融合基因检测软件;保留热点融合基因列表,过滤假阳性融合基因列表,针对标准品中假阳性融合检出情况设置支持读段过滤规则,降低假阳性检出比例;并针对基因内部分外显子缺失引起的融合突变进行软件开发和过滤规则制定。本申请方法综合数据质控评估、软件性能评估、过滤规则制定、外显子缺失分析等多种方案,既保证融合基因更全面地检出,又最大限度降低假阳性和假阴性比例,对临床用药指导和疾病诊断提供更全面精准的指导。

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