公开(公告)号：KR101325322B1

公开(公告)日：2013-11-08

申请号：KR1020110072455

申请日：2011-07-21

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 김동욱 ,  고현경

IPC: C12N15/63 ,  C12N15/62 ,  C12Q1/68

Abstract: 본 발명은 BCR-BCR-ABL 융합 유전자를 포함한 정량분석용 표준 플라스미드 및 이를 이용한 BCR-ABL 유전자의 정량분석 방법에 관한 것으로서, 보다 구체적으로는 서열번호 7로 표시되는 BCR-BCR-ABL 유전자의 염기서열을 포함하는 백혈병의 예측 또는 진단을 위한 정량분석용 표준 플라스미드 및 상기 표준 플라스미드를 이용하여 시료에 존재하는 BCR-ABL의 발현양을 정량 분석하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 상기 백혈병의 예측 또는 진단을 위한 정량분석용 표준 플라스미드는 백혈병 특이 유전자인 BCR-ABL 및 모든 세포내에서 비교적 안정적으로 일정량 발현되는 BCR 유전자가 융합된 BCR-BCR-ABL가 도입되어 있어, 하나의 플라스미드에 2개의 표준물질이 함께 포함되어 있기 때문에 PCR을 통한 백혈병 진단시 상기 플라스미드를 표준정량곡선 산출을 위한 용도로 사용할 경우, 기존 PCR 방법에 비해 시료에 존재하는 BCR-ABL의 발현양을 간편하고 정확하게 측정할 수 있는 효과가 있다.

公开(公告)号：KR1020120010184A

公开(公告)日：2012-02-02

申请号：KR1020110072454

申请日：2011-07-21

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 김동욱 ,  고현경

IPC: C12N15/63 ,  C12N15/62 ,  C12Q1/68

CPC classification number: C12N15/63 ,  C12N15/62 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/118

Abstract: PURPOSE: A standard plasmid containing GUS-BCR-ABL fusion gene for quantitative analysis is provided to simply and accurately measure BCR-ABL expression level in a sample. CONSTITUTION: A standard plasmid for quantitative analysis for predicting or diagnosing leukemia contains a base sequence of GUS-BCR-ABL of sequence number 7. The plasmid is pGUS-BCR-ABL. A method for quantitative analysis of BCR-ABL expression level in a sample using the standard plasmid comprises: a step of diluting the standard plasmid by concentration; a step of performing PCR of the standard plasmid and nucleic acids prepared from a biological sample using PCR primer set which is specific to BCR-ABL and GUS gene; a step of measuring PCR product using the standard plasmid and calculating standard quantitative curve; and a step of calculating expression level of BCR-ABL and GUS of the sample.

Abstract translation: 目的：提供含有用于定量分析的GUS-BCR-ABL融合基因的标准质粒，简单而准确地测量样品中的BCR-ABL表达水平。 构成：用于预测或诊断白血病的定量分析的标准质粒含有序列号7的GUS-BCR-ABL的碱基序列。质粒是pGUS-BCR-ABL。 使用标准质粒定量分析样品中BCR-ABL表达水平的方法包括：通过浓缩稀释标准质粒的步骤; 使用对BCR-ABL和GUS基因特异的PCR引物组进行标准质粒和由生物样品制备的核酸的PCR的步骤; 使用标准质粒测定PCR产物并计算标准定量曲线的步骤; 以及计算样品的BCR-ABL和GUS的表达水平的步骤。

公开(公告)号：KR101820572B1

公开(公告)日：2018-01-19

申请号：KR1020150113704

申请日：2015-08-12

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단 ,  성균관대학교산학협력단

Inventor： 김동욱 ,  김수현 ,  김홍태 ,  한승훈

IPC: G01N33/574 ,  C12Q1/68 ,  A61K31/7105

CPC classification number: A61K31/7105 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/574

Abstract: 본발명은 CobII1(Cordon-bleu protein-like 1)을이용한만성골수성백혈병에관한정보제공방법에관한것으로, 보다자세하게는만성골수성백혈병에서급성기로의전환진단, 만성골수성백혈병에서급성기로전환된이후의예후예측, 타이로신카이네이즈억제제를포함한만성골수성백혈병의각종치료제에대한저항성등과같은다양한정보를동시에제공할수 있을뿐만아니라, 기존의 BCR-ABL1 유전자측정에의하여예측및 진단되지못했던환자들을진단하는데사용될수 있기때문에만성골수성백혈병의진행, 재발, 약물내성등 다양한예후예측및 진단에사용될수 있을것으로기대된다. 또한, 본발명의 CobII1 mRNA에특이적으로결합하는올리고뉴클레오티드를이용하면 CobII1 단백질의발현을억제하여효과적으로세포증식및 약물에대한저항성을억제하여, 만성골수성백혈병의치료및 만성골수성백혈병의급성기로의전환을효과적으로억제할수 있을것으로기대된다.

Abstract translation: 本发明CobII1（蓝带-布鲁蛋白样1）的使用，因为本发明涉及到急性期提供信息有关的慢性髓细胞性白血病，和更特别地在急性期的CML切换转换诊断，慢性髓细胞性白血病的方法 预后，酪氨酸激酶它抑制剂，以及能够提供各种信息，例如对各种药物用于治疗慢性髓性白血病阻力的同时，其包括被用于诊断通过常规BCR-ABL1基因测量预报患者和已确诊 因此，预计可用于预测和诊断各种预后，如慢性骨髓性白血病的进展，复发和耐药性。 此外，寡核苷酸能结合本发明的CobII1的mRNA eteuk传输使用该寡核苷酸以抑制CobII1蛋白质有效的细胞增殖的表达和抑制耐药性，慢性髓细胞性白血病和慢性髓细胞性白血病的转化在急性期 预计它将能够有效抑制。

公开(公告)号：KR101326367B1

公开(公告)日：2013-11-11

申请号：KR1020060062231

申请日：2006-07-03

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 정연준 ,  김동욱 ,  김진우

IPC: C12Q1/68 ,  A61K31/70

Abstract: 본 발명은 항암제 저항성의 진단 방법 및 진단 키트에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 만성 골수성 백혈성 (chronic myelogenous leukemia; CML)을 치료하는 약제에 대한 저항성 (drug resistance)을 예측하는 유전자, 이를 이용하는 항암제 저항성의 진단 방법 및 진단 키트에 관한 것이다. 본 발명의 진단 방법 및 진단 키트는 항암제인 이마티닙 (imatinib)에 대한 저항성을 부여하는 유전자 발현 신호를 다양한 저항성 유전자군을 사용하여 감지하는 과정으로, 만성 골수성 백혈병을 포함한 각종 암을 효과적으로 진단하고 치료하며 더 나아가 글리벡에 대한 저항성 기작을 연구하는 데 널리 사용될 수 있다.
항암제 저항성, 이마티닙 (imatinib), 저항성 유전자군, 만성 골수성 백혈병 (CML), 진단 키트

公开(公告)号：KR1020130083185A

公开(公告)日：2013-07-22

申请号：KR1020120003808

申请日：2012-01-12

Applicant: 건국대학교 산학협력단 ,  가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 채치범 ,  김동욱 ,  강종훈 ,  최수영

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q2600/172 ,  C12Q2600/118

Abstract: PURPOSE: A method for detecting a chronic myelogenous leukemia fusion genotype using a capture probe and a primer is provided to remarkably improve sensitivity, to shorten detection time, and to automate detection steps by simultaneously performing reverse transcriptase (RT)-PCR, asymmetric PCR, and hybridization. CONSTITUTION: A capture probe for genotyping of chronic myelogenous leukemia contains base sequences selected from a group consisting of sequence numbers 6, 7, 8, 9, 11, and 12. A primer for genotyping of chronic myelogenous leukemia contains base sequences selected from the group consisting of sequence numbers 2-4. A method for detecting a chronic myelogenous leukemia fusion genotype comprises the steps of: crushing cells extracted from bone marrow or peripheral blood and acquiring a cell extract; mixing the cell extract, a primer set, DNA polymerase, reverse transcriptase, dNTP (dATP, dCTP, dTTP, dGTP), and a buffer solution and preparing a reaction mixture; transferring the reaction mixture onto the surface of a solid support on which a capture probe for genotyping is fixed; performing RT-PCR using RNA to prepare cDNA; amplifying BCR-ABL gene of cDNA by asymmetric PCR; denaturing the amplified gene; hybridizing the denatured gene with the capture probe and promoting the formation of a branched nucleic acid complex; and detecting the branched nucleic acid complex.

Abstract translation: 目的：提供使用捕获探针和引物检测慢性骨髓性白血病融合基因型的方法，以显着提高灵敏度，缩短检测时间，并通过同时进行逆转录酶（RT）-PCR，不对称PCR， 和杂交。 构成：用于慢性骨髓性白血病基因分型的捕获探针含有选自序列号6,7,8,9,11和12的碱基序列。用于慢性骨髓性白血病基因分型的引物含有选自下组的碱基序列 由序列号2-4组成。 用于检测慢性骨髓性白血病融合基因型的方法包括以下步骤：粉碎从骨髓或外周血提取的细胞并获取细胞提取物; 混合细胞提取物，引物组，DNA聚合酶，逆转录酶，dNTP（dATP，dCTP，dTTP，dGTP）和缓冲溶液并制备反应混合物; 将反应混合物转移到其上固定有用于基因分型的捕获探针的固体支持物的表面上; 使用RNA进行RT-PCR以制备cDNA; 通过不对称PCR扩增cDNA的BCR-ABL基因; 使扩增的基因变性; 将变性基因与捕获探针杂交并促进支链核酸复合物的形成; 并检测支链核酸复合物。

公开(公告)号：KR1020120015422A

公开(公告)日：2012-02-21

申请号：KR1020110072455

申请日：2011-07-21

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 김동욱 ,  고현경

IPC: C12N15/63 ,  C12N15/62 ,  C12Q1/68

CPC classification number: C12N15/63 ,  C12N15/62 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/118

Abstract: PURPOSE: A standard plasmid for quantitative analsis, containing BCR-BCR-ABL fusion gene is provided to simply and accurately measure BCR-ABL expression level in a test sample. CONSTITUTION: A standard plasmid for quantitative analysis for predicting or diagnosing leukemia contains a base sequence of BCR-BCR-ABL gene of sequence number 7. The plasmid is pBCR-BCR-ABL. A method for quantitation of BCR-ABL expression level in a test sample using the standard plasmid comprises: a step of diluting the standard plasmid by concentration; a step of performing PCR of the standard plasmid and a nucleic acid from the sample using specific PCR primer set; and a step of measuring PCR production amount to obtain standard quantitative curve.

Abstract translation: 目的：提供含有BCR-BCR-ABL融合基因的定量麻醉标准质粒，简便准确测定样本中的BCR-ABL表达水平。 构成：用于预测或诊断白血病的定量分析的标准质粒含有序列号7的BCR-BCR-ABL基因的碱基序列。质粒是pBCR-BCR-ABL。 使用标准质粒定量测试样品中BCR-ABL表达水平的方法包括：通过浓缩稀释标准质粒的步骤; 使用特异性PCR引物对来自样品的标准质粒和核酸进行PCR的步骤; 并测定PCR产生量以获得标准定量曲线的步骤。

公开(公告)号：KR100894511B1

公开(公告)日：2009-04-24

申请号：KR1020060070818

申请日：2006-07-27

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 윤정호 ,  김영준 ,  김성한 ,  이우진 ,  김자은 ,  이한용 ,  유창혁 ,  김동욱 ,  고현경

IPC: C12Q1/68 ,  G01N33/53

Abstract: 본 발명은 기존의 다단계 RT-PCR 방법을 사용한 만성골수성백혈병(Chronic Myeloid Leukemia) 진단 방법을 개선하여, 단 한 번의 다중 RT-PCR (multiplex RT-PCR) 을 통해 만성골수성백혈병을 진단할 수 있는 프라이머를 포함하는 조성물 및 이 조성물을 함유하는 키트에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 상기 키트를 사용하여 만성골수성백혈병 진단하는 지표가 될 수 있는 BCR-ABL 유전자의 증폭 방법에 관한 것이다.
만성골수성백혈병, 다중 RT-PCR, BCR-ABL

公开(公告)号：KR1020080003692A

公开(公告)日：2008-01-08

申请号：KR1020060062231

申请日：2006-07-03

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 정연준 ,  김동욱 ,  김진우

IPC: C12Q1/68 ,  A61K31/70

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q1/686

Abstract: Diagnostic methods and kits for monitoring drug resistance is provided to inspect resistance to drug such as imatinib in various cancers including chronic myelogenous leukemia by measuring the expression level of imatinib resistant genes. A diagnostic kit for diagnosing resistance to drug in various cancers comprises the nucleic acid sequence encoding at least one imatinib resistant gene selected from CASP4, TNFRF21, RAB11A, IGF1, LYN and RHOA genes, and is used for treating chronic myelogenous leukemia. The resistance to drug in various cancers is determined by measuring the expression level of at least one gene selected from CASP4, TNFRF21, RAB11A, IGF1, LYN and RHOA genes by using PCR(polymerase chain reaction) or a microarray, wherein the primer sets for PCR-amplifying the CASP4, TNFRF21, RAB11A, IGF1, LYN and RHOA genes have the nucleotide sequences of SEQ ID NOs:1 and 2, SEQ ID NOs:3 and 4, SEQ ID NOs:5 and 6, SEQ ID NOs:7 and 8, SEQ ID NOs:9 and 10 and SEQ ID NOs:11 and 12, respectively.

Abstract translation: 提供了用于监测耐药性的诊断方法和试剂盒，以通过测量伊马替尼耐药基因的表达水平来检查各种癌症中包括伊马替尼在内的药物（包括慢性骨髓性白血病）的抗药性。 用于诊断各种癌症药物耐药性的诊断试剂盒包括编码至少一种选自CASP4，TNFRF21，RAB11A，IGF1，LYN和RHOA基因的伊马替尼耐药基因的核酸序列，并用于治疗慢性骨髓性白血病。 通过使用PCR（聚合酶链式反应）或微阵列测量选自CASP4，TNFRF21，RAB11A，IGF1，LYN和RHOA基因的至少一种基因的表达水平来确定各种癌症中药物的耐药性，其中引物组为 PCR扩增CASP4，TNFRF21，RAB11A，IGF1，LYN和RHOA基因具有SEQ ID NO：1和2，SEQ ID NO：3和4，SEQ ID NO：5和6，SEQ ID NO：7的核苷酸序列 和8，SEQ ID NO：9和10以及SEQ ID NO：11和12。

公开(公告)号：KR100652247B1

公开(公告)日：2006-12-08

申请号：KR1020040049814

申请日：2004-06-29

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 김동욱 ,  김유리

IPC: C12Q1/68

Abstract: 본 발명은 PCR 반응혼합물, BCR-ABL 융합유전자를 검출할 수 있는 프로브 및 프라이머 혼합물, ABL 유전자를 검출할 수 있는 프로브 및 프라이머 혼합물, BCR-ABL 표준 플라스미드 DNA, ABL 표준 플라스미드 DNA, BCR-ABL 음성대조군 및 ABL 음성대조군을 포함하는 BCR-ABL 정량키트 및 전기 키트를 이용하여 BCR-ABL 융합유전자를 정량하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 BCR-ABL 정량키트를 사용할 경우, 만성 골수성 백혈병의 원인이 되는 BCR-ABL 융합유전자의 재조합 정도를 보다 간편하고, 정확하게 정량할 수 있으므로, 만성 골수성 백혈병의 조기 진단 및 환자의 예후 모니터링에 널리 사용될 수 있을 것이다.
BCR-ABL 융합유전자, BCR-ABL 표준 플라스미드 DNA, ABL 표준 플라스미드 DNA

公开(公告)号：KR1020060000840A

公开(公告)日：2006-01-06

申请号：KR1020040049815

申请日：2004-06-29

Applicant: 가톨릭대학교 산학협력단

Inventor： 김동욱 ,  김유리

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6851

Abstract: 본 발명은 PCR 반응혼합물, PML-RARa 융합유전자를 검출할 수 있는 프로브 및 프라이머 혼합물, ABL 유전자를 검출할 수 있는 프로브 및 프라이머 혼합물, PML-RARa 표준 플라스미드 DNA, ABL 표준 플라스미드 DNA, PML-RARa 음성대조군 및 ABL 음성대조군을 포함하는 PML-RARa 정량키트 및 전기 키트를 이용하여 PML-RARa 융합유전자를 정량하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 PML-RARa 정량키트를 사용할 경우, 급성 전골수성 백혈병의 원인이 되는 PML-RARa 융합유전자의 재조합 정도를 보다 간편하고, 정확하게 정량할 수 있으므로, 급성 전골수성 백혈병의 정확한 진단에 널리 활용될 수 있을 것이다.
PML-RARa 융합유전자, PML-RARa 표준 플라스미드 DNA, ABL 표준 플라스미드 DNA