Abstract:
PURPOSE: A hot-start PCR method based on protein trans-splicing of Neq L fragment and Neq S fragment is provided to be used in a technique of preventing carryover contamination. CONSTITUTION: A hot-start PCR method based on protein trans-splicing of NeqL fragment and NeqS fragment containing intein comprises: a step of preparing a PCR reaction solution; a step of adding the NeqL fragment and NeqS fragment; a step of performing trans-splicing to form a polypeptide with NeqDNA polymerase activity; and a step of performing DNA denaturation, primer annealing, and elongation.
Abstract:
본 발명은 DNA 중합 활성(DNA polymerization activity) 및 교정 활성(proofreading activity)을 모두 갖고 있는 써모코커스 와이오타푸엔시스 유래의 DNA 중합효소( Thermococcus
waiotapuensis -derived DNA polymerase, 이하 ' Twa DNA 중합효소'라고 함)의 변이체들(variants)에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 점 돌연변이 방법으로 Twa DNA 중합효소의 501번째 아미노산인 아스파라진을 알지닌으로 치환시킨 돌연변이 써모코커스 와이오타푸엔시스 N501R DNA 중합효소( Thermococcus
waiotapuensis N501R DNA polymerase, Twa N501R DNA polymerase, 이하 ' Twa N501R DNA 중합효소'라고 함) 및 501번째 아미노산인 아스파라진을 라이신으로 치환시킨 돌연변이 써모코커스 와이오타푸엔시스 N501K DNA 중합효소( Thermococcus
waiotapuensis N501K DNA polymerase, Twa N501K DNA polymerase, 이하 ' Twa N501K DNA 중합효소'라고 함)에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 Twa DNA 중합효소를 코딩하는 핵산서열, 상기 핵산서열을 포함하는 벡터, 및 상기 벡터로 형질전환 된 미생물에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 Twa N501R DNA 중합효소와 Twa N501K DNA 중합효소를 코딩하는 핵산서열, 상기 핵산서열을 포함하는 벡터, 및 상기 벡터로 형질전환 된 미생물에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 상기 Twa DNA 중합효소, Twa N501R DNA 중합효소 및 Twa N501K DNA 중합효소의 제조 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 DNA 중합효소들은 기존의 상업적 DNA 중합효소와 비교하였을 때 높은 충실도(fidelity)를 가지며, 특히 Twa N501R DNA 중합효소와 Twa N501K DNA 중합효소는 야생형 Twa DNA 중합효소보다 월등히 향상된 DNA 증폭속도 및 증폭량 등을 가진다.
Abstract:
PURPOSE: A Thermococcus waiotapuensis DNA polymerase variant is provided to perform various nucleic acid polymerizations such as PCR, to improve PCR efficiency and amplification speed, and to be used for early diagnosis of genetic diseases, GMO and forensic medicine. CONSTITUTION: A Thermococcus waiotapuensis DNA polymerase variant is prepared by mutation of Thermococcus waiotapuensis-derived DNA polymerase at 501th amino acid from asparagines to arginine. The variant contains an amino acid of sequence number 23. A nucleic acid encodes the variant and has a base sequence of sequence number 22. pTWAN501R vector contains the nucleic acid. Rosetta(DE3) pLysS/pTWAN501R(deposit number KACC95108P) E.coli is transformed by the vector.
Abstract:
본 발명은 서열번호 1의 아미노산 서열로 이루어지는 나노아케움 이퀴탄스( Nanoarchaeum equitans ) 유래 DNA 중합효소 ( Neq DNA 중합효소)에서, 점 돌연변이에 의하여 523번째 아미노산인 알라닌이 알기닌으로 치환된, 서열번호 2의 아미노산 서열로 이루어진 돌연변이 Neq A523R DNA 중합효소에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 상기 돌연변이 Neq A523R DNA 중합효소를 코딩하는 핵산 서열로 이루어지는 유전자, 이 유전자를 포함하는 재조합 벡터, 상기 벡터로 형질전환된 형질전환체에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 돌연변이 Neq A523R DNA 중합효소를 포함하는 PCR 키트 및 Neq A523R DNA 중합효소의 제조방법에 대한 것이다. DNA 중합효소(DNA polymerase), 나노아케움 이퀴탄스(Nanoarchaeum equitans), 중합효소 연쇄 반응 (polymerase chain reaction), 효소 진행성(Processivity)
Abstract:
본 발명은 초고온성 고세균(hyperthermophilic archaea)인 써모코커스 래디오톨러런스( Thermococcus
radiotolerans ) 균주 유래의 신규 내열성 DNA 중합효소 (이하 ' Tra DNA polymerase'라 칭함)와 이를 암호화하는 핵산 분자 및 그 아미노산 서열, 상기 핵산 서열을 포함하는 벡터, 상기 벡터로 형질 전환된 대장균( Escherichia
coli )에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 상기 Tra DNA 중합효소의 제조 방법 및 상기 Tra DNA 중합효소를 포함하는 중합효소 연쇄반응 (polymerase chain reaction, 이하 'PCR'이라 칭함) 키트를 포함한다. 본 발명은 분자생물학 연구, 유전질환의 진단, 바이러스 유전자 및 암 유전자의 조기진단, 친자 확인, LMO 감별, 법의학적 연구 등 다양한 분야에 있어서 이용되어지고 있는 PCR 반응에서 가장 핵심적인 요소인 내열성 DNA 중합 효소로 제공될 수 있다는 점에서 의의가 있다. 특히, 본 발명의 Tra DNA 중합효소는 DNA 중합 활성(DNA polymerization activity) 및 교정 활성(proofreading activity)을 모두 가지고 있어 PCR 증폭시 에러율을 낮출 수 있으므로 정확성이 요구되는 PCR에 유용하게 사용될 수 있는 장점을 갖는다.
Abstract:
PURPOSE: A mutant Nanoarchaeum equitans Neq A523R DNA polymerase is provided to improve processivity and extension rate and to enhance specificity and amplification efficiency under the presence of dUTP. CONSTITUTION: A mutant Nanoarchaeum equitans Neq A523R DNA polymerase has an amino acid sequence of sequence number 2 in which 523th amino acid, alanine is substituted with arginine. A gene having a nucleic acid sequence encoding the polymerase has a sequence of sequence number 3. A recombinant vector contains the gene. The recombinant vector is Penpa523r. An E.coli transformed by the recombinant vector is Escherichia coli BL21-CodonPlus(DE3)-RIL/pENPA523R(deposit number: KCCM11031P). A method for preparing the polymerase comprises: a step of preparing the recombinant vector; a step of inserting the recombinant vector into a host cell for transformation; a step of culturing the transformant; and a step of collecting the polymerase from the transformant.
Abstract:
PURPOSE: Thermococcus pacificus DNA polymerase variant is provided to be used in a various way such as gene diagnosis and PCR reaction thanks to being high in DNA amplification and amplification speed during PCR. CONSTITUTION: DNA polymerase comprises amino acid sequences chosen from a group comprised of sequence number 9, 10 and 11. A recombinant vector comprises amino acid sequence coding the amino acid sequences above. A host cell is transformed into the recombinant vector. The method of manufacturing DNA polymerase comprises the following steps. A recombinant vector which comprises base sequence s coding the amino acid is manufactured. The recombinant vector is transformed into a host cell. The transformed cell is cultivated. Protein from the transformed cell is collected.
Abstract:
본 발명은, 인테인이 포함된 Neq L 대단편과 Neq S 소단편의 단백질 트랜스 스플라이싱을 기반으로 한 핫-스타트 PCR 수행방법에 대한 것이다. 구체적으로 본 발명은, 샘플 DNA 및 프라이머를 포함하는 PCR 반응 용액을 준비하고; 579번에서 676번까지의 인테인 아미노산 서열을 포함하는 서열번호 2의 아미노산 서열로 이루어지는 Neq 대단편과, 1번에서 30번까지의 인테인 아미노산 서열을 포함하는 서열번호 4의 아미노산 서열로 이루어지는 Neq 소단편을 상기 PCR 반응 용액에 함께 첨가하고; 상기 PCR 반응 용액 내의 상기 Neq L 대단편과 Neq S 소단편의 단백질 트랜스 스플라이싱 과정을 통해 Neq DNA 중합효소 활성을 가지는 폴리펩타이드를 형성하고; 그리고 일련의 DNA 변성, 프라이머 어닐링 및 신장 단계를 포함하는 핫-스타트 PCR 수행방법에 관한 것이다.
Abstract:
A DNA polymerase (Neq DNA polymerase) derived from Nanoarchaeum equitans is divided into a Neq DNA polymerase large fragment (NeqL) and a NeqDNA polymerase small fragment (NeqS), and the fragments have intein respectively. The present invention connects inteins of the NeqL fragment and the NeqS fragment into one and provides a Neq hot-start (HS) DNA polymerase in a form of a precursor of the Neq DNA polymerase. The Neq HS DNA polymerase has an advantage of reducing inconvenience of being used for hot-start PCR by an intein trans splicing by purifying the existing NeqL fragment and NeqS fragment respectively. Especially, six histidine (His-tag) sequence is inserted in the level of gene between the intein of the NeqL fragment and the intein of NeqS fragment to significantly improve the purifying method. Additionally, as a result of an effort for increasing PCR efficiency of Neq HS DNA polymerase, mutation is induced on a specific part of Neq HS DNA polymerase genes to select Neq HS mutant polymerases (M1, M2, and M3) having significantly improved PCR amplification rate and amplification amount.