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公开(公告)号:WO2016200099A2
公开(公告)日:2016-12-15
申请号:PCT/KR2016/005907
申请日:2016-06-03
Applicant: 충남대학교산학협력단 , 한국기초과학지원연구원
Abstract: 본 발명은 인간 타액 특이적 당사슬을 이용하여 인간 타액을 검증하는 방법에 관한 것이다. 인간 타액을 비롯한 인간 체액들과 쥐 타액 등을 대상으로 N-당사슬을 분리 및 정제하여 질량분석을 수행한 결과, 인간 타액에는 네 개 이상의 퓨코스를 포함하는 고퓨코실화 N-당사슬이 50% 이상 함유되어 다른 인간 체액이나 다른 동물의 타액과 구별되는 특징이 있어, 법의학 분야 등에 응용할 수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及通过使用人唾液特异性糖链检测人唾液的方法。 通过使用包含人唾液,大鼠唾液等的人体液体的N-聚糖分离和纯化进行质谱分析,结果表明,人唾液与其他动物的其他人体液或唾液不同,其特征在于由 包含至少4个岩藻糖的至少50%高度岩藻糖化的N-聚糖,因此本发明可以应用于取证领域等。
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公开(公告)号:WO2014051220A1
公开(公告)日:2014-04-03
申请号:PCT/KR2013/000496
申请日:2013-01-22
Applicant: 한국기초과학지원연구원
CPC classification number: G06F19/16 , C12Q1/37 , G01N30/86 , G01N33/6848 , G01N2030/8813 , G01N2030/8831 , G01N2400/00 , G01N2440/38 , G01N2560/00 , G01N2570/00 , H01J49/0027 , H01J49/0036 , H01J49/004
Abstract: 본 발명은 고분해능 질량분석기로부터 얻은 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 일반 펩티드에 비해 상대적으로 낮은 감도 또는 농도로 존재하는 당펩티드를 효율적이고 정확히 동정 및 정량화하여, 질병 표지자(Biomarker)인 당펩티드를 발견하여 효과적으로 암을 예측, 진단할 수 있는 기술에 유용하게 사용될 수 있다.
Abstract translation: 本发明通过使用从高分辨率质谱仪获得的质谱结果,有效和准确地鉴定和定量与一般肽相比具有相对较低灵敏度或浓度的糖肽,因此可有效地用于能够有效地 通过检测作为生物标志物的糖肽来预测和诊断癌症。
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公开(公告)号:KR1020120124767A
公开(公告)日:2012-11-14
申请号:KR1020110042607
申请日:2011-05-04
Applicant: 한국기초과학지원연구원
IPC: G01N33/50 , G06F19/10 , B01D59/44 , G01N33/574
Abstract: PURPOSE: A method for analyzing mass spectrometry result using a mass spectrometer of high resolution(MALDI FT-ICR) is provided to efficiently and accurately identify and quantitate saccharides and to predict and diagnose cancer. CONSTITUTION: A new bioinformatics platform for identifying N-glycans from blood sample comprises: a step of analyzing saccharides hydrolyzed by PNGase F using a mass spectrometer of high resolution(MALDI FT-ICR) to obtain mass spectrum; a step of removing noise from the mass spectrum, selecting peak, and preparing a peak list; a step of grouping isotopes of the peak list; a step of modeling isotopic distribution from saccharide database in the peak list; a step of calculating S-score and identifying saccharides with 4.5 or more of S-score; a step of analyzing correlation based on the identified saccharides and identifying branching N-glycan; and a step of preparing profiling and correlation map.
Abstract translation: 目的:提供使用高分辨率质谱仪(MALDI FT-ICR)分析质谱结果的方法,以有效和准确地鉴定和定量糖类并预测和诊断癌症。 构成:用于从血液样品中鉴定N-聚糖的新的生物信息学平台包括:使用高分辨率质谱仪(MALDI FT-ICR)分析由PNGase F水解的糖类以获得质谱的步骤; 从质谱中去除噪声的步骤,选择峰值和准备峰值列表; 峰值列表同位素分组的步骤; 在峰值列表中从糖类数据库建模同位素分布的步骤; 计算S评分并鉴定S评分4.5以上的糖类的步骤; 基于鉴定的糖分析相关性并鉴定支链N-聚糖的步骤; 并准备剖析和相关图的步骤。
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公开(公告)号:KR101311412B1
公开(公告)日:2013-09-25
申请号:KR1020110042607
申请日:2011-05-04
Applicant: 한국기초과학지원연구원
IPC: G01N33/50 , G06F19/10 , B01D59/44 , G01N33/574
Abstract: 본 발명은 혈액내 당단백질에 당(N-glycan)의 동정을 위해 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)를 이용한 질량 스펙트럼 검색 결과를 분석하는 방법에 대한 것으로, 구체적으로 당 절단 효소에 의해 분리된 당을 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계(단계 1); 상기 질량 스펙트럼에서 노이즈를 제거하고, 피크를 선택하여 피크의 리스트를 작성하는 단계(단계 2); 상기 피크 리스트에서 동위원소들을 그룹화하는 단계(단계 3); 상기 피크 리스트에서 당 데이터베이스로부터 이론적으로 가능한 동위원소 분포를 모델링하는 단계(단계 4); S-스코어를 계산하고, S-스코어가 4.5 이상인 당을 동정하는 단계(단계 5); 상기 동정된 당을 기본으로 하여 상관관계 분석을 통하여 추가적으로 당(Branching N-glycan)을 동정하는 단계(단계 6); 상기 동정된 당들을 확인하고, 프로파일링 및 상관관계 맵을 작성하는 단계(단계 7)를 포함하는 생물정보처리 분석 방법에 관한 것이다. 본 발명은 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로부터 얻은 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 상대적으로 낮은 감도(또는 농도)로 존재하는 당을 효율적이고 정확히 동정 및 정량화하여, 질병 표지자(Biomarker)인 당을 발견하여 효과적으로 암을 예측, 진단할 수 있는 기술에 유용하게 사용될 수 있다.
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公开(公告)号:KR101672717B1
公开(公告)日:2016-11-17
申请号:KR1020150082601
申请日:2015-06-11
Applicant: 충남대학교산학협력단 , 한국기초과학지원연구원
Abstract: 본발명은인간타액특이적당사슬을이용하여인간타액을검증하는방법에관한것이다. 인간타액을비롯한인간체액들과쥐 타액등을대상으로 N-당사슬을분리및 정제하여질량분석을수행한결과, 인간타액에는네 개이상의퓨코스를포함하는고퓨코실화 N-당사슬이 50% 이상함유되어다른인간체액이나다른동물의타액과구별되는특징이있어, 법의학분야등에응용할수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及通过使用人唾液特异性糖链检测人唾液的方法。 通过使用包含人唾液,大鼠唾液等的人体液体的N-聚糖分离和纯化进行质谱分析,结果表明,人唾液与其他动物的其他人体液或唾液不同,其特征在于由 包含至少4个岩藻糖的至少50%高度岩藻糖化的N-聚糖,因此本发明可以应用于取证领域等。
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公开(公告)号:KR101341591B1
公开(公告)日:2013-12-16
申请号:KR1020120108011
申请日:2012-09-27
Applicant: 한국기초과학지원연구원
CPC classification number: G06F19/16 , C12Q1/37 , G01N30/86 , G01N33/6848 , G01N2030/8813 , G01N2030/8831 , G01N2400/00 , G01N2440/38 , G01N2560/00 , G01N2570/00 , H01J49/0027 , H01J49/0036 , H01J49/004
Abstract: The present invention be usefully used for a technique capable of predicting and diagnosing cancer by detecting a biomarker by effectively and precisely identifying and quantifying glycopeptide with relatively low sensitivity and concentration compared to ordinary peptide using the result of mass spectrum obtained from a high resolution mass analyzer.
Abstract translation: 本发明可用于通过使用从高分辨率质量分析仪获得的质谱结果与普通肽相比,以相对较低的灵敏度和浓度有效且精确地鉴定和定量糖肽来检测生物标志物,能够预测和诊断癌症的技术 。
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