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公开(公告)号：WO2016200099A2
公开(公告)日：2016-12-15
申请号：PCT/KR2016/005907
申请日：2016-06-03
Applicant: 충남대학교산학협력단 , 한국기초과학지원연구원
Abstract: 본 발명은 인간 타액 특이적 당사슬을 이용하여 인간 타액을 검증하는 방법에 관한 것이다. 인간 타액을 비롯한 인간 체액들과 쥐 타액 등을 대상으로 N-당사슬을 분리 및 정제하여 질량분석을 수행한 결과, 인간 타액에는 네 개 이상의 퓨코스를 포함하는 고퓨코실화 N-당사슬이 50% 이상 함유되어 다른 인간 체액이나 다른 동물의 타액과 구별되는 특징이 있어, 법의학 분야 등에 응용할 수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及通过使用人唾液特异性糖链检测人唾液的方法。 通过使用包含人唾液，大鼠唾液等的人体液体的N-聚糖分离和纯化进行质谱分析，结果表明，人唾液与其他动物的其他人体液或唾液不同，其特征在于由 包含至少4个岩藻糖的至少50％高度岩藻糖化的N-聚糖，因此本发明可以应用于取证领域等。
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公开(公告)号：WO2021154015A1
公开(公告)日：2021-08-05
申请号：PCT/KR2021/001183
申请日：2021-01-29
Applicant: 충남대학교산학협력단
Abstract: 본 발명은 반려동물의 미량의 혈액 시료에서 면역 정보를 내포하고 있는 당사슬의 조성과 발현 정도를 측정하여 퇴행성 질환인 골관절염을 진단하는 방법 및 그 바이오마커에 관한 것이다. 본 발명은 최초로 반려동물 골관절염 진단을 위한 바이오마커 및 이를 이용한 반려동물 골관절염 진단방법을 제공한다.
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公开(公告)号：WO2014163421A1
公开(公告)日：2014-10-09
申请号：PCT/KR2014/002912
申请日：2014-04-04
Applicant: 충남대학교산학협력단
CPC classification number: G01N33/66 , G01N2030/8822
Abstract: 본 발명은 인간 혈청 N-당쇄 지도, 인간 혈청 N-당쇄 라이브러리 및 이를 이용하여 혈청 시료를 검증하는 방법에 관한 것이다. 정상인과 환자의 혈청시료 200여 개로부터 당쇄를 분리하여 분석한 결과, 정상인과 환자 모두에게서 100% 발견되는 18개의 기본 당쇄를 찾아내었다. 이 기본 당쇄 18종의 존재는 인간 혈청시료가 채취 및 처리과정에서 문제가 없음을 검증하는데 이용될 수 있다. 또한, 본 발명자들은 인간 혈청 단백질의 N-당쇄는 이론적으로는 가능한 당쇄 종류가 매우 많지만, 실제로 N-당쇄는 도 3a, 3b, 3c에 나타낸 것과 같은 구조만이 존재함을 밝혔으며, 존재하는 구조의 N-당쇄들의 출현 백분율을 밝힘으로써 출현 확률이 낮은 N-당쇄들을 특정 질환의 마커로 사용할 수 있음을 밝혔다.
Abstract translation: 本发明涉及人血清N-糖链图，人血清N-糖链文库，以及使用其进行血清样品检测的方法。 通过分离和分析来自正常受试者和患者的200多个血清样品的糖链的结果，确定了在正常受试者和患者的100％中发现的18个基本糖链。 这些18种类型的碱性糖链的存在可用于验证在人血清样品的收集和处理过程中没有问题。 此外，本发明人证明，尽管人血清蛋白的N-糖链具有大量理论上可能的糖链类型，但是仅有如图1所示的结构。 对于实际的N-糖链，3a，3b和3c是存在的。 此外，通过确定现有结构的N-糖链的出现百分比，本发明人证明，出现概率低的N-糖链可用作特定疾病的标记物。
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公开(公告)号：WO2018026235A1
公开(公告)日：2018-02-08
申请号：PCT/KR2017/008448
申请日：2017-08-04
Applicant: 충남대학교산학협력단 , (주)글라이칸
IPC: G01N33/68
CPC classification number: G01N33/68
Abstract: 과제: 단백질의 당쇄화는 체내외 환경변화에 매우 민감하여 암을 포함한 다양한 질병에 직접적으로 관련되어 진단시스템에 활용하려는 연구가 진행되고 있다. 당사슬을 이용한 질병진단 방법은 매우 효율적이나, 당사슬을 분리하여 진단에 사용할 경우 시료 전처리, 질량분석 및 데이터 처리에 많은 시간과 노력이 요구되고 원하지 않는 인공조성물이 생성될 수 있다. 해결수단: 이를 최소화하고자 당쇄화된 단백질을 있는 그대로 분석하여 암진단에 적용하는 새로운 암진단 분석방법을 발명하였다. 본 발명에서는 다량체 구조의 햅토글로빈의 이황화 결합을 절단하여 알파 사슬과 베타 사슬로 분리한 후 전분자량을 측정함으로써 베타 사슬의 당쇄화 패턴을 분석하였다. 당사슬을 분리하지 않고 이황화 결합 절단이라는 최소한의 전처리만 수행한 후 10분 이내의 짧은 질량분석시간 소요 및 신속한 데이터 처리를 통해 단백질의 당쇄화 패턴을 인식함으로써 질병진단시 빠르고 정확한 진단방법으로 활용할 수 있다.
Abstract translation: 挑战：蛋白质糖基化对身体环境的变化高度敏感，正在研究将其用于与包括癌症在内的各种疾病直接相关的诊断系统。 使用寡糖来诊断疾病是非常有效的，但是当将寡糖分离并用于诊断时，样品制备，质量分析和数据处理需要很多时间和精力，并且可以产生不希望的人造组合物。 解决方案：为了尽量减少这种情况，我们发明了一种新的癌症诊断分析方法，可以将糖基化蛋白原样分析并应用于癌症诊断。 在本发明中，将多因子结构的二硫键切断，将其分成α链和β链，然后测定总分子量，分析β链的糖链模式。 不通过经由二硫键裂解识别的蛋白的糖基化模式，至少去除寡糖，走短质谱10分钟内后仅进行前处理和快速的数据处理可以作为一个快速和准确的诊断时的疾病的诊断 。
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公开(公告)号：WO2015199282A1
公开(公告)日：2015-12-30
申请号：PCT/KR2014/008882
申请日：2014-09-24
Applicant: 충남대학교산학협력단
IPC: C07H1/06
CPC classification number: C08H1/00 , C08B37/0003 , C08B37/006 , C12P19/12 , C12Y114/18001 , C12Y305/01052
Abstract: 본 발명은 비드 고정화 (Bead Immobiliization) 방법을 이용하여 N-당쇄와 O-당쇄가 동시에 존재하는 당단백질에서 O-당쇄만을 선택적으로 추출 및 분리할 수 있는 방법에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로는 N-당쇄와 O-당쇄가 모두 존재하는 당단백질을 비드에 고정시키고 N-당쇄만 선택적으로 분리할 수 있는 특이적 효소인 PNGase F를 이용하여 N-당쇄를 제거한 후 β-제거 (β-elimination)를 통해 O-당쇄만을 선택적으로 분리하는 것이다. 본 발명의 비파괴적인 O-당쇄 분리방법은 다양한 당단백질에서 O-당쇄 분석에 효과적으로 이용될 수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及一种能够通过使用珠固定方法从N-糖苷和O-聚糖共存的糖蛋白中仅选择性提取和分离O-聚糖的方法。 更具体地，其中N-聚糖和O-聚糖共存的糖蛋白固定在珠粒上; 使用能够选择性分离N-聚糖的特异性酶PNGase F来除去N-聚糖; 然后仅通过β-消除选择性地分离O-聚糖。 本发明的O-聚糖分离的非破坏性方法可以有效地用于各种糖蛋白中的O-聚糖分析。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：WO2014051220A1
公开(公告)日：2014-04-03
申请号：PCT/KR2013/000496
申请日：2013-01-22
Applicant: 한국기초과학지원연구원
CPC classification number: G06F19/16 , C12Q1/37 , G01N30/86 , G01N33/6848 , G01N2030/8813 , G01N2030/8831 , G01N2400/00 , G01N2440/38 , G01N2560/00 , G01N2570/00 , H01J49/0027 , H01J49/0036 , H01J49/004
Abstract: 본 발명은 고분해능 질량분석기로부터 얻은 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 일반 펩티드에 비해 상대적으로 낮은 감도 또는 농도로 존재하는 당펩티드를 효율적이고 정확히 동정 및 정량화하여, 질병 표지자(Biomarker)인 당펩티드를 발견하여 효과적으로 암을 예측, 진단할 수 있는 기술에 유용하게 사용될 수 있다.
Abstract translation: 本发明通过使用从高分辨率质谱仪获得的质谱结果，有效和准确地鉴定和定量与一般肽相比具有相对较低灵敏度或浓度的糖肽，因此可有效地用于能够有效地 通过检测作为生物标志物的糖肽来预测和诊断癌症。
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公开(公告)号：KR101672717B1
公开(公告)日：2016-11-17
申请号：KR1020150082601
申请日：2015-06-11
Applicant: 충남대학교산학협력단 , 한국기초과학지원연구원
Abstract: 본발명은인간타액특이적당사슬을이용하여인간타액을검증하는방법에관한것이다. 인간타액을비롯한인간체액들과쥐 타액등을대상으로 N-당사슬을분리및 정제하여질량분석을수행한결과, 인간타액에는네 개이상의퓨코스를포함하는고퓨코실화 N-당사슬이 50% 이상함유되어다른인간체액이나다른동물의타액과구별되는특징이있어, 법의학분야등에응용할수 있다.
Abstract translation: 本发明涉及通过使用人唾液特异性糖链检测人唾液的方法。 通过使用包含人唾液，大鼠唾液等的人体液体的N-聚糖分离和纯化进行质谱分析，结果表明，人唾液与其他动物的其他人体液或唾液不同，其特征在于由 包含至少4个岩藻糖的至少50％高度岩藻糖化的N-聚糖，因此本发明可以应用于取证领域等。
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公开(公告)号：KR1020120124767A
公开(公告)日：2012-11-14
申请号：KR1020110042607
申请日：2011-05-04
Applicant: 한국기초과학지원연구원
IPC: G01N33/50 , G06F19/10 , B01D59/44 , G01N33/574
Abstract: PURPOSE: A method for analyzing mass spectrometry result using a mass spectrometer of high resolution(MALDI FT-ICR) is provided to efficiently and accurately identify and quantitate saccharides and to predict and diagnose cancer. CONSTITUTION: A new bioinformatics platform for identifying N-glycans from blood sample comprises: a step of analyzing saccharides hydrolyzed by PNGase F using a mass spectrometer of high resolution(MALDI FT-ICR) to obtain mass spectrum; a step of removing noise from the mass spectrum, selecting peak, and preparing a peak list; a step of grouping isotopes of the peak list; a step of modeling isotopic distribution from saccharide database in the peak list; a step of calculating S-score and identifying saccharides with 4.5 or more of S-score; a step of analyzing correlation based on the identified saccharides and identifying branching N-glycan; and a step of preparing profiling and correlation map.
Abstract translation: 目的：提供使用高分辨率质谱仪（MALDI FT-ICR）分析质谱结果的方法，以有效和准确地鉴定和定量糖类并预测和诊断癌症。 构成：用于从血液样品中鉴定N-聚糖的新的生物信息学平台包括：使用高分辨率质谱仪（MALDI FT-ICR）分析由PNGase F水解的糖类以获得质谱的步骤; 从质谱中去除噪声的步骤，选择峰值和准备峰值列表; 峰值列表同位素分组的步骤; 在峰值列表中从糖类数据库建模同位素分布的步骤; 计算S评分并鉴定S评分4.5以上的糖类的步骤; 基于鉴定的糖分析相关性并鉴定支链N-聚糖的步骤; 并准备剖析和相关图的步骤。
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公开(公告)号：KR101311412B1
公开(公告)日：2013-09-25
申请号：KR1020110042607
申请日：2011-05-04
Applicant: 한국기초과학지원연구원
IPC: G01N33/50 , G06F19/10 , B01D59/44 , G01N33/574
Abstract: 본 발명은 혈액내 당단백질에 당(N-glycan)의 동정을 위해 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)를 이용한 질량 스펙트럼 검색 결과를 분석하는 방법에 대한 것으로, 구체적으로 당 절단 효소에 의해 분리된 당을 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계(단계 1); 상기 질량 스펙트럼에서 노이즈를 제거하고, 피크를 선택하여 피크의 리스트를 작성하는 단계(단계 2); 상기 피크 리스트에서 동위원소들을 그룹화하는 단계(단계 3); 상기 피크 리스트에서 당 데이터베이스로부터 이론적으로 가능한 동위원소 분포를 모델링하는 단계(단계 4); S-스코어를 계산하고, S-스코어가 4.5 이상인 당을 동정하는 단계(단계 5); 상기 동정된 당을 기본으로 하여 상관관계 분석을 통하여 추가적으로 당(Branching N-glycan)을 동정하는 단계(단계 6); 상기 동정된 당들을 확인하고, 프로파일링 및 상관관계 맵을 작성하는 단계(단계 7)를 포함하는 생물정보처리 분석 방법에 관한 것이다. 본 발명은 고분해능 질량분석기(MALDI FT-ICR)로부터 얻은 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 상대적으로 낮은 감도(또는 농도)로 존재하는 당을 효율적이고 정확히 동정 및 정량화하여, 질병 표지자(Biomarker)인 당을 발견하여 효과적으로 암을 예측, 진단할 수 있는 기술에 유용하게 사용될 수 있다.
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公开(公告)号：KR101341591B1
公开(公告)日：2013-12-16
申请号：KR1020120108011
申请日：2012-09-27
Applicant: 한국기초과학지원연구원
CPC classification number: G06F19/16 , C12Q1/37 , G01N30/86 , G01N33/6848 , G01N2030/8813 , G01N2030/8831 , G01N2400/00 , G01N2440/38 , G01N2560/00 , G01N2570/00 , H01J49/0027 , H01J49/0036 , H01J49/004
Abstract: The present invention be usefully used for a technique capable of predicting and diagnosing cancer by detecting a biomarker by effectively and precisely identifying and quantifying glycopeptide with relatively low sensitivity and concentration compared to ordinary peptide using the result of mass spectrum obtained from a high resolution mass analyzer.
Abstract translation: 本发明可用于通过使用从高分辨率质量分析仪获得的质谱结果与普通肽相比，以相对较低的灵敏度和浓度有效且精确地鉴定和定量糖肽来检测生物标志物，能够预测和诊断癌症的技术 。
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