Abstract:
Disclosed are genomic sequences for nine strains of Cronobacter spp. (C. sakazakii - 696, 701, 680; C. malonaticus - 507, 681; C. turicensis - 564; C. muytjensii - 530; C. dublinensis - 582; C. genomospl - 581) and compositions, methods, and kits for detecting, identifying and distinguishing Cronobacter spp. strains from each other and from non-Cronobacter spp. strains. Some embodiments describe isolated nucleic acid compositions unique to certain Cronobacter strains as well as compositions that are specific to all Cronobacter spp. Primer and probe compositions and methods of use of primers and probes are also provided. Kits for identification of Cronobacter spp. are also described. Some embodiments relate to computer software methods for setting a control based threshold for analysis of PCR
Abstract translation:公开了九个克罗杆菌属菌株的基因组序列。 (C. sakazakii-696,701,680; C. malonaticus-507,681; C. turicensis-564; C. muytjensii-530; C.dublinensis-582; C.基因组蛋白-58)和组合物,方法和试剂盒 用于检测,识别和鉴别克罗杆菌属。 菌株彼此和非克罗杆菌属。 株。 一些实施方案描述了某些克罗杆菌菌株特有的分离的核酸组合物以及对所有克罗杆菌属特异性的组合物。 还提供引物和探针组合物以及引物和探针的使用方法。 克隆杆菌属鉴定试剂盒 也被描述。 一些实施例涉及用于设置用于PCR分析的基于控制的阈值的计算机软件方法
Abstract:
Compositions, assays, methods, diagnostic methods, kits, and diagnostic kits are disclosed for the specific and differential detection of SARS-CoV-2 and/or other viruses from samples, including veterinary samples, clinical samples, food samples, forensic sample, environmental samples (e.g., obtained from soil, garbage, sewage, air, water, food processing and manufacturing surfaces, or likewise), or biological sample obtained from a human or non-human animal.
Abstract:
Disclosed is a multi-primer amplification assay, method and kits for detecting Mycoplasma species and closely related species utilizing a plurality of oligonucleotide primers in contact with a sample in a single vessel and detecting the amplification product, wherein the presence of an amplification product indicates Mycoplasma in the sample.
Abstract:
Un método, que comprende: amplificar una secuencia de ácido nucleico de interés en una muestra que comprende ADN genómico de un sujeto; amplificar una secuencia de referencia en la muestra, en donde la secuencia de referencia tiene al menos un 80 % de identidad de secuencia con respecto a al menos una porción de ADN genómico que comprende de aproximadamente 60 a aproximadamente 150 pares de bases de cualquiera de las SEQ ID NO:9-13, en donde la al menos una porción está presente en al menos un primer número mínimo de copias en el genoma; y al menos una copia de la al menos una porción está presente en cada uno de al menos un segundo número mínimo de cromosomas; cuantificar la secuencia de interés amplificada con relación a la secuencia de referencia amplificada; y determinar un número de copias de la secuencia de interés a partir de la secuencia de interés amplificada cuantificada relativa, en donde la amplificación de la secuencia de interés y la amplificación de la secuencia de referencia se realizan mediante la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa TaqMan (qPCR).
Abstract:
A quality control system for a qPCR receives signals resulting from operation of the qPCR system on an assay, and applies labeled data sets to a Support Vector Machine (SVM) to generate classifications for the signals to generate classifications that are utilized as operational feedback to the qPCR system.
Abstract:
Un método que comprende: amplificar una secuencia de ácido nucleico de interés en una muestra que comprende ADN genómico de un sujeto; amplificar una secuencia de referencia en la muestra en donde la secuencia de referencia tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con al menos una porción de ADN genómico que comprende de aproximadamente 60 a aproximadamente 150 pares de bases de cualquiera de las SEQ ID Nos: 2-8, o en donde la secuencia de referencia comprende de 60-150 pares de bases de la SEQ ID Nº 1, en donde la al menos una porción está presente en al menos un primer número mínimo de copias en el genoma; y al menos una copia de la al menos una porción está presente en cada uno de al menos un segundo número mínimo de cromosomas; cuantificar la secuencia de interés amplificada en relación con la secuencia de referencia amplificada; y determinar un número de copias de la secuencia de interés a partir de la secuencia de interés amplificada cuantificada relativa, en donde la amplificación de la secuencia de interés y la amplificación de la secuencia de referencia se realizan mediante la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa TaqMan (qPCR).