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    SYSTEMS AND METHODS FOR THE ANALYSIS OF PROXIMITY BINDING ASSAY DATA
    1.
    发明申请
    SYSTEMS AND METHODS FOR THE ANALYSIS OF PROXIMITY BINDING ASSAY DATA 审中-公开
    用于分析接近结合测定数据的系统和方法

    公开(公告)号：WO2012068276A3

    公开(公告)日：2012-07-19

    申请号：PCT/US2011061034

    申请日：2011-11-16

    Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP ,  LEONG HARRISON ,  MAJUMDAR NIVEDITA ,  SWARTZMAN ELANA

    Inventor： LEONG HARRISON ,  MAJUMDAR NIVEDITA ,  SWARTZMAN ELANA

    IPC: G06F19/24

    CPC classification number: G06F19/18 ,  G06F19/24

    Abstract: A proximity binding assay (PBA) is performed on at least one test sample, at least one reference sample, a background sample, and one or more calibration samples using a thermal cycler instrument. Ct values are determined for at least one set of test sample data and at least one set of reference sample data. Background corrected Ct values are calculated using a corresponding value in a background sample data set. A linear range is determined for the background corrected Ct values as a function of sample quantity. A linear regression line is calculated for each linear range. One or more parameter values of an exponential model (EM) fold change formula are estimated from the one or more sets of calibration sample data. A target protein quantity and associated confidence interval are calculated using the linear regression lines and the EM fold change formula.

    Abstract translation: 使用热循环仪器在至少一个测试样品，至少一个参考样品，背景样品和一个或多个校准样品上进行接近结合测定（PBA）。 对至少一组测试样本数据和至少一组参考样本数据确定Ct值。 背景校正的Ct值是使用背景样本数据集中的对应值计算的。 根据样品数量确定背景校正Ct值的线性范围。 针对每个线性范围计算线性回归线。 根据一组或多组校准样本数据估计指数模型（EM）倍数变化公式的一个或多个参数值。 使用线性回归线和EM倍数变化公式计算目标蛋白质量和相关置信区间。

    Flujo de trabajo para la detección de ligandos utilizando ácidos nucleicos
    5.
    发明专利
    Flujo de trabajo para la detección de ligandos utilizando ácidos nucleicos 未知

    公开(公告)号：ES2728743T3

    公开(公告)日：2019-10-28

    申请号：ES17166444

    申请日：2012-01-17

    Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP

    Inventor： CHEN SHIAW-MIN ,  SWARTZMAN ELANA ,  RUFF DAVID ,  SHANNON MARK ,  LU JULIA ,  HENDRICKS STEPHEN

    IPC: C12Q1/68

    Abstract: Un método para ligar al menos el primer y segundo oligonucleótidos, en donde cada uno del primer y segundo oligonucleótidos está unido a una sonda específica del objetivo, para producir un molde de oligonucleótido ligada y amplificar el molde del oligonucleótido ligado para producir un ácido nucleico diana amplificado, en donde la ligación y la amplificación se produce en una sola mezcla de reacción, en donde el primer y segundo oligonucleótidos se ligan entre sí utilizando un oligonucleótido de férula y una ligasa, en donde el primer y segundo oligonucleótidos se hibridan al oligonucleótido de férula y en donde la parte hibridada del oligonucleótido de férula no es más de 20 nucleótidos de largo; y en donde dicha ligasa se selecciona del grupo que consiste en la ligasa de SEC ID NO.: 77, la ligasa de SEC ID 10 NO.: 78, la ligasa de SEC ID NO.: 79, la ligasa de SEC ID NO.: 80, la ligasa de SEC ID NO.: 81, la ligasa de SEC ID NO.: 82, y combinaciones de las mismas.

    Flujo de trabajo para la detección de ligandos empleando ácidos nucleicos
    6.
    发明专利
    Flujo de trabajo para la detección de ligandos empleando ácidos nucleicos 未知

    公开(公告)号：ES2632768T3

    公开(公告)日：2017-09-15

    申请号：ES12702099

    申请日：2012-01-17

    Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP

    Inventor： CHEN SHIAW-MIN ,  SWARTZMAN ELANA ,  RUFF DAVID ,  SHANNON MARK ,  LU JULIA ,  HENDRICKS STEPHEN

    IPC: C12Q1/68

    Abstract: Un método para acoplar al menos dos oligonucleótidos para producir un oligonucleótido acoplado y amplificar el oligonucleótido acoplado, en el que el acoplamiento y la amplificación se producen en una única mezcla de reacción, comprendiendo dicho método las etapas, en combinación, de: a) poner en contacto una proteína diana o analito con al menos una primera y una segunda sonda, teniendo cada sonda una especificidad de unión por la proteína o el analito y estando unida al menos a un tipo de oligonucleótido; b) acoplar entre sí los oligonucleótidos sobre la primera y la segunda sonda empleando (i) una ligasa seleccionada del grupo que consiste en la ligasa de SEQ ID NO:77, la ligasa de SEQ ID NO:78, la ligasa de SEQ ID NO:79, la ligasa de SEQ ID NO:80, la ligasa de SEQ ID NO:81, la ligasa de SEQ ID NO:82, y sus combinaciones, y (ii) un puente oligonucleotídico, en el que dicho puente oligonucleotídico comprende un extremo 3' de cuatro a nueve bases de longitud, y un extremo 5' de cuatro a nueve bases de longitud, para producir un ácido nucleico diana y amplificar el ácido nucleico diana; y, c) detectar el ácido nucleico diana amplificado

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