Flujo de trabajo para la detección de ligandos utilizando ácidos nucleicos

    公开(公告)号:ES2728743T3

    公开(公告)日:2019-10-28

    申请号:ES17166444

    申请日:2012-01-17

    Abstract: Un método para ligar al menos el primer y segundo oligonucleótidos, en donde cada uno del primer y segundo oligonucleótidos está unido a una sonda específica del objetivo, para producir un molde de oligonucleótido ligada y amplificar el molde del oligonucleótido ligado para producir un ácido nucleico diana amplificado, en donde la ligación y la amplificación se produce en una sola mezcla de reacción, en donde el primer y segundo oligonucleótidos se ligan entre sí utilizando un oligonucleótido de férula y una ligasa, en donde el primer y segundo oligonucleótidos se hibridan al oligonucleótido de férula y en donde la parte hibridada del oligonucleótido de férula no es más de 20 nucleótidos de largo; y en donde dicha ligasa se selecciona del grupo que consiste en la ligasa de SEC ID NO.: 77, la ligasa de SEC ID 10 NO.: 78, la ligasa de SEC ID NO.: 79, la ligasa de SEC ID NO.: 80, la ligasa de SEC ID NO.: 81, la ligasa de SEC ID NO.: 82, y combinaciones de las mismas.

    Flujo de trabajo para la detección de ligandos empleando ácidos nucleicos

    公开(公告)号:ES2632768T3

    公开(公告)日:2017-09-15

    申请号:ES12702099

    申请日:2012-01-17

    Abstract: Un método para acoplar al menos dos oligonucleótidos para producir un oligonucleótido acoplado y amplificar el oligonucleótido acoplado, en el que el acoplamiento y la amplificación se producen en una única mezcla de reacción, comprendiendo dicho método las etapas, en combinación, de: a) poner en contacto una proteína diana o analito con al menos una primera y una segunda sonda, teniendo cada sonda una especificidad de unión por la proteína o el analito y estando unida al menos a un tipo de oligonucleótido; b) acoplar entre sí los oligonucleótidos sobre la primera y la segunda sonda empleando (i) una ligasa seleccionada del grupo que consiste en la ligasa de SEQ ID NO:77, la ligasa de SEQ ID NO:78, la ligasa de SEQ ID NO:79, la ligasa de SEQ ID NO:80, la ligasa de SEQ ID NO:81, la ligasa de SEQ ID NO:82, y sus combinaciones, y (ii) un puente oligonucleotídico, en el que dicho puente oligonucleotídico comprende un extremo 3' de cuatro a nueve bases de longitud, y un extremo 5' de cuatro a nueve bases de longitud, para producir un ácido nucleico diana y amplificar el ácido nucleico diana; y, c) detectar el ácido nucleico diana amplificado

    SYSTEMS AND METHODS FOR ANALYTE DETECTION FROM MULTIPLEXED ASSAYS

    公开(公告)号:AU2023298557A1

    公开(公告)日:2025-01-16

    申请号:AU2023298557

    申请日:2023-06-29

    Abstract: Systems and methods that enable analyte detection in a multiplexed amplification process can include obtaining, at multiple time points during the amplification process, composite emission signal data associated with a composite emission signal from at least a first probe type comprising a first label configured to generate a first emission signal and a second probe type comprising a second label configured to generate a second emission signal which has spectrally similar characteristics as said first emission signal, the first probe type and the second probe type differing in thermal and/or temporal properties; and determining, based at least partially on the composite emission signal data, emission signal data associated with a emission signal from a given probe type of the first probe type or the second probe type during the amplification process.

    Vorbereitung biologischer Probe zum Testen

    公开(公告)号:DE112016003660T5

    公开(公告)日:2018-05-09

    申请号:DE112016003660

    申请日:2016-08-10

    Abstract: In einer Ausführungsform schließt das Verfahren zum Verarbeiten einer Probe das Selektieren einer selektierten Probe aus einer biologischen Prüfsubstanz ein, wobei die selektierte Probe mit einer ersten Oberfläche eines ersten Substrats in Kontakt steht. Das Verfahren schließt auch das direkte Übertragen der selektierten Probe von der ersten Oberfläche in einen Behälter, der ein Innenvolumen umfasst, ein. Das Verfahren schließt auch das Ausbilden oder Bereitstellen einer Probenlösung innerhalb des Innenvolumens des Behälters durch Inkontaktbringen der selektierten Probe mit einer Lysemischung unter Verwendung eines Protokolls ein. Das Verfahren schließt ferner das Durchführen eines Assays, Versuchs oder Tests an der Probenlösung ein, während die Probenlösung innerhalb des Innenvolumens des Behälters angeordnet ist. In einer anderen Ausführungsform schließt ein Verfahren zum Verarbeiten einer Probe das Bereitstellen einer selektierten Probe ein, die eine oder mehrere Zellen umfasst. Das Verfahren schließt auch das Übertragen der selektierten Probe in ein Innenvolumen eines Behälters ein. Das Verfahren schließt auch das Inkontaktbringen der selektierten Probe mit einer Lysemischung unter Verwendung eines Protokolls zur Bereitstellung einer Probenlösung ein, wobei das Protokoll das Erwärmen der Probenlösung auf eine erste Temperatur, die höher ist als 37 Grad Celsius und höchstens so hoch ist wie 75 Grad Celsius, umfasst.

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