Abstract:
Methods, assays, compositions and kits for the ligation of short polynucleotides are presented herein. The short polynucleotides are optionally no more than 7 nucleotides in length, and can be as short as 3 or 4 nucleotides in length. The ligation is optionally performed by CV ligase.
Abstract:
This disclosure relates to methods of performing activation by polyphosphorolysis (APP) reactions using at least one of the polyphosphorylating agents triphosphate, polyphosphate, imidodiphosphate, thiodiphosphate (or -monothiopyrophosphate), and related compounds.
Abstract:
This application relates to methods for ligating oligonucleotides having complementarity to a target nucleic acid, and amplifying the ligated oligonucleotides, where ligation and amplification occur in the same reaction mixture.
Abstract:
Disclosed herein is a fusion protein possessing both nuclease and phosphatase activities. The described fusion protein simplifies the processing of amplified DNA to degrade residual primers and nucleotide triphosphates and thereby facilitates subsequent DNA analysis.
Abstract:
The present invention provides compositions and methods for a reverse transcription reaction using a reversibly inactivated reverse transcriptase enzyme. The reversibly inactivated reverse transcriptase enzyme results from a chemical modification which inactivates the reverse transcriptase enzyme. The activity of the reverse transcriptase enzyme is recovered by an incubation of the reaction mixture at elevated temperature prior to, or as part of the reverse transcription reaction. The reverse transcriptase enzyme of the present invention provides for a signficant reduction in non-specific reverse transcription from template nucleic acid molecules because the formulation of the reaction mixture does not support the formation of reverse transcription products prior to activation of the reverse transcriptase.
Abstract:
Un método de ligamiento repetitivo, que comprende ligar enzimáticamente un oligonucleótido ("sonda") y un polinucleótido ("cebador") usando una ADN ligasa del Virus Chlorella (CV ligasa) o fragmento funcional de la misma, en la que: la sonda contiene N restos nucleotídicos en longitud, donde N es de 2 a 7.
Abstract:
Una ligasa de ADN Hin mutante que tiene al menos 70 %, al menos 80 % o al menos 90 %, o al menos 95 % o al menos 99 % de identidad con la secuencia de la ligasa de ADN Hin que se proporciona en la Tabla 1C, cuya ligasa comprende dos mutaciones de aminoácidos en las posiciones 93 y 193 de la secuencia de la ligasa de ADN Hin proporcionada en la Tabla 1C que consisten en cambiar la glicina en la posición 193 a ácido aspártico o ácido glutámico y cambiar la treonina en la posición 93 a serina.
Abstract:
Un método para ligar al menos el primer y segundo oligonucleótidos, en donde cada uno del primer y segundo oligonucleótidos está unido a una sonda específica del objetivo, para producir un molde de oligonucleótido ligada y amplificar el molde del oligonucleótido ligado para producir un ácido nucleico diana amplificado, en donde la ligación y la amplificación se produce en una sola mezcla de reacción, en donde el primer y segundo oligonucleótidos se ligan entre sí utilizando un oligonucleótido de férula y una ligasa, en donde el primer y segundo oligonucleótidos se hibridan al oligonucleótido de férula y en donde la parte hibridada del oligonucleótido de férula no es más de 20 nucleótidos de largo; y en donde dicha ligasa se selecciona del grupo que consiste en la ligasa de SEC ID NO.: 77, la ligasa de SEC ID 10 NO.: 78, la ligasa de SEC ID NO.: 79, la ligasa de SEC ID NO.: 80, la ligasa de SEC ID NO.: 81, la ligasa de SEC ID NO.: 82, y combinaciones de las mismas.