公开(公告)号：CN114678068B

公开(公告)日：2025-02-07

申请号：CN202011548426.2

申请日：2020-12-24

Applicant: 中国科学院分子植物科学卓越创新中心

Inventor： 韩斌 ,  刘晓辉 ,  王子轩 ,  张弛 ,  冯旗 ,  翁崎峻

IPC: G16B25/00 ,  G16B20/30 ,  G16B20/20 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种抗稻瘟病基因的分子标记，其为选自包含用于筛选抗稻瘟病基因Pi‑i、Pi‑b、Pi‑zt、Pi‑z、Pi‑kp、Pi‑km和Pi‑a的基因panel的SNP位点序列配对。该分子标记能够用于指导水稻改良。

公开(公告)号：CN119372328A

公开(公告)日：2025-01-28

申请号：CN202411503830.6

申请日：2024-10-25

Applicant: 首都医科大学 ,  斯贝福(北京)生物技术有限公司

Inventor： 霍学云 ,  杜小燕 ,  陈振文 ,  郭雅芳 ,  王妍 ,  崔雨桐 ,  孙铭壑 ,  张頔 ,  李长龙 ,  吕建祎 ,  路静 ,  郭萌 ,  刘欣

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11 ,  G16B30/00 ,  G16B20/30 ,  G16B40/00

Abstract: 本申请涉及生物基因检测的技术领域，具体公开了一种长爪沙鼠SNP分子标记组合及其应用。本申请公开的长爪沙鼠SNP分子标记组合，包括219个SNP分子标记中的至少一种，所述219个SNP分子标记的物理位置是基于长爪沙鼠进行覆盖率为10×的全基因组测序进行序列比对确定的，所述219个SNP分子标记的位点信息如表1所示。本申请提供的长爪沙鼠SNP分子标记组合用于检测长爪沙鼠的SNP基因分型，具有新型、稳定、经济高效的性质。

公开(公告)号：CN114639443B

公开(公告)日：2025-01-28

申请号：CN202210360183.2

申请日：2022-04-07

Applicant: 广西大学

Inventor： 谢雨丝 ,  卢吉晓 ,  黄毅然

IPC: G16B20/30

Abstract: 本发明公开了一种基于原子团追踪的代谢网络分支路径排序方法。1.通过分支合并基于原子团追踪得到的线性路径生成分支路径；2.通过提取63个已知代谢网络的高频反应段构建原始反应段词典；3.计算出高频反应段的信息熵与互信息；4.筛选出信息熵与互信息高于既定阈值的反应段作为关键反应段，并把关键反应段及其左右信息熵与互信息值存入关键反应段词典；5.计算关键反应段词典中的反应段评分；6.将反应段评分与化合物相似度、反应热力学自由能、原子团转移信息一起作为分支路径的排序权重对分支路径进行排序。本发明的方法有效提高了找到的代谢路径恢复已知路径的准确度并且返回由起始化合物到目标化合物的具有生化相关性的分支代谢路径。

公开(公告)号：CN119360973A

公开(公告)日：2025-01-24

申请号：CN202411393422.X

申请日：2024-10-08

Applicant: 兰州大学

Inventor： 袁永娜 ,  刘振宇

IPC: G16B40/00 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/084

Abstract: 本发明公开了一种基于Transformer模型预测DNA G‑四链体形成倾向的方法，包括：提取核酸序列信息和G‑四链体位点信息，构建数据集；构建用于预测DNA G‑四链体形成倾向的Transformer深度学习模型；基于所述数据集通过并行计算训练所述Transformer深度学习模型，获得训练好的Transformer深度学习模型，对所述训练好的Transformer深度学习模型进行验证，获得目标深度学习模型；基于所述目标深度学习模型进行DNA G‑四链体形成倾向预测，获得预测结果。本发明不仅能够很好地对DNA序列进行G‑四链体形成倾向预测，还能识别潜在的G‑四链体基序。

公开(公告)号：CN119360965A

公开(公告)日：2025-01-24

申请号：CN202411169973.8

申请日：2024-08-26

Applicant: 山西紫林醋业股份有限公司

Inventor： 邹伟 ,  闫裕峰 ,  申瑾 ,  夏瑶瑶 ,  郎繁繁 ,  杨凌凌

IPC: G16B30/20 ,  G16B20/30 ,  G16B40/00 ,  G06F18/241

Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，涉及一种预测未培养微生物个体代谢能力的方法和系统，通过获取待分析物的宏基因组序列；从所述宏基因组序列中提取出未培养微生物组装基因组；对所述未培养微生物组装基因组进行系统发育分析，得到分析结果；根据所述分析结果建立代谢网络模型；利用所述代谢网络模型对所述未培养微生物组装基因组进行个体代谢能力预测，得到预测结果。本发明可实现对未培养微生物的个体代谢能力进行预测。

公开(公告)号：CN119360948A

公开(公告)日：2025-01-24

申请号：CN202411409283.5

申请日：2024-10-10

Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院

Inventor： 宋伦 ,  孟雨婷 ,  刘琨 ,  彭晖 ,  张敏 ,  张晓丹

IPC: G16B15/30 ,  G16B20/30 ,  G16H70/40

Abstract: 本发明公开了一种基于黄芪和CAMK2B的计算机辅助方法、系统或设备，本发明提供了一种筛选影响黄芪对CAMK2B表达的增强作用的药物筛选方法，本发明提供了一种调节体外细胞中CAMK2B表达的方法，本发明还提供了一种基于黄芪和CAMK2B的计算机辅助药物筛选方法，本发明还提供了一种基于黄芪和CAMK2B的计算机辅助药物筛选系统，一种基于黄芪和CAMK2B的计算机辅助药物筛选设备以及相应的计算机可读存储介质，本发明还提供了黄芪和CAMK2B相关的应用。

公开(公告)号：CN119324055A

公开(公告)日：2025-01-17

申请号：CN202310878935.9

申请日：2023-07-17

Applicant: 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) ,  中国科学院动物研究所 ,  衢州市人民医院

Inventor： 张维绮 ,  刘光慧 ,  杨运桂 ,  张峰 ,  叶金林 ,  李嘉明 ,  孙晓燕 ,  熊沐钊 ,  陈成水 ,  薛勇彪 ,  范艳玲 ,  程科云 ,  傅向红

IPC: G16H50/30 ,  G16H10/20 ,  G16B40/00 ,  G16B20/30 ,  G16B25/10 ,  G16H10/40 ,  G16B25/00 ,  G06F18/23213 ,  G06N20/00 ,  G06N5/02 ,  G01N33/00 ,  G01N1/10 ,  G01N33/50

Abstract: 本发明属于生物医学领域，具体涉及一种基于代谢数据的年龄估算方法，更具体地，本发明涉及一种建立数据集的方法、年龄估算模型的训练方法、年龄估算方法、年龄估算模型或装置、电子设备、非易失性计算机可读存储介质，以及其用于评估受试者的生物学年龄、受试者的衰老程度或速率、衰老干预手段效果、受试者患衰老相关疾病的风险和/或衰老相关疾病的治疗效果。

公开(公告)号：CN119314553A

公开(公告)日：2025-01-14

申请号：CN202411844225.5

申请日：2024-12-16

Applicant: 上海第二工业大学

Inventor： 刘振栋 ,  蒋迦旻 ,  张博锋 ,  李丽萍 ,  牛竟冉 ,  赵腾博 ,  刘潇 ,  沈文枫 ,  吴青娥 ,  宋绍京 ,  薛建新 ,  朱航琛 ,  郭雅萍 ,  高瑞玲 ,  吴恒洋 ,  王彤 ,  马闯 ,  庞艳霞

IPC: G16B20/30 ,  G16B40/00 ,  G06F18/241 ,  G06N5/01 ,  G06N20/20 ,  G06F18/27

Abstract: 本发明公开了一种基于组合特征编码和DNA结合位点的预测方法，该方法属于位点预测领域。该方法包含如下步骤：对初始数据集剔除低方差特征并设置重组率阈值标记样本；根据输入标签判断任务类型使用分类或回归算法；使用Optuna优化参数并分配给对应参数；随机地分配训练和测试数据集；分别输入数据集到多种算法包括随机森林和深度森林等中进行训练；根据评价指标，选择表现最佳的模型作为最终预测模型；最终，通过最优模型对测试集进行预测。该方法实现了出色的高精度和低误差，同时具有更好的移植性，为药物设计中高效重组系统的研究提供了新的思路。

公开(公告)号：CN119307655A

公开(公告)日：2025-01-14

申请号：CN202411011493.9

申请日：2024-07-26

Applicant: 西安医学院第一附属医院

Inventor： 周建 ,  李卓 ,  任雪梅

IPC: C12Q1/70 ,  C12Q1/6844 ,  C12N15/11 ,  G16B50/00 ,  G16B20/30 ,  C12R1/93

Abstract: 本发明公开了一种多靶点汉坦病病毒核酸检测试剂盒及检测方法，其中，试剂盒包括RT‑RPA的恒温扩增反应体系和CRISPR/Cas12的检测反应体系；所述RT‑RPA的恒温扩增反应体系为针对汉坦病病毒M基因的特异性的RT‑RPA恒温扩增引物；所述CRISPR/Cas12的检测反应体系为针对CRISPR/Cas12特异性识别的汉坦病毒的crRNA。本发明通过将CRISPR/Cas12与逆转录重组酶等温扩增(RT‑RPA)技术结合检测汉坦病毒核酸，有效的解决了汉坦病毒核酸PCR检测技术过程中对特殊仪器依赖的关键限制问题，以及实现现场检测(POCT)难的问题，缩短了检测时间。

公开(公告)号：CN119307618A

公开(公告)日：2025-01-14

申请号：CN202411841971.9

申请日：2024-12-13

Applicant: 浙江大学医学院附属邵逸夫医院

Inventor： 梁霄 ,  徐俊杰 ,  沈泽锋 ,  陶力野 ,  王雅丽 ,  谢阳阳 ,  郑俊浩 ,  潘昊宇 ,  邬建敏 ,  叶学松

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/02 ,  C12N15/113 ,  A61K31/713 ,  A61P35/00 ,  G16B20/30 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明提供了肝内胆管癌发生与发展过程中的关键分子的创新筛选方法及应用，本发明首先对肝内胆管癌组织及其对应的邻近组织进行了转录组测序。随后，根据肿瘤与邻近组织测序结果的差异倍数，挑选若干长链非编码RNA进行后续的细胞表型筛选实验。依据筛选实验结果选择其中能降低肝内胆管癌细胞增殖和/或侵袭能力的lncRNA即为肝内胆管癌发生与发展过程中的关键分子。进一步地，体内体外实验证实靶向关键分子可抑制ICC的发生与发展过程，同时也验证了本发明的肝内胆管癌发生与演进机制中关键分子挖掘策略的可行性和有效性。本发明旨在为ICC发生与发展过程中的关键分子的发掘提出创新的筛选策略，以期为ICC早期诊断与精准治疗提供有益思路。