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公开(公告)号:CN119811493A
公开(公告)日:2025-04-11
申请号:CN202411760902.5
申请日:2024-12-03
Applicant: 枣庄全鼎生物科技股份有限公司
IPC: G16B35/00 , G16B40/00 , G06N3/044 , G06N3/0464 , G06F18/213
Abstract: 本发明涉及抗菌肽预测领域,公开了一种基于数据分析的海洋生物被膜抗菌肽预测方法及系统,该方法包括以下步骤:S1、通过序列特征和结构特征的联合提取方法,获取海洋生物被膜中抗菌肽的相关特征;S2、基于训练好的卷积神经网络与循环神经网络结合的神经网络模型,提取出序列特征和结构特征;S3、基于S2中提取出的序列特征和结构特征,分别计算得到第一活性评估系数和第二活性评估系数,并利用第一活性评估系数和第二活性评估系数构建海洋生物被膜抗菌肽的活性预测模型;S4、根据海洋生物被膜抗菌肽的活性预测模型输出的活性预测值与预先设定的活性阈值进行比较结果预测是否存在合格活性的抗菌肽。
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公开(公告)号:CN119581011A
公开(公告)日:2025-03-07
申请号:CN202411391456.5
申请日:2024-09-30
Applicant: 中国医学科学院阜外医院
IPC: G16H50/30 , C12Q1/6883 , G16H50/70 , G16B35/00 , G06F17/18
Abstract: 本申请公开了一种数据处理方法、装置、系统、设备、介质及程序产品,涉及数据处理技术领域。该方法包括:获取用户的微小核糖核酸MicroRNA数据,MicroRNA包括以下至少一种:let‑7b‑5p、let‑7f‑5p、miR‑128‑3p、miR‑191‑5p、miR‑197‑3p、miR‑23b‑3p、miR‑25‑3p、miR‑26b‑5p、miR‑29a‑3p、miR‑423‑5p、miR‑485‑5p、miR‑625‑3p、miR‑92a‑3p;基于MicroRNA数据,确定用户的目标评分值。该方法能精确地预测射血分数保留的急性心力衰竭患者在第一预设时间段内发生全因死亡事件的概率。
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公开(公告)号:CN118918958B
公开(公告)日:2025-02-25
申请号:CN202411390241.1
申请日:2024-10-08
Applicant: 苏州依科赛生物科技股份有限公司
Abstract: 本申请属于生物技术领域,公开了一种慢病毒包装用血清的筛选方法,利用SIMCA‑P软件进行不同批次的血清的成分和慢病毒产量进行OPLS‑DA分析,获得直观的得分图和载荷图,从而建立相应模型,为后续血清筛选提供了支持。
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公开(公告)号:CN112313749B
公开(公告)日:2025-02-07
申请号:CN201880094641.4
申请日:2018-12-05
Applicant: 香港理工大学
Abstract: 公开了用于将数字数据存储到肽序列中并从肽序列中读取数字数据的方法和系统。用于将数字数据存储到肽序列中的方法可以包括:将数字数据编码为数字码(402);将所述数字码翻译成肽序列(404);以及合成已翻译的肽序列(406)。从肽序列中读取数字数据的方法可以包括:对肽序列测序并确定其顺序(502);将具有确定顺序的所述肽序列转换成数字码(504);以及从所述数字码中解码所述数字数据(506)。开发了具有纠错性能的代码,用于将数字数据编码成肽序列,并且开发了在软件中实现的计算方法以对携带数字数据的肽进行测序。
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公开(公告)号:CN112908417B
公开(公告)日:2025-01-10
申请号:CN202011613020.8
申请日:2020-12-30
Applicant: 浙江工业大学
Abstract: 本发明公开了一种功能序列和结构模拟相结合的基因挖掘方法、NADH偏好型草铵膦脱氢酶突变体及应用。所述基因挖掘方法包括:(1)分析NADH型谷氨酸脱氢酶应具备的特性序列;(2)根据特征序列搜索基因库;(3)对搜索获得的基因进行聚类分析和蛋白结构模拟;(4)选择基因聚合度高且蛋白结构与已知草铵膦脱氢酶结构类似的基因作为候选基因。经基因挖掘得到来源于堆肥赖氨酸杆菌(Lysinibacillus composti)氨基酸序列如SEQ ID No.2所示的野生型草铵膦脱氢酶,并经过突变筛选到NADH偏好型草铵膦脱氢酶突变体,突变位点选自以下一种:(1)A144G‑V375F‑M91A;(2)A144G‑V345A‑M91A;(3)A144G,该突变体酶能够利用廉价的辅酶NAD进行催化反应。
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公开(公告)号:CN119173946A
公开(公告)日:2024-12-20
申请号:CN202380039775.7
申请日:2023-03-15
Applicant: 安纳吉尼克斯公司
Inventor: 斯维特拉娜·别良斯卡娅 , 波利娜·宾德尔 , 乔治·约瑟夫·富兰克林 , 拉沙德里克·塞德里奥斯·格雷迪 , 梅根·F·劳勒 , 亨利·帕拉奇 , 尼古拉斯·蒂尔曼斯 , 苏穆杜·帕莫达·利拉南达
Abstract: 本文描述了用于机器学习驱动的迭代药物发现过程的平台、系统、介质和方法。一些方面包括:接收第一输入数据集,该第一输入数据集包括靶分子与化合物库之间的第一结合相互作用信息;使用机器学习模块处理第一输入数据集以生成结合相互作用的模型表示,其中表示被配置为预测靶分子与输入化合物之间的结合;使用结合相互作用的模型表示来确定更新的化合物库,其中更新的化合物库包括被预测会结合靶分子的一种或多种新化合物;接收第二输入数据集,该第二输入数据集包括靶分子与更新的化合物库之间的第二结合相互作用信息;以及使用机器学习模块处理第二输入数据集以更新结合相互作用的模型表示,其中更新的模型表示的预测精度被改善。
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公开(公告)号:CN119170292A
公开(公告)日:2024-12-20
申请号:CN202411200944.3
申请日:2024-08-29
Applicant: 中国人民解放军总医院第一医学中心
Abstract: 本发明公开了胶质瘤干性预测模型及其在指导临床精准诊疗中的应用,本发明通过一系列机器学习途径开发了胶质瘤干细胞相关评分(GScore),并基于GScore提供了预测胶质瘤患者预后、评估胶质瘤致癌程度、预测胶质瘤免疫微环境或筛选胶质瘤潜在治疗药物的方法、系统及设备,在胶质瘤预后判断和新药筛选方面具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN119132417A
公开(公告)日:2024-12-13
申请号:CN202411123472.6
申请日:2024-08-15
Applicant: 康美华大基因技术有限公司
Abstract: 本发明提供了一种表达数据的预处理方法、装置、系统及存储介质,涉及时空组学技术领域。所述表达数据的预处理方法包括:获取基于时空组技术的测序数据,并根据测序数据得到基因表达矩阵;进行降维处理得到细胞族群;确定细胞族群之间的差异基因列表,并构建得到基因集表达矩阵;将基因集表达矩阵转换为贡献度,并构建得到基因贡献度矩阵。本发明运用细胞分群与基因筛选技术,精准转换基因集表达矩阵,显著实现矩阵降维,使相似特征基因集更加聚合,尽可能保留下一些潜在的有价值的特征,既提升了分析精确度,又优化了计算资源使用效率,为科研工作者提供更为信赖且高效的研究途径。
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公开(公告)号:CN119007808A
公开(公告)日:2024-11-22
申请号:CN202411099239.9
申请日:2024-08-12
Applicant: 中国农业大学
Abstract: 本发明公开了比较牛的膜辅因子蛋白基因表达水平的计算机装置、方法和计算机可读存储介质。本发明鉴定到一个荷斯坦牛16号染色体上的短串联重复序列(TAAAA)n,会显著影响牛的膜辅因子蛋白CD46基因的表达。不同eSTR基因型的个体CD46基因的表达量有较大差异。同时由于CD46基因的高表达通常与荷斯坦牛更强的抗病力相关联。因此,本发明通过该eSTR的基因型比较CD46基因的表达水平,可应用于制备鉴定或检测高表达奶牛的产品和荷斯坦牛育种和品质改良。
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公开(公告)号:CN118858636A
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202411345751.7
申请日:2024-09-26
Applicant: 上海晟燃生物科技有限公司
IPC: G01N33/574 , G16B40/00 , G16B35/00 , G16H50/20
Abstract: 本发明公开了一种基于外泌体蛋白标志物的食管癌早期筛查系统和试剂盒,具体而言,涉及医学诊断技术领域。本发明提供的系统包括信息获取模块,以及可选的计算模块和/或诊断模块,该系统首次将多个蛋白标志物组合如LAMP2、NCSTN、CTSB、TM9SF1、TFRC、MMP14、TGM1、KRT4和VCL,用于食管癌早期筛查,具有很高的诊断灵敏度与特异性。
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