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公开(公告)号：CN119570945A
公开(公告)日：2025-03-07
申请号：CN202411794755.3
申请日：2024-12-09
Applicant: 中国农业大学 , 中国科学院遗传与发育生物学研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一个与鸡体重相关的SNP分子标记及其应用，属于分子生物学领域，通过对深度杂交系群体进行基因组测序，并进行GWAS分析，发现了一个与6周龄和8周龄显著相关的是SNP位点chrI:170405727,该位点的C在高体重鸡中为优势等位基因。使用SMR方法对GWAS和eQTL进行整合，发现该SNP位点远端调控ESD基因。该位点存在3种基因型，其中CC基因型的ESD基因在肌肉组织表达更高。对于这个位点，在高体重和低体重的鸡种进行SNP频率分析发现存在显著差异，CC基因型为高体重的优势基因型，TT基因型为低体重的优势基因型。因此，可以优选该位点为CC基因型的鸡，有望进行高体重鸡的早期选择，从而加快鸡的遗传育种。
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公开(公告)号：CN119399569A
公开(公告)日：2025-02-07
申请号：CN202411250988.7
申请日：2024-09-06
Applicant: 中国农业大学
IPC: G06V10/766 , G06V10/26 , G06V10/52 , G06V10/44 , G06V10/80 , G06V10/82 , G06N3/0464
Abstract: 本发明提供一种基于深度学习和灰度值定标的鸡睾丸重量预测方法及装置，所述方法包括：对待测公鸡进行CT扫描，得到包含完整睾丸轮廓的所述待测公鸡的CT图像；获取鸡睾丸的灰度分布直方图曲线，将所述CT图像按照所述鸡睾丸的灰度分布直方图曲线进行预分割，得到所述CT图像的预分割结果；将所述CT图像的预分割结果输入语义分割模型，得到所述语义分割模型输出的所述CT图像的语义分割结果；将所述CT图像的语义分割结果输入重量预测模型，得到所述重量预测模型输出的所述待测公鸡睾丸的重量预测结果，其中，所述重量预测模型是基于样本睾丸的灰度分布直方图曲线及所述样本睾丸的实际重量训练得到的。本发明基于CT图像对鸡睾丸进行图像分割、修正和重量预测，利用睾丸重构后不同切面的二维图像，结合灰度值标准，并和屠宰真值进行联合分析，从而实现睾丸重量活体测定。
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公开(公告)号：CN118735833A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202310305297.1
申请日：2023-03-27
Applicant: 中国农业大学 , 温氏食品集团股份有限公司
IPC: G06T7/00 , G06T7/10 , G06T3/4038 , G06T17/00
Abstract: 本发明涉及图像处理技术领域，提供一种脂肪量的确定方法、装置、电子设备和存储介质，该方法包括：采集目标对象的CT图像；将CT图像输入至注意力分割模型，以获取注意力分割模型输出的CT图像的第一分割图像；注意力分割模型是采用第一训练样本对预先构建的第一模型进行训练后得到的；确定第一分割图像的脂肪占比，将脂肪占比输入至脂肪预测模型，以获取脂肪预测模型输出的目标对象的脂肪量；脂肪预测模型是采用第二训练样本对预先构建的第二模型进行训练后得到的。本发明通过建立模型，对目标对象的CT图像进行分割和脂肪量测量，解决了传统脂肪测量方法精度低的问题，提高了测量精度，减少了测量成本。
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公开(公告)号：CN118621027A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410839737.6
申请日：2024-06-26
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与鸡屠体重相关的SNP分子标记及其应用。本发明公开了一个与鸡屠体重相关的SNP位点，该位点位于NCAPG基因内含子区，基因组位置为GRCg6a版本基因组4号染色体第75889919位核苷酸。该SNP标记存在3种基因型，G/G、A/A和G/A，其中G/G对应较高的屠体重。在高体重鸡中，G为优势等位基因，通过优选该SNP位点的G/G基因型，对鸡屠体性状进行早期选择，可以加快鸡的遗传育种。
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公开(公告)号：CN117334250A
公开(公告)日：2024-01-02
申请号：CN202210722057.7
申请日：2022-06-24
Applicant: 中国农业大学
Abstract: 本发明涉及一种基于测序数据优选功能位点的方法，具体步骤为：1.通过基因组测序得到全部样本的SNP位点，在全部样本中随机挑选出若干样本作为发现群体，提取生物学先验信息；2.根据步骤1获得的生物学先验信息划定基因组重要区域；3.全基因组进行划框连锁不平衡过滤，在重要区域内降低LD过滤的阈值或者不进行过滤，提升重要区域的标记密度，最终筛选出性状特异性标记集合。本发明在进行育种值估计之前，首先进行选择性连锁不平衡位点筛选可以增加位点的信噪比，提升预测准确性。此外降低位点数目可以大幅度降低计算资源和时间的消耗，提升育种效率。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117316279A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202210732396.3
申请日：2022-06-24
Applicant: 中国农业大学
IPC: G16B30/00 , G16B20/30 , C12Q1/6809
Abstract: 本发明涉及一种基于定向基因组测序获取全基因组SNP位点的方法。本发明所述方法建立了一种分析定向基因组测序数据多态位点的新流程，该方法避免了原有定向基因组测序流程中对测序深度敏感、分型准确度有限等不利因素，在低成本的基础上，可以更准确地得到分布于全基因组的、更高密度的SNP信息。
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公开(公告)号：CN117286254A
公开(公告)日：2023-12-26
申请号：CN202310322848.5
申请日：2023-03-29
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , G16B30/10 , G16B20/20 , G16B20/30
Abstract: 本发明涉及一种鸡开产日龄性状育种15K SNP测序分型芯片及应用。本发明利用大规模低深度全基因组重测序技术得到的遗传标记特异性筛选与鸡开产日龄相关的功能标记信息，极大剔除了测序数据信息中的噪音位点，同时保留与开产日龄相关的功能位点，最终形成一种应用于鸡开产日龄性状育种的15K SNP测序分型芯片，降低分型成本的同时，极大地提升了开产日龄性状的育种准确性。
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公开(公告)号：CN115287368A
公开(公告)日：2022-11-04
申请号：CN202210732593.5
申请日：2022-06-24
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , G16B20/20 , G16B20/40 , G16B30/10 , G16B40/00
Abstract: 本发明涉及一种鸡屠体重性状育种17K SNP测序分型芯片及应用。本发明技术区别于传统的固相芯片和基于测序的“液相芯片”原理，利用大规模低深度全基因组重测序技术得到的遗传标记特异性筛选与鸡屠体重相关的功能标记信息，极大剔除了测序数据信息中的噪音位点，同时保留与屠体重相关的功能位点，最终形成一种应用于鸡屠体重性状育种的17K SNP测序分型芯片，降低分型成本的同时，极大地提升了屠体重性状的育种准确性。
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公开(公告)号：CN115287364A
公开(公告)日：2022-11-04
申请号：CN202210732402.5
申请日：2022-06-24
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , G16B20/20 , G16B20/30 , G16B40/00
Abstract: 本发明涉及一种猪达百公斤体重日龄性状育种17K SNP测序分型芯片。本发明利用大规模低深度全基因组重测序技术得到的遗传标记特异性筛选与猪达百公斤体重日龄性状相关的功能标记信息，极大剔除了测序数据信息中的噪音位点，同时保留与猪达百公斤体重日龄性状体重相关的功能位点，最终形成一种应用于猪达百公斤体重日龄性状育种的17K SNP测序分型芯片，降低分型成本的同时，极大地提升了猪达百公斤体重日龄性状的育种准确性。
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公开(公告)号：CN113470744A
公开(公告)日：2021-10-01
申请号：CN202110624464.X
申请日：2021-06-04
Applicant: 中国农业大学
IPC: G16B20/20
Abstract: 本发明涉及基于SNP位点数据的系谱推断方法、装置、电子设备及存储介质，该方法包括：获取待构建基因组系谱的育种群体及所述育种群体中每个个体的SNP数据；在所述育种群体中，基于每个目标子代样本与候选亲本的SNP数据，使用亲子鉴定方法，确定每个目标子代样本的目标亲本，从而推断出所述育种群体的基因组系谱。本发明通过使用SNP数据进行亲子鉴定，能够推断出育种群体的基因组系谱，从而得到育种群体的高质量的系谱记录。
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