筛选MicroRNAs在褐飞虱对水稻抗性适应性作用的方法

    公开(公告)号:CN108504748B

    公开(公告)日:2019-09-03

    申请号:CN201810332911.2

    申请日:2018-04-13

    Abstract: 本发明公开了一种筛选MicroRNAs在褐飞虱对水稻抗性适应性作用的方法,涉及生物工程技术。本方法包括下列步骤:①样品的收集;②小RNA的测序;③测序原始数据的预处理;④序列比对;⑤新miRNA预测;⑥miRNA差异表达分析;⑦差异miRNA靶基因预测;⑧miRNA mimic、miRNA inhibitor及对照链的合成;⑨向褐飞虱显微注射和人工喂养miRNA mimic、miRNA inhibitor,验证miRNAs的功能;⑩显微注射和人工喂养后的褐飞虱对水稻抗性适应性变化的初步研究。本发明研究利用高通量测序技术对两个褐飞虱群体的小RNA进行了深度测序,并通过后续的生物信息学分析鉴定并预测miRNAs,比较在感虫水稻TN1和抗虫水稻YHY15上两个褐飞虱群体间的差异,分析、筛选和发现与寄主抗性适应性相关的miRNA,为水稻抗虫育种提供新的方法。

    水稻抗稻瘟病基因Pita特异性分子标记引物及应用

    公开(公告)号:CN105907884B

    公开(公告)日:2019-06-21

    申请号:CN201610517576.4

    申请日:2016-07-04

    Abstract: 本发明公开了水稻抗稻瘟病基因Pita特异性分子标记引物及应用。申请人通过将携带不同Pita等位基因的水稻品种测序及序列比对在Pita编码区内含子鉴定到一个Pita特异性位点并开发了一套鉴定该目标位点的分子标记引物,分别为:SF:GCAGGTTATAAGCTAGCTAT;SR:GCCAAATAGCCAATTCATA;RF:CAAGAGAGAGTATTTGCTTAGGAGT;RR:CCTATATCTCTTTAAAATATGTTTGGC。利用该引物对水稻种质资源DNA进行PCR扩增,可快速判断待测试水稻Pita的基因型,从而将携带抗性等位基因的材料应用于生产。方法简便快速、成本低廉,可广泛应用于分子标记辅助选择育种或者水稻种质资源Pita基因型鉴定。

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