METHODS AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL INSTRUMENT CALIBRATION
    1.
    发明申请
    METHODS AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL INSTRUMENT CALIBRATION 审中-公开
    生物仪器校准的方法和系统

    公开(公告)号:WO2016127124A3

    公开(公告)日:2016-09-29

    申请号:PCT/US2016016882

    申请日:2016-02-05

    Abstract: In one exemplary embodiment, a method (100) for calibrating an instrument is provided. The instrument includes an optical system capable of imaging florescence emission from a plurality of reaction sites. The method includes performing a region-of-interest (ROI) calibration (102) to determine reaction site positions in an image. The method further includes performing a pure dye calibration (108) to determine the contribution of a fluorescent dye used in each reaction site by comparing a raw spectrum of the fluorescent dye to a pure spectrum calibration data of the fluorescent dye. The method further includes performing an instrument normalization calibration (110) to determine a filter normalization factor. The method includes performing an RNase P validation (112) to validate the instrument is capable of distinguishing between two different quantities of sample.

    Abstract translation: 在一个示例性实施例中,提供了一种用于校准仪器的方法(100)。 该仪器包括能够成像来自多个反应位点的荧光发射的光学系统。 该方法包括执行感兴趣区域(ROI)校准(102)以确定图像中的反应位置位置。 该方法还包括通过将荧光染料的原始光谱与荧光染料的纯光谱校准数据进行比较来执行纯染料校准(108)以确定在每个反应位点中使用的荧光染料的贡献。 该方法还包括执行仪器归一化校准(110)以确定滤波器归一化因子。 该方法包括执行RNase P验证(112)以验证仪器能够区分两种不同数量的样品。

    СИСТЕМЫ И СПОСОБЫ ДЛЯ БИОЛОГИЧЕСКОГО АНАЛИЗА

    公开(公告)号:RU2702577C2

    公开(公告)日:2019-10-08

    申请号:RU2017131209

    申请日:2016-02-05

    Abstract: Изобретениев целомкасаетсясистем, устройстви способовнаблюдения, испытанияи/илианализаодногоилинесколькихбиологическихпроб. Системадлябиологическогоанализа, содержащая: узелблокапробоподготовки, которыйсодержитблокпробоподготовки, выполненныйс возможностьювмещениядержателяпроб, причемдержательпробвыполненс возможностьюприемамножествапроб; системууправления, выполненнуюс возможностьюциклированиямножествапробпорядутемператур; иавтоматизированныйлоток, содержащийподвижныйузел, причемлотоквыполненс возможностьюреверсивногоскользящегоперемещенияузлаблокапробоподготовкииззакрытойв открытуюпозициюдляобеспечениядоступапользователякомножествудержателейпроб; лотокилиузелблокапробоподготовкидополнительносодержитпластинку, выполненнуюс возможностьюблокированиясвета, излучаемогоотпозиционногодатчика. Техническийрезультат– повышениеэффективностианализабиологическихпроб. 3 н. и 15 з.п. ф-лы.

    SYSTEM AND METHODS FOR CALIBRATING BINDING DYES

    公开(公告)号:SG11201706352QA

    公开(公告)日:2017-09-28

    申请号:SG11201706352Q

    申请日:2016-02-05

    Abstract: Some embodiments describe a computer-implemented method for calibrating a fluorescent dye. The method can comprise imaging a sample holder, loaded into an instrument, at more than one channel. The sample holder can comprise a plurality of reaction sites and more than one dye type, with each dye occupying more than one reaction site. The method can further comprise identifying a peak channel for each dye on the sample holder, normalizing each channel to the peak channel for each dye, and producing a dye matrix that can comprise a set of dye reference values.

    METHODS AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL INSTRUMENT CALIBRATION

    公开(公告)号:SG11201706332RA

    公开(公告)日:2017-09-28

    申请号:SG11201706332R

    申请日:2016-02-05

    Abstract: In one exemplary embodiment, a method for calibrating an instrument is provided. The instrument includes an optical system capable of imaging fluorescence emission from a plurality of reaction sites. The method includes performing a region-of-interest (ROI) calibration to determine reaction site positions in an image. The method further includes performing a pure dye calibration to determine the contribution of a fluorescent dye used in each reaction site by comparing a raw spectrum of the fluorescent dye to a pure spectrum calibration data of the fluorescent dye. The method further includes performing an instrument normalization calibration to determine a filter normalization factor. The method includes performing an RNase P validation to validate the instrument is capable of distinguishing between two different quantities of sample.

    IMAGE DRIVEN QUALITY CONTROL FOR ARRAY BASED PCR

    公开(公告)号:SG11202101612SA

    公开(公告)日:2021-03-30

    申请号:SG11202101612S

    申请日:2019-08-29

    Abstract: A system and methods are provided for image driven quality control for array based PCR. The system comprises a PCR unit, a reaction array plate, a convolutional neural network (CNN) configured to receive a sequence of images of the reaction array plate in the PCR system, and an output of the CNN coupled to a control for the reaction array plate. The method comprises applying a sequence of images from a plurality of subarrays of the reaction array plate to a plurality of CNNs during operation of the PCR system on the reaction plate array, operating the CNNs to generate failure mode predictions for the reaction plate based on the sequence of images, and coupling an output of the CNNs to one or more of a setting for manufacture of the reaction array plate or to control the PCR system.

    СПОСОБЫ И СИСТЕМЫ ДЛЯ КАЛИБРОВКИ БИОЛОГИЧЕСКОГО ПРИБОРА

    公开(公告)号:RU2716171C2

    公开(公告)日:2020-03-06

    申请号:RU2017131046

    申请日:2016-02-05

    Abstract: Группаизобретенийотноситсяк областиизмерительнойтехники. Способдлякалибровкиприбора, включающегов себяоптическуюсистемус возможностьювизуализациифлуоресцентногоизлученияотмножествареакционныхучастков, такихкаклункидержателяпроб, включает: проведениекалибровкиобластиинтереса (ОИ) дляопределенияпозицийреакционныхучастковнаизображении, причемкалибровкаОИуменьшаетошибкиопределенияреакционныхучастковпутемминимизациипоменьшеймереодногофактораизследующейгруппы: насыщениекрасителявомножествереакционныхучастков, вращениесетки, вариациякоэффициентовусиленияи оптическаярадиальнаядисторсия; проведениекалибровкичистогокрасителядляопределениявкладафлуоресцентногокрасителя, применяемогов каждомреакционномучастке, путемсравненияисходногоспектрафлуоресцентногокрасителяс калибровочнымиданнымичистогоспектрафлуоресцентногокрасителя, приэтомреакционныеучасткисодержатодинаковыеконцентрациикрасителя, чтобыобеспечитьполучениечистыхспектральныхзначенийдлякаждойлункидержателяпроб, адержательпробпредставляетсобойкалибровочныйпланшетс шахматнойконфигурацией; проведениекалибровкинормализацииприборадляопределениякоэффициентанормализациидляфильтра; ипроведениевалидациис помощьюРНКазыР длявалидациивозможностиприбораразличатьдваразныхколичестваоднойпробы. Техническийрезультатзаключаетсяв обеспеченииустойчивостик принятиюсубоптимальныхкалибровок, улучшенииобъективностии единообразиявовремяосуществлениятакойдеятельности. 4 н. и 35 з.п. ф-лы, 23 ил., 1 табл.

    METHODS AND SYSTEMS FOR DETERMINING OPTICAL REGIONS OF INTEREST

    公开(公告)号:SG11201706329WA

    公开(公告)日:2017-09-28

    申请号:SG11201706329W

    申请日:2016-02-05

    Inventor: CHU YONG

    Abstract: The present teachings relate to a method and system for determining Regions of Interest (ROI) for one or more biological samples in a laboratory instrument. The method can include an optical system capable of imaging florescence emission from a plurality of sample wells. An initial ROI, its center location and size can be estimated from the fluorescence detected from each well. From this information the average size of the ROIs can be determined and global gridding models can be derived to better locate each of the ROIs. The global gridding models can then be applied to the ROIs to improve the precision of the ROI center locations. Sample wells not originally providing fluorescence ROIs can be recovered through the use of mapping functions. The radius of each ROI can then be adjusted to improve the signal-to-noise ratio of the optical system.

Patent Agency Ranking