METHODS AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL INSTRUMENT CALIBRATION
    1.
    发明申请
    METHODS AND SYSTEMS FOR BIOLOGICAL INSTRUMENT CALIBRATION 审中-公开
    生物仪器校准的方法和系统

    公开(公告)号:WO2016127124A3

    公开(公告)日:2016-09-29

    申请号:PCT/US2016016882

    申请日:2016-02-05

    Abstract: In one exemplary embodiment, a method (100) for calibrating an instrument is provided. The instrument includes an optical system capable of imaging florescence emission from a plurality of reaction sites. The method includes performing a region-of-interest (ROI) calibration (102) to determine reaction site positions in an image. The method further includes performing a pure dye calibration (108) to determine the contribution of a fluorescent dye used in each reaction site by comparing a raw spectrum of the fluorescent dye to a pure spectrum calibration data of the fluorescent dye. The method further includes performing an instrument normalization calibration (110) to determine a filter normalization factor. The method includes performing an RNase P validation (112) to validate the instrument is capable of distinguishing between two different quantities of sample.

    Abstract translation: 在一个示例性实施例中,提供了一种用于校准仪器的方法(100)。 该仪器包括能够成像来自多个反应位点的荧光发射的光学系统。 该方法包括执行感兴趣区域(ROI)校准(102)以确定图像中的反应位置位置。 该方法还包括通过将荧光染料的原始光谱与荧光染料的纯光谱校准数据进行比较来执行纯染料校准(108)以确定在每个反应位点中使用的荧光染料的贡献。 该方法还包括执行仪器归一化校准(110)以确定滤波器归一化因子。 该方法包括执行RNase P验证(112)以验证仪器能够区分两种不同数量的样品。

    METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING AN AMPLIFICATION QUALITY METRIC
    2.
    发明申请
    METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING AN AMPLIFICATION QUALITY METRIC 审中-公开
    用于确定放大质量公差的方法和系统

    公开(公告)号:WO2013074204A2

    公开(公告)日:2013-05-23

    申请号:PCT/US2012057707

    申请日:2012-09-28

    CPC classification number: C12Q1/6851 G06F19/24

    Abstract: According to one exemplary embodiment, a method for providing a amplification quality metric to a user is provided. The method includes receiving amplification data from an amplification of a sample to generate an amplification curve. The amplification curve includes an exponential region and a transition region. The method further includes determining a first value of the transition region and determining a second value of the transition region. The first value is the beginning of the transition region and the second value is the end of the transition region. Next, the amplification quality metric is calculated based on at least the first value and the second value. Then, the amplification quality metric is displayed to the user.

    Abstract translation: 根据一个示例性实施例,提供了一种用于向用户提供放大质量度量的方法。 该方法包括从样品的扩增接收扩增数据以产生扩增曲线。 扩增曲线包括指数区域和过渡区域。 该方法还包括确定过渡区域的第一值并确定过渡区域的第二值。 第一个值是过渡区域的开始,第二个值是过渡区域的结束。 接下来,基于至少第一值和第二值来计算放大质量度量。 然后,向用户显示放大质量度量。

    METHODS AND SYSTEMS FOR A DIGITAL PCR EXPERIMENT DESIGNER

    公开(公告)号:SG11201502797PA

    公开(公告)日:2015-05-28

    申请号:SG11201502797P

    申请日:2013-09-13

    Abstract: A computer-implemented method for designing a digital PCR (dPCR) experiment is provided. The method includes receiving, from a user, a selection of optimization type. The optimization type may be maximizing the dynamic range, minimizing the number of substrates including reaction sites needed for the experiment, determining a dilution factor, or determining the lower limit of detection, for example. The method further includes receiving, from the user, a precision measure for an experiment, and a minimum concentration of a target in a reaction site for the experiment. The method also includes determining a set of dPCR experiment design factors for the experiment based on the optimization type. The set of dPCR experiment design factors is then displayed to the user.

    СПОСОБЫ И СИСТЕМЫ ДЛЯ КАЛИБРОВКИ БИОЛОГИЧЕСКОГО ПРИБОРА

    公开(公告)号:RU2716171C2

    公开(公告)日:2020-03-06

    申请号:RU2017131046

    申请日:2016-02-05

    Abstract: Группаизобретенийотноситсяк областиизмерительнойтехники. Способдлякалибровкиприбора, включающегов себяоптическуюсистемус возможностьювизуализациифлуоресцентногоизлученияотмножествареакционныхучастков, такихкаклункидержателяпроб, включает: проведениекалибровкиобластиинтереса (ОИ) дляопределенияпозицийреакционныхучастковнаизображении, причемкалибровкаОИуменьшаетошибкиопределенияреакционныхучастковпутемминимизациипоменьшеймереодногофактораизследующейгруппы: насыщениекрасителявомножествереакционныхучастков, вращениесетки, вариациякоэффициентовусиленияи оптическаярадиальнаядисторсия; проведениекалибровкичистогокрасителядляопределениявкладафлуоресцентногокрасителя, применяемогов каждомреакционномучастке, путемсравненияисходногоспектрафлуоресцентногокрасителяс калибровочнымиданнымичистогоспектрафлуоресцентногокрасителя, приэтомреакционныеучасткисодержатодинаковыеконцентрациикрасителя, чтобыобеспечитьполучениечистыхспектральныхзначенийдлякаждойлункидержателяпроб, адержательпробпредставляетсобойкалибровочныйпланшетс шахматнойконфигурацией; проведениекалибровкинормализацииприборадляопределениякоэффициентанормализациидляфильтра; ипроведениевалидациис помощьюРНКазыР длявалидациивозможностиприбораразличатьдваразныхколичестваоднойпробы. Техническийрезультатзаключаетсяв обеспеченииустойчивостик принятиюсубоптимальныхкалибровок, улучшенииобъективностии единообразиявовремяосуществлениятакойдеятельности. 4 н. и 35 з.п. ф-лы, 23 ил., 1 табл.

    METHODS AND SYSTEMS FOR INSTRUMENT VALIDATION

    公开(公告)号:SG11201706250VA

    公开(公告)日:2017-08-30

    申请号:SG11201706250V

    申请日:2016-02-05

    Abstract: In one exemplary embodiment, a method for validating an instrument is provided. The method includes receiving amplification data from a validation plate to generate a plurality of amplification curves. The validation plate includes a sample of a first quantity and a second quantity, and each amplification curve includes an exponential region. The method further includes determining a set of fluorescence thresholds based on the exponential regions of the plurality of amplification curves and determining, for each fluorescence threshold of the set, a first set of cycle threshold (Ct) values of amplification curves generated from the samples of the first quantity and a second set of Ct values of amplification curves generated from the samples of the second quantity. The method includes calculating if the first and second quantities are sufficiently distinguishable based on Ct values at each of the plurality of fluorescence thresholds.

    Methods and systems for a digital PCR experiment designer

    公开(公告)号:AU2013315167A1

    公开(公告)日:2015-04-30

    申请号:AU2013315167

    申请日:2013-09-13

    Abstract: A computer-implemented method for designing a digital PCR (dPCR) experiment is provided. The method includes receiving, from a user, a selection of optimization type. The optimization type may be maximizing the dynamic range, minimizing the number of substrates including reaction sites needed for the experiment, determining a dilution factor, or determining the lower limit of detection, for example. The method further includes receiving, from the user, a precision measure for an experiment, and a minimum concentration of a target in a reaction site for the experiment. The method also includes determining a set of dPCR experiment design factors for the experiment based on the optimization type. The set of dPCR experiment design factors is then displayed to the user.

    СИСТЕМЫ И СПОСОБЫ ДЛЯ БИОЛОГИЧЕСКОГО АНАЛИЗА

    公开(公告)号:RU2702577C2

    公开(公告)日:2019-10-08

    申请号:RU2017131209

    申请日:2016-02-05

    Abstract: Изобретениев целомкасаетсясистем, устройстви способовнаблюдения, испытанияи/илианализаодногоилинесколькихбиологическихпроб. Системадлябиологическогоанализа, содержащая: узелблокапробоподготовки, которыйсодержитблокпробоподготовки, выполненныйс возможностьювмещениядержателяпроб, причемдержательпробвыполненс возможностьюприемамножествапроб; системууправления, выполненнуюс возможностьюциклированиямножествапробпорядутемператур; иавтоматизированныйлоток, содержащийподвижныйузел, причемлотоквыполненс возможностьюреверсивногоскользящегоперемещенияузлаблокапробоподготовкииззакрытойв открытуюпозициюдляобеспечениядоступапользователякомножествудержателейпроб; лотокилиузелблокапробоподготовкидополнительносодержитпластинку, выполненнуюс возможностьюблокированиясвета, излучаемогоотпозиционногодатчика. Техническийрезультат– повышениеэффективностианализабиологическихпроб. 3 н. и 15 з.п. ф-лы.

Patent Agency Ranking