一种检测基因编辑效率和基因编辑模式的方法及其应用

    公开(公告)号:CN112322714A

    公开(公告)日:2021-02-05

    申请号:CN202011218400.1

    申请日:2020-11-04

    Abstract: 本发明涉及一种检测基因编辑效率和基因编辑模式的方法及其应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:S1,提取样本基因组DNA,对待测区设计引物并扩增;S2,构建文库进行高通量测序,并对数据进行过滤、拆分和拼接,得到待测区序列;S3,将待测区序列与基因组参考序列比对,得到每个样本的基因编辑效率和模式;S4,对处理组样本和对照组样本的基因编辑效率作显著性分析并输出校正后结果。与现有技术相比,本发明简化了基因文库构建过程,加快了数据分析处理的速度,提高了基因编辑效率检测的经济性、敏感性、特异性和准确性,也提供了对基因编辑模式的多维度评估。

    一种与宿主鸡白痢沙门氏菌抗性性状相关的MYH7基因及其SNP分子标记与应用

    公开(公告)号:CN119932201A

    公开(公告)日:2025-05-06

    申请号:CN202510042693.9

    申请日:2025-01-10

    Abstract: 本发明涉及一种与宿主鸡白痢沙门氏菌抗性性状相关的MYH7基因及其SNP分子标记与应用,MYH7基因及其SNP分子标记在选育或辅助选育对鸡白痢沙门氏菌抗性高的鸡品种中的应用,MYH7基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,MYH7基因SNP分子标记位于鸡的19号染色体MYH7基因的内含子区域,于19号染色体5853bp位点,多态性为T或G;当MYH7基因SNP分子标记处的碱基为T时,对应于鸡对鸡白痢沙门氏菌抗性高;当MYH7基因SNP分子标记处的碱基为G时,对应于鸡对鸡白痢沙门氏菌抗性低。利用本发明提供的MYH7基因及其SNP分子标记,可快速且有效地筛选选育出鸡白痢沙门氏菌高抗性的鸡品种。

    一种基于SSR和扩增子测序的双峰驼亲子鉴定方法

    公开(公告)号:CN117947172A

    公开(公告)日:2024-04-30

    申请号:CN202211348215.3

    申请日:2022-10-31

    Abstract: 本发明涉及一种骆驼SSR分子标记及其应用,属于基因检测技术领域。该引物用于骆驼遗传多样性检测与亲缘关系分析,包括如下步骤(1)通过骆驼全基因组序列分析,得到249,615个可能的SSR分子标记;通过高通量测序分析得到37,799个可能的SSR分子标记;在其中选择一系列高置信度骆驼SSR引物;(2)对待测骆驼采集其耳样并提取基因组DNA;(3)根据上述筛选得到的SSR引物,针对上述骆驼个体基因组DNA进行PCR扩增。(4)将上述所有PCR产物混合后纯化得到扩增子文库,之后对其进行Novaseq高通量测序,并对下机数据使用AdapterRemoval进行拆分,得到待测区序列;(5)使用MISA分析上述待测区序列,得到骆驼个体SSR模体序列及其重复数(遗传多样性)。

    一种与宿主鸡白痢沙门氏菌抗性性状相关的CNTN5基因及其SNP分子标记与应用

    公开(公告)号:CN119876412A

    公开(公告)日:2025-04-25

    申请号:CN202510042694.3

    申请日:2025-01-10

    Abstract: 本发明涉及一种与宿主鸡白痢沙门氏菌抗性性状相关的CNTN5基因及其SNP分子标记与应用,CNTN5基因及其SNP分子标记用于选育或辅助选育对鸡白痢沙门氏菌抗性高的鸡品种,CNTN5基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,CNTN5基因SNP分子标记位于鸡的1号染色体CNTN5基因的内含子区域,于1号染色体185063016bp位点,多态性为T或C;CNTN5基因SNP分子标记处的碱基为T时,为鸡对鸡白痢沙门氏菌抗性高;CNTN5基因SNP分子标记处的碱基为C时,为鸡对鸡白痢沙门氏菌抗性低。利用本发明提供的CNTN5基因及SNP分子标记,可快速有效地筛选选育出鸡白痢沙门氏菌高抗性的鸡品种。

    双峰驼乳脂率相关基因CARD11及其作为分子标记的应用

    公开(公告)号:CN116083600A

    公开(公告)日:2023-05-09

    申请号:CN202211698725.3

    申请日:2022-12-28

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,尤其是涉及双峰驼乳脂率相关基因CARD11及其作为分子标记的应用。本发明公开了与双峰驼产奶性状相关的基因CARD11,以及利用其单核苷酸多态性位点(SNP)作为分子标记进行辅助选择的育种方法与应用。本发明首次研究发现了CARD11基因与双峰驼泌乳性状中乳脂率高/低相关的位点,为选育具有优良性状的双峰驼品种,改善驼奶乳品质提供候选基因。本发明利用二代测序技术对162头双峰驼进行基因组重测序,通过与骆驼乳脂率性状进行全基因组关联分析,鉴定出CARD11基因中与双峰驼乳脂率相关的分子标记。该标记位于18号染色体9786961bp位点,发生C>T单碱基突变(g.9786961C>T),该突变位点可以提高驼奶的乳脂率,利用该标记能针对双峰驼的驼乳脂率性状开展分子标记辅助选择。

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